| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 1,867,449 | G→A | intergenic (‑205/‑137) | msrB ← / → gapA | peptide‑methionine (R)‑S‑oxide reductase MsrB/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,867,449 | 0 | G | A | 98.9% | 668.6 / NA | 189 | intergenic (‑205/‑137) | msrB/gapA | peptide‑methionine (R)‑S‑oxide reductase MsrB/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
TGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGGGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGAATA > NZ_CP025268/1867312‑1867584 | aaaTTTTGTCCTAGATTTGCTCGCGGCGAAACGGCTGCACCTAAATCGGGATGGAGATCACATTTTTATCGTAATTGCCCGTTAAAAGGCGGGGCGGCGACCCCATGGGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGagt < 2:1113039/140‑1 (MQ=255) aaaTTGCGTCGTAGACTTGTTCTGGACGACATGGCTGCAGCGAAATCGTGATGAAAATCCCATTTCTATCCTAATTGCCATTTAAAATTCGGGTCGCAGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCGAAGGAAGAGTGAGGCGagt < 2:3586640/140‑1 (MQ=255) ttttGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGagtcag < 2:5091945/140‑1 (MQ=255) ttttGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGAGGCGagtcag < 2:2633200/140‑1 (MQ=255) 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aGGAAGAGCGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGTCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAGGGTTTTTGTAATTTAACAGGCAACCGTTGATTCACTAACAAATAACtggt > 2:199195/1‑140 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtggtg < 2:26768/140‑1 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtggtg < 1:1993717/140‑1 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtggtg < 2:4891178/140‑1 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtggtg < 2:3094738/140‑1 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGAGTGAGTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTGGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCgggtg < 1:3731581/140‑1 (MQ=255) ggAAGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGAACAGCATTGATTTGTCGCAATTATTGACACGATTCCGCTTGTCGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCtggtg < 2:4058154/140‑1 (MQ=255) aaGAGTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGa < 2:340815/140‑1 (MQ=255) agagTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGaa < 1:3663072/140‑1 (MQ=255) gagTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGAat > 1:3679143/1‑140 (MQ=255) agTGAGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGAata < 1:3647555/140‑1 (MQ=255) | TGGCAAAATTTTGTCCTAAACTTGATCTCGACGAAATGGCTGCACCTAAATCGTGATGAAAATCACATTTTTATCGTAATTGCCCTTTAAAATTCGGGGCGCCGACCCCATGTGGTCTCAAGCCCAAAGGAAGAGTGGGGCGAGTCAGTCGCGTAATGCTTAGGCACAGGATTGATTTGTCGCAATGATTGACACGATTCCGCTTGACGCTGCGTAAGGTTTTTGTAATTTTACAGGCAACCTTTTATTCACTAACAAATAGCTGGTGGAATA > NZ_CP025268/1867312‑1867584 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |