| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,118,541 | T→C | *465* (TAA→TAG) | wcaM ← | colanic acid biosynthesis protein WcaM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,118,541 | 0 | T | C | 99.3% | 904.0 / NA | 274 | *465* (TAA→TAG) | wcaM | colanic acid biosynthesis protein WcaM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (150/121); minor base G (2/0); total (153/121) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
TTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATTTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGACAGCAGTGTTTCT > NZ_CP025268/2118405‑2118676 | ttGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTAc < 1:620949/140‑1 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACt > 1:3600095/1‑140 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACt > 1:3862530/1‑140 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACt > 2:2685211/1‑140 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATATTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACt > 2:825145/1‑140 (MQ=255) ttCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTATCCTGAATTGATTACTGAATTACTTTTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGTAATGGTCGCAAATCTACTcc > 1:2443150/1‑140 (MQ=255) ttCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTcc < 2:3600095/140‑1 (MQ=255) ttCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTcc > 1:4123826/1‑140 (MQ=255) ttCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTcc > 1:647984/1‑140 (MQ=255) ttCGAGCTTATTCGCCAGCATCAATTAACCTGACTTGATTATTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTAGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGCATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCtcctcc < 2:4476753/140‑1 (MQ=255) cGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCt < 1:4898530/140‑1 (MQ=255) cGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCt < 1:430516/140‑1 (MQ=255) cGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCt < 2:334531/140‑1 (MQ=255) tttttttCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACGGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTAGTGGATTGCATTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCat > 2:1193779/1‑139 (MQ=255) tCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGCATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCgg < 1:653755/140‑1 (MQ=255) tCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCgg < 1:3301656/140‑1 (MQ=255) cAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAAt < 2:1088469/140‑1 (MQ=255) aTCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTaa < 1:1486827/140‑1 (MQ=255) ttACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTa < 1:1630800/140‑1 (MQ=255) ttACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTa < 2:4123826/140‑1 (MQ=255) ccTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAAtct > 1:1861260/1‑140 (MQ=255) tGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAAtcttc < 1:2172112/140‑1 (MQ=255) tGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAAtcttc < 1:3170961/140‑1 (MQ=255) gAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAAtcttct < 1:2982904/140‑1 (MQ=255) aaTTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTtctc > 1:1290679/1‑140 (MQ=255) aaTTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTGCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAATTCTACTCCCTCAGTTCTGGTAATCTAAAGTTAAtcgtccc > 2:798998/1‑138 (MQ=255) tGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCcac > 2:1986114/1‑140 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt < 2:1794399/140‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt < 2:4782589/140‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt < 1:1420894/140‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt > 2:1863727/1‑140 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt > 2:4856599/1‑140 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTACAATAGCATTGTTCCTAAGTATGACTTCATTTTTCCAGGAATGGTCTCAAATCTACTCACTCAGTTCTGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt > 2:2413121/1‑140 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCCTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt < 1:2245099/140‑1 (MQ=255) ttACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAtt > 1:2763706/1‑140 (MQ=255) ttACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAtt < 1:2477144/140‑1 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACa > 2:4066489/1‑140 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACa < 1:2572088/140‑1 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACa > 1:454713/1‑140 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGGTACGCCGCTTCGTTTTGGATTGCATTAGCATTGTTCCTAAGTAGGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATGTACTCCCTCGGTGCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACa > 2:2579241/1‑140 (MQ=255) tGAACTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGGCGCAACTCTTCTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAACGTTAATCTTCTCCACATTAACa > 2:4695389/1‑140 (MQ=255) aTTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAata < 1:4696060/140‑1 (MQ=255) tACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATg < 2:2488140/140‑1 (MQ=255) tACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATg < 1:2637548/140‑1 (MQ=255) tACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATg < 1:888618/140‑1 (MQ=255) tACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATg > 2:4835570/1‑140 (MQ=255) cTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGt > 1:233521/1‑140 (MQ=255) cTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGt > 2:297547/1‑140 (MQ=255) gtgATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGAt < 1:3745502/140‑1 (MQ=255) gtcaTGTTACGCCCCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGAATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGAt < 2:1852976/137‑1 (MQ=255) gATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTaa < 1:3042636/126‑1 (MQ=255) gATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTa > 2:2245496/1‑140 (MQ=255) gATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTa < 1:2743870/140‑1 (MQ=255) tGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAAt < 2:4935536/140‑1 (MQ=255) tGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAAt < 2:919212/140‑1 (MQ=255) tACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCt > 2:1904921/1‑140 (MQ=255) gccgcTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTc < 1:1697673/140‑1 (MQ=255) cTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTtctc < 1:345222/106‑1 (MQ=255) cTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGata > 2:1266313/1‑140 (MQ=255) cTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGata > 2:1046324/1‑140 (MQ=255) cTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGata > 2:5058230/1‑140 (MQ=255) tCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATGTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGGTATc > 1:30855/1‑140 (MQ=255) tgGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGa > 1:4602781/1‑140 (MQ=255) gATTGCAGTAGCATTGTGCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGc > 2:175838/1‑140 (MQ=255) tGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACa < 1:3001869/103‑1 (MQ=255) tGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCttt > 1:5096641/1‑140 (MQ=255) gCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTg < 1:8068/140‑1 (MQ=255) cAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGt > 2:388287/1‑140 (MQ=255) cAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGt > 2:3425428/1‑140 (MQ=255) aGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTc < 1:2809263/140‑1 (MQ=255) tAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCt > 1:3675793/1‑140 (MQ=255) tAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTAATCCCTCAGTTCGGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCAACGGAGCTTTGTCCt > 2:3650572/1‑140 (MQ=255) ttGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttc > 2:1522729/1‑140 (MQ=255) ttCCTAATTATTACTCCATTTTTCGAGGAATGGTCGCAAATCTACACCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACGTTAACAATATGGTGATTAATTCTTTTGATATGGACGGTGCGGTGTCCGTTgtcatt > 2:3965315/1‑140 (MQ=255) ttCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAtt > 2:1694743/1‑86 (MQ=255) ttCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcatt > 1:153765/1‑140 (MQ=255) tCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcattc < 1:2306620/140‑1 (MQ=255) tAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCAcc > 2:866090/1‑140 (MQ=255) aGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGc > 1:1963391/1‑140 (MQ=255) gTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCa < 2:4277124/140‑1 (MQ=255) tATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCAt > 1:4408818/1‑140 (MQ=255) aTGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATg < 1:2855485/140‑1 (MQ=255) tGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAGCAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGa > 1:4503492/1‑140 (MQ=255) tGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCTACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGa > 2:3104659/1‑140 (MQ=255) tGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGa > 1:3863743/1‑140 (MQ=255) tGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGa > 2:641126/1‑140 (MQ=255) tGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGa > 2:3844540/1‑140 (MQ=255) tGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGa > 1:3356204/1‑140 (MQ=255) tCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCTGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTTTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACAt < 1:121764/140‑1 (MQ=255) cATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTAATCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTGAATCTTATCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACAttt > 2:2404444/1‑140 (MQ=255) aTTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCCATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAGCAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCCCCGCATGAACATTTg < 2:1360570/140‑1 (MQ=255) aTTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTg < 2:2561949/140‑1 (MQ=255) tttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGc > 2:3161020/1‑140 (MQ=255) tttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGc > 1:4770270/1‑140 (MQ=255) ttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCa < 2:1610054/140‑1 (MQ=255) tttgCCAGGAATTGTCGCAAACCTTCTCCCACAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTCCCCCACATTAACAATATGTTGATTAATCCTCTCGATATCGACGGAGCTTTCTCCTTTTTCATTCACCTCGTGACCATTTGcc < 2:4040187/140‑2 (MQ=255) cAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACCTTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAgaga < 1:4065318/140‑1 (MQ=255) cAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAgaga > 2:4645461/1‑140 (MQ=255) cAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAgaga < 2:3141/140‑1 (MQ=255) gTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGACAGCAgtg > 2:3033753/1‑140 (MQ=255) | TTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATTTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGACAGCAGTGTTTCT > NZ_CP025268/2118405‑2118676 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |