Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 2,418,734 | C→T | intergenic (+27/‑48) | ackA → / → pta | acetate kinase/phosphate acetyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 2,418,734 | 0 | C | T | 98.5% | 1379.5 / NA | 386 | intergenic (+27/‑48) | ackA/pta | acetate kinase/phosphate acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (113/267); minor base G (4/2); total (117/269) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.14e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 391 total aligned reads displayed.
CGTTTCGGCAAATCTGGTTTCATCAACAAAGAAGGTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGCGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGATCCGTGCAATGGAACGCAA > NZ_CP025268/2418597‑2418870 | gTTTCGGCAAATCTGGTTTCATCAACAAAGAAGGTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCt < 2:3003173/140‑1 (MQ=255) tttCGGCAAATCTGGTTTCATCAACAAAGAAGGTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTg > 2:950895/1‑140 (MQ=255) ttCGGCAAATCTGGTTTCATCAACAAAGAAGGTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGt > 1:3389260/1‑140 (MQ=255) gTTTCATCAACAAAGAAGGTACCCGTCCTGCGGTGGGTATTCCAACCAATGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCAGcc > 2:258028/1‑140 (MQ=255) acaaAGAAGGTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATcggcg < 1:3773757/140‑1 (MQ=255) acaaAGAAGGTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATcggcg < 1:3283057/140‑1 (MQ=255) caaAGAAGGTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATcggcgg > 2:5006098/1‑140 (MQ=255) caaAGAAGGTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATcggcgg < 1:3953559/140‑1 (MQ=255) ggTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGaa < 2:4331560/140‑1 (MQ=255) ggTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGCTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGaa > 1:1620523/1‑140 (MQ=255) gTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGaaa < 1:3217773/140‑1 (MQ=255) tACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTCACGAAag < 1:6980/140‑1 (MQ=255) tACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAag < 1:3669004/140‑1 (MQ=255) tACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAag < 1:26028/140‑1 (MQ=255) tACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTCACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAag < 2:4878623/140‑1 (MQ=255) aCCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAaga > 1:5013204/1‑140 (MQ=255) aCCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAaga > 1:1168682/1‑140 (MQ=255) aCCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAaga > 1:2263287/1‑140 (MQ=255) gTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGAt < 1:1487632/140‑1 (MQ=255) tCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAACTCGGCGGTAACGAAAGAGGATa > 2:2785311/1‑140 (MQ=255) cTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATaaa > 1:2051338/1‑140 (MQ=255) cTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATaaa < 1:3435819/140‑1 (MQ=255) gcgggtgtTAACCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAAcc < 2:2721307/134‑1 (MQ=255) gCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAAcc < 2:3489942/140‑1 (MQ=255) gCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAAcc < 2:3847577/140‑1 (MQ=255) gCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAAcc < 1:3000935/140‑1 (MQ=255) gtggtTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCgtg < 2:1519694/140‑1 (MQ=255) gtggtTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTGTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCgtg < 1:4609345/140‑1 (MQ=255) gtggtTACCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCCGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGTATAAACCgtg < 2:4180561/140‑1 (MQ=255) gtcgtTATCCCCACCAACGAACAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCgtg < 2:1229578/137‑1 (MQ=255) ggtTATCCCAACCATCTAAGAACTGGTTATCGCGCAATACGCGAGCCGCCTGACTGCCGGATTTCACCCCGCCAGCCCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCACATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTc < 2:1145004/140‑1 (MQ=255) ggtTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTc < 1:4268537/140‑1 (MQ=255) ggtTAGCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTc < 2:3576398/140‑1 (MQ=255) gtTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTcc > 2:3518066/1‑140 (MQ=255) ggtATGCCAACCAACGAAGGACTGGTTAGCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATGTCACACCGCCAGATCAGCTGGGGATGCTGTTTGGTAACGCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGATGCTAAACCgtgttc > 2:557760/3‑138 (MQ=255) tATCCCCCCCAACGAAGAACTGGTCATCGCCCACGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCCCAGCTGGCGCTGCTGTTTTGTAACCCGCCACCTCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCg < 2:422847/140‑1 (MQ=255) tATCCCAACCAACGAATAACGGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACTGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTATCCCGCCAAAGCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTccct < 2:1925092/140‑2 (MQ=255) tATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCg < 1:912043/140‑1 (MQ=255) tATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCg < 1:525936/140‑1 (MQ=255) tATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCg < 1:4763161/140‑1 (MQ=255) tATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCg < 1:19194/140‑1 (MQ=255) tATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCg < 1:1440676/140‑1 (MQ=255) tATCCCAACCAACGAACAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCg < 2:3613865/140‑1 (MQ=255) tATCCAAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGAAGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACCCCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCg < 2:2156398/140‑1 (MQ=255) tCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGta < 1:798283/140‑1 (MQ=255) caaccaacGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGtatta < 1:4930178/140‑1 (MQ=255) accaacGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGtattatt < 1:1198133/140‑1 (MQ=255) ccaacGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGtattatta > 1:1830055/1‑140 (MQ=255) ccaacGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGtattatta > 1:3647133/1‑140 (MQ=255) ccaacGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGtattatta > 1:2904052/1‑140 (MQ=255) ccaacGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGtattatta > 1:5048902/1‑140 (MQ=255) acGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATACACCGTGTCCCGTATTATTATGc < 1:2495455/140‑1 (MQ=255) cGAAGAACTGGTTATCGCGCACGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCt < 2:3393952/140‑1 (MQ=255) cGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATg < 2:658122/138‑1 (MQ=255) cGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCt < 1:4159458/140‑1 (MQ=255) gaagaaCTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTg < 1:1698547/140‑1 (MQ=255) gaagaaCTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTg > 1:3534933/1‑140 (MQ=255) gTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTAcc > 1:21215/1‑140 (MQ=255) cgcgCAAGCCGCGAGCCGCCTGACGGCCTGATCTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGGGCTGTTTTGTAACCAGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTTTTATGCTGATACCTACCGGaaa > 2:4016342/1‑139 (MQ=255) cgcgCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAAc > 1:4949766/1‑140 (MQ=255) cgcAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCa > 1:4346433/1‑140 (MQ=255) aacaCGCGAGCCGACTGACTCCCTCACTTCACCCCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGAGTTAACGCAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTACGCTGAGCCCTTCCGGTACCATCg < 2:4505571/137‑1 (MQ=255) aaGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCg > 1:2328573/1‑140 (MQ=255) aaGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCg < 1:1732542/140‑1 (MQ=255) aGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGCAATAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATGATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTg > 2:2894589/1‑140 (MQ=255) ccgccTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGAc < 2:1367061/140‑1 (MQ=255) ccgccTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGAc > 1:4442626/1‑140 (MQ=255) ccgccTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGAc < 2:3194057/140‑1 (MQ=255) ccgccTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGACAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGAc < 1:1670067/140‑1 (MQ=255) ccgccTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGGGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGAc > 2:887944/1‑140 (MQ=255) gACTGCCTGTTCTCCCACCGTCAGGGCAGCTAGTGGTGCTGTATTGTAACCCGCCAAATCGGGGGTAACGAAAGAGCATAAACCGTATTCCGTATTATTATGCTGATCCGTTCCGGAACCAGCGTCGGTCTAACCCGCGt < 2:1830483/140‑1 (MQ=255) gACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAATGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGt < 2:4700977/140‑1 (MQ=255) gACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGt < 1:2738762/140‑1 (MQ=255) ccTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGcc < 2:1168682/140‑1 (MQ=255) ccTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGcc < 2:3704813/140‑1 (MQ=255) ccTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGcc < 2:3210760/140‑1 (MQ=255) ccTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGcc < 1:1268223/140‑1 (MQ=255) ccTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGcc < 1:1359020/140‑1 (MQ=255) ccTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGcc > 1:3888912/1‑140 (MQ=255) ccTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGcc < 1:457459/140‑1 (MQ=255) ccTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGGTTTGTAACCGGCCAAAACAGCGGTAACGAAAGAGGAAGCGCCGTGTCCCGTATTATTATGCTGTTCGCTACCCGAACCAGCGTCGGACTGACCAGCGTCAGcc < 2:77956/140‑1 (MQ=255) tGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCtt > 1:1043096/1‑140 (MQ=255) tttCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAATAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGc < 2:2030083/140‑1 (MQ=255) tttCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGc < 1:1002244/140‑1 (MQ=255) cacaCCGCCAGCTCAGCTGGCGGTCCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTg < 2:1113169/140‑1 (MQ=255) ccccGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACAAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGAt < 1:2081421/138‑1 (MQ=255) cacCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGAt < 2:3333694/140‑1 (MQ=255) cacCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGAt < 2:719308/140‑1 (MQ=255) cacCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGAt < 2:2140/140‑1 (MQ=255) cacCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGCATAACCCGTGGCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGCTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGAt < 2:1022340/140‑1 (MQ=255) cacCGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTATTGTAACCCGCCCAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGCGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGAt < 2:1720849/140‑1 (MQ=255) cacCGATAGCGCAGCTGGCGGTACTGTTTTGTACCCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGCTAAACCGTGTCCAGCATCATCATGCTGAGCCCTGCCGGAACCAGCGTCGGACTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGAt < 2:2357532/140‑1 (MQ=255) ccGCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCg < 1:3513319/75‑1 (MQ=255) gCCAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGATCCGt > 2:4594942/1‑140 (MQ=255) ccAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGATCCGTg > 1:1283479/1‑140 (MQ=255) ccAGCTCAGCTGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCATTGGCGTGATCCGTg > 2:4794602/1‑140 (MQ=255) acgcctcagcgCGCGGTGCTGTTTTATAACCCCACAAGTCGGCAGCAACGAAAGACGATAAACCGTTTCCCGTAATACCATGCTCATCCATACCGAAACCAACGCCAGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGATCAGTg < 2:3967694/136‑1 (MQ=255) agctcagctGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGATCCGTGCa < 1:131828/140‑1 (MQ=255) tcagctGGCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGTAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGCCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGATCCGTGCAATg < 2:4409863/140‑1 (MQ=255) tcagctGCCGGTGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAGCCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGATCCGTGCAATg < 1:3150443/140‑1 (MQ=255) | CGTTTCGGCAAATCTGGTTTCATCAACAAAGAAGGTACCCGTCCTGCGGTGGTTATCCCAACCAACGAAGAACTGGTTATCGCGCAAGACGCGAGCCGCCTGACTGCCTGATTTCACACCGCCAGCTCAGCTGGCGGCGCTGTTTTGTAACCCGCCAAATCGGCGGTAACGAAAGAGGATAAACCGTGTCCCGTATTATTATGCTGATCCCTACCGGAACCAGCGTCGGTCTGACCAGCGTCAGCCTTGGCGTGATCCGTGCAATGGAACGCAA > NZ_CP025268/2418597‑2418870 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |