Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 2,482,126 | G→A | V82V (GTG→GTA) | dsdX → | D‑serine transporter DsdX |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 2,482,126 | 0 | G | A | 99.7% | 1125.7 / NA | 304 | V82V (GTG→GTA) | dsdX | D‑serine transporter DsdX |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (173/130); total (174/130) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
GCTTCTTCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTGTCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCT > NZ_CP025268/2481990‑2482261 | gCTTCTTCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATcc > 1:1177256/1‑140 (MQ=255) gCTTCTTCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATcc > 1:4860710/1‑140 (MQ=255) gCTTCTTCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATcc > 1:945423/1‑140 (MQ=255) gCTTCTTCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGCGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCATCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACGCGGAAAAATGATGGAAGTATcc > 2:2332393/1‑140 (MQ=255) tGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCa < 1:4213569/140‑1 (MQ=255) ggAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCaga > 1:1322337/1‑140 (MQ=255) atgatgGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAAt < 1:2123323/140‑1 (MQ=255) atgatgGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAAt < 2:2588940/140‑1 (MQ=255) atgatgGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAAt < 2:4218449/140‑1 (MQ=255) tgatgGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAAtt > 1:4516797/1‑140 (MQ=255) gggCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTc > 2:631494/1‑140 (MQ=255) ggCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCt < 1:2402154/140‑1 (MQ=255) cagggggCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGa < 2:1663276/137‑1 (MQ=255) cATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGa < 2:3918923/140‑1 (MQ=255) cATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGa < 1:706478/140‑1 (MQ=255) cATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGa < 1:2681125/140‑1 (MQ=255) tGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGaca > 1:3152363/1‑140 (MQ=255) ggggCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGacac > 2:4953545/1‑140 (MQ=255) ggggCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGacac > 2:2451083/1‑140 (MQ=255) ggggCCACTGGATATGGTAAATGCTATAGAAAGTGGAATTGGCGGAACTCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCATGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATCGTTCTGacac > 2:3737033/1‑140 (MQ=255) ggCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAGTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGGAAGAATTGGTCTGACACtt > 2:581644/1‑140 (MQ=255) ggCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCGGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTAGCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACtt > 2:290986/1‑140 (MQ=255) cTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACg > 2:5048273/1‑140 (MQ=255) cTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACg > 1:1696211/1‑140 (MQ=255) gATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTg > 1:142094/1‑140 (MQ=255) tatGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGcc > 2:4817871/1‑140 (MQ=255) tatGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGcc > 2:3172726/1‑140 (MQ=255) tatGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGcc > 2:2558908/1‑140 (MQ=255) atGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCCGACACTTCAACGCTGCCg < 2:4451674/140‑1 (MQ=255) tGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGc < 1:5032884/140‑1 (MQ=255) ggTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGcg > 2:863451/1‑139 (MQ=255) gTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTg > 1:4143249/1‑140 (MQ=255) gTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTg > 1:2633988/1‑140 (MQ=255) tAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATTGAAGTATCCGCGTCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTgt > 1:3898473/1‑139 (MQ=255) aaTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCt < 1:2992716/140‑1 (MQ=255) aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCTGTTATCGTCCTTGGCACGATACTGGGAAAGAGGATGGAAGTATCCGGGGCCGCGTAAAGAGGGTGTCTGGCACTTCGATGCTGCCGCGGGCtt > 2:1601408/1‑140 (MQ=255) aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 2:2352777/1‑140 (MQ=255) aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 1:3339196/1‑140 (MQ=255) aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 1:4456506/1‑140 (MQ=255) aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 2:248619/1‑140 (MQ=255) aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 2:2763579/1‑140 (MQ=255) aTGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACAATTCAACGCTGCCGCTGGCtt > 2:1915918/1‑140 (MQ=255) tGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCttt < 2:3163948/140‑1 (MQ=255) ttGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGtt < 1:4072129/140‑1 (MQ=255) ttGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGtt > 1:4544113/1‑140 (MQ=255) ttGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGtt > 1:1475145/1‑140 (MQ=255) gtGAAAGTGGAATTGTCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGTCCTGGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGGTGACTTGTAGtt > 2:386493/2‑140 (MQ=255) gAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAATTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGa < 2:3281014/140‑1 (MQ=255) gAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGa < 1:825196/140‑1 (MQ=255) gAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGa < 1:3598869/140‑1 (MQ=255) gAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGa < 1:2382323/140‑1 (MQ=255) gAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGa < 1:1770397/140‑1 (MQ=255) aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGa < 2:3997275/137‑1 (MQ=255) aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt < 2:3660627/140‑1 (MQ=255) aGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCCGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt > 2:3413059/1‑140 (MQ=255) tGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCa > 2:1466864/1‑140 (MQ=255) aaTTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTa < 1:3208371/140‑1 (MQ=255) aaCGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTgg > 1:3254425/1‑140 (MQ=255) cTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTgg < 1:370241/140‑1 (MQ=255) tGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGc < 2:3772382/140‑1 (MQ=255) gggcTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTAGcc < 2:2274809/140‑1 (MQ=255) ccTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGAttt > 2:272633/1‑140 (MQ=255) cTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTtg < 2:412751/140‑1 (MQ=255) cTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTtg < 2:3129288/140‑1 (MQ=255) ttATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACg < 2:3714749/140‑1 (MQ=255) ttATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACg < 2:117084/140‑1 (MQ=255) ttATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACg < 2:1828536/140‑1 (MQ=255) ttATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACg < 1:2586284/140‑1 (MQ=255) ttATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGAGGGAAGGATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACg < 2:2019309/140‑1 (MQ=255) aTCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCt < 1:39977/140‑1 (MQ=255) aTCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCt < 1:2466702/140‑1 (MQ=255) aTCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCt < 1:2782474/140‑1 (MQ=255) aTCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCt < 1:3764212/140‑1 (MQ=255) ccTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTGATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCtgtttg > 1:305203/1‑140 (MQ=255) ccTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCtgtttg < 2:1288445/140‑1 (MQ=255) tGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTttgttg > 1:1979284/1‑140 (MQ=255) tGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGGGGATGGCTGTATGGGGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCGTCACGCTTTgtgttg > 1:4125392/1‑140 (MQ=255) ggCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGa > 2:2057927/1‑140 (MQ=255) aTACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTggg > 2:2128947/1‑140 (MQ=255) aTACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTggg > 2:3490189/1‑140 (MQ=255) aTACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTggg > 2:3483766/1‑140 (MQ=255) aTACTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTCGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTggg > 1:2843701/1‑140 (MQ=255) aCTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGcg < 2:105453/140‑1 (MQ=255) aCTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGcg < 1:431485/140‑1 (MQ=255) aCTGGGAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGcg < 1:41672/140‑1 (MQ=255) tagtcataaTGATGGAAGTATCCTCGTCCGGAGAAAGAATTGGTCTGACAATTTAACGCTGCCCCTTGCTTTAAGTTGATTTCATTATGATGCTGGTTGGATTAATTTGTGTCACCACGCTGTTTGTTGAACTGGGtgtc < 2:4575964/133‑1 (MQ=255) ggAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGGTGATGTCATTATGGTGGTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGcgtcgt > 2:1867456/1‑140 (MQ=255) gAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTg < 1:4334956/140‑1 (MQ=255) gAAAAATGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTg < 1:5104065/140‑1 (MQ=255) aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt < 2:1102461/75‑1 (MQ=255) aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGt > 1:1102461/1‑75 (MQ=255) aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTAt > 2:2389044/1‑140 (MQ=255) aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTAt > 1:474330/1‑140 (MQ=255) aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTAt > 1:608368/1‑140 (MQ=255) aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTAt > 1:1013781/1‑140 (MQ=255) aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTAt > 2:2655869/1‑140 (MQ=255) aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTAt > 1:1568475/1‑140 (MQ=255) aaTGATGGAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCGGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTAt > 2:1490639/1‑140 (MQ=255) ggAAGTATCAGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGATTTCAGTTAATGTCATTATGGAGATGGTTGGCCTGATTTGTGGAATCACGCTATATGTTAAAATGGGCGTCGTGCTATTGATTc > 2:796295/1‑140 (MQ=255) gAAGTATCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTcc > 2:4436429/1‑140 (MQ=255) | GCTTCTTCGTGGGAACGATGATGGGCATGGGGCCACTGGATATGGTAAATGCTATTGAAAGTGGAATTGGCGGAACGCTGGGGTTCCTCGCAGCGGTTATCGGCCTTGGCACGATACTGGGAAAAATGATGGAAGTGTCCGGGGCCGCAGAAAGAATTGGTCTGACACTTCAACGCTGCCGCTGGCTTTCAGTTGATGTCATTATGGTGCTGGTTGGCCTGATTTGTGGCATCACGCTGTTTGTTGAAGTGGGCGTCGTGCTATTGATTCCT > NZ_CP025268/2481990‑2482261 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |