| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,915,245 | A→G | C115R (TGT→CGT) | glmS ← | glutamine‑‑fructose‑6‑phosphate transaminase (isomerizing) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,915,245 | 0 | A | G | 99.3% | 1408.5 / NA | 431 | C115R (TGT→CGT) | glmS | glutamine‑‑fructose‑6‑phosphate transaminase (isomerizing) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base G (236/191); minor base T (2/1); total (238/193) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 434 total aligned reads displayed.
ACTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACACGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGTGTGAGCAAT > NZ_CP025268/3915109‑3915380 | cTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCGTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCt > 2:4435578/1‑140 (MQ=255) tGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCtt > 1:5089860/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCAGGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCAGGCGCTTGTAGctc > 2:2418954/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:1150148/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:3390881/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:3808205/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:4306549/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:481731/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:1870959/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 1:742205/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:2974744/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:3893144/1‑140 (MQ=255) tACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctc > 2:798905/1‑140 (MQ=255) aCGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGctct > 1:1027452/1‑140 (MQ=255) cGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCGCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAGGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCtt > 2:4113004/1‑140 (MQ=255) accacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCAc > 1:1953280/1‑140 (MQ=255) accacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCAc > 1:4709387/1‑140 (MQ=255) accacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATAACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCAc > 1:2780422/1‑140 (MQ=255) cacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGGTCTTCACGc > 1:313573/1‑140 (MQ=255) cacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGc > 2:2888312/1‑140 (MQ=255) cacGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGc > 1:969447/1‑140 (MQ=255) cacGCAGCTGCGCGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGc > 2:5030923/1‑140 (MQ=255) acGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCa > 2:4910059/1‑140 (MQ=255) cGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAg < 1:1691785/140‑1 (MQ=255) cGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAg < 1:92060/140‑1 (MQ=255) cGCAGCTGCCGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAg < 2:3776132/140‑1 (MQ=255) gCAGCTGCGGGGTAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTGGTTTCAGCTCACAGTGCACCAGATAGGCAATCACTGCGGTGGCGGGTTCAGGAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTGTAGCTCTTCACGCAGc > 2:3645814/1‑140 (MQ=255) gCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGc > 1:5048839/1‑140 (MQ=255) tGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTc > 1:625810/1‑140 (MQ=255) gCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCa < 1:2035306/140‑1 (MQ=255) cGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCAt < 2:1368353/140‑1 (MQ=255) aGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGtttt < 1:1359009/140‑1 (MQ=255) gCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTc > 2:4168611/1‑140 (MQ=255) gCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTc > 2:3254985/1‑140 (MQ=255) gCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTc > 2:159203/1‑140 (MQ=255) aCGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCCGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCga < 1:4998701/140‑1 (MQ=255) cGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCgat > 2:836754/1‑140 (MQ=255) cAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCgatga < 1:1652598/140‑1 (MQ=255) gAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGatgatg < 2:1982904/140‑1 (MQ=255) ccTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTGCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTa > 2:4330711/1‑140 (MQ=255) tCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATg < 1:3569658/140‑1 (MQ=255) tCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATg < 1:1541760/140‑1 (MQ=255) tCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATg < 2:2548096/140‑1 (MQ=255) tCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATg < 1:1810209/140‑1 (MQ=255) tCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCCTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATg < 1:2888312/140‑1 (MQ=255) aCGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGca < 1:219453/140‑1 (MQ=255) aCGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGca < 2:276312/140‑1 (MQ=255) cGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcac > 1:2934363/1‑140 (MQ=255) cGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcac > 2:3967243/1‑140 (MQ=255) gCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcacc < 1:4598915/140‑1 (MQ=255) gagTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcaccacc < 2:3402540/140‑1 (MQ=255) agTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcaccacca > 2:1435113/1‑140 (MQ=255) agTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcaccacca > 2:3497645/1‑140 (MQ=255) agTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGcaccacca > 2:2700230/1‑140 (MQ=255) tCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACcaca < 2:3207575/140‑1 (MQ=255) tCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACcaca > 2:2964556/1‑140 (MQ=255) tCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACcaca < 1:4018687/140‑1 (MQ=255) gcccGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACcaca > 2:2664893/2‑140 (MQ=255) ccccGCTTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCCGATGGGCAATCACTCCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATCGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACcaca < 2:688667/139‑1 (MQ=255) ccGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAAt < 2:4611777/140‑1 (MQ=255) cGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAAtg > 1:3954562/1‑140 (MQ=255) gCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAAtgt > 1:270615/1‑140 (MQ=255) tGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGttt > 1:4513503/1‑139 (MQ=255) tttCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAAt < 2:575079/132‑1 (MQ=255) tttCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAg > 2:16580/1‑140 (MQ=255) tttCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAg > 1:2442527/1‑140 (MQ=255) ccAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCa < 2:4703350/140‑1 (MQ=255) cAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCAt > 1:393531/1‑140 (MQ=255) aGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCAtt < 1:1251709/140‑1 (MQ=255) aGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCAtt < 2:5086627/140‑1 (MQ=255) aGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCAtt < 1:4125859/140‑1 (MQ=255) aTGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCa < 1:2635316/140‑1 (MQ=255) aTGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCa < 1:1298628/140‑1 (MQ=255) gggCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACt > 1:1821024/1‑140 (MQ=255) gggCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACt > 1:1176243/1‑140 (MQ=255) gggCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACt > 1:3295972/1‑140 (MQ=255) cAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCt > 1:232220/1‑140 (MQ=255) aaTCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAGTGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTg < 2:4783718/140‑1 (MQ=255) aTCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGa < 2:607546/140‑1 (MQ=255) aTCACGTCGGTGCCGGTTGCAGAAACGCAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCGGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCCCCATGTGTTCAGAAACATGCCGATGCGCATTCACTTCTGa < 2:2141166/140‑1 (MQ=255) cACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCa < 1:4882228/67‑1 (MQ=255) aCTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAgg < 2:4244079/140‑1 (MQ=255) cTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGt < 1:829745/140‑1 (MQ=255) cTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGt < 2:1721405/140‑1 (MQ=255) tCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCCCGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGACGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTg > 2:1109859/1‑140 (MQ=255) tCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTg > 1:2126083/1‑140 (MQ=255) cGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTgg < 2:3121124/140‑1 (MQ=255) gTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGt > 2:1198063/1‑140 (MQ=255) ttCAGAAACGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGTAGCAGTCCATGGTTTTCGATGTTGCCGTTATGCACCACCACAATGAGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATCCAATTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCg < 1:3052360/140‑1 (MQ=255) aaaCGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCGCAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAg < 2:2478137/140‑1 (MQ=255) aaaCGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGATTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAg < 2:4352423/140‑1 (MQ=255) cGAAGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGa < 1:3757270/140‑1 (MQ=255) aaGGTATCGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGACGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAgt < 2:2590974/140‑1 (MQ=255) aaGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAgt < 1:561705/140‑1 (MQ=255) aaGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAgt < 2:225389/140‑1 (MQ=255) aGGTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAgtg < 2:1034586/140‑1 (MQ=255) gTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACCATGTGTTCAGCAACATGTGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGtgtg < 2:186583/140‑1 (MQ=255) gTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGtgtg < 2:5005782/140‑1 (MQ=255) gTATAGCCACGCGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGtgtg < 1:865363/140‑1 (MQ=255) gTATAGCCACGCCCTTTTAGCTCTTCCCGCAGAGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTCTTCAGAAACATGCGGCTGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGtgtg < 1:4381491/140‑1 (MQ=255) | ACTGTACCGTACGCACCACGCAGCTGCGGGATAGCACGCAGAACGGCCTCACGCAGAGTCCCGCCTTGTTTCAGCTCCCAGTTCACCAGATGGGCAATCACTTCGGTGTCGGTTTCAGAAACGAAGGTATAGCCACACGCTTTTAGCTCTTCACGCAGCGGTTCATGGTTTTCGATGATGCCGTTATGCACCACCACAATGTGTTCAGAAACATGCGGATGCGCATTCACTTCTGAAGGTTCACCGTGGGTCGCCCAGCGAGTGTGAGCAAT > NZ_CP025268/3915109‑3915380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |