| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,079,391 | A→G | intergenic (+17/‑28) | dtd → / → fabY | D‑aminoacyl‑tRNA deacylase/fatty acid biosynthesis protein FabY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,079,391 | 0 | A | G | 99.6% | 940.1 / NA | 281 | intergenic (+17/‑28) | dtd/fabY | D‑aminoacyl‑tRNA deacylase/fatty acid biosynthesis protein FabY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (112/167); total (113/168) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 281 total aligned reads displayed.
TGACTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAACGC > NZ_CP025268/4079254‑4079526 | gACTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCa < 2:1555921/140‑1 (MQ=255) aCTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCAc > 2:3693293/1‑140 (MQ=255) aCTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGAGGAACAGGCCAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTTACATACTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGGTGTCAc > 2:3987954/1‑140 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg > 2:1729978/1‑140 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 1:3517903/140‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCCTCGGTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 1:3632286/140‑1 (MQ=255) cTATTTCGTCCAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACg < 1:1869454/140‑1 (MQ=255) tttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGa > 2:1160319/1‑140 (MQ=255) tttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGa > 2:1279801/1‑140 (MQ=255) ttCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGaa < 1:5077003/140‑1 (MQ=255) tcgAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACaa > 2:3851557/1‑140 (MQ=255) gAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAaga < 1:1568482/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGTAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATGGCTGGTCAATGATGGCCACGTGACATTCAGGGTGCGGGTATGGGCCAGGTTCGAGGGTTGTCACGGGAAAGAagaga < 2:1773475/140‑1 (MQ=255) aCGCTGCCGGCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagaga < 2:4295259/140‑1 (MQ=255) cGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagagag > 2:2328762/1‑140 (MQ=255) cTGCCGTCAGCAAGAGATGAGCACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagagagag < 2:2274886/140‑1 (MQ=255) cTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagagagag < 1:4743191/140‑1 (MQ=255) cTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAagagagag < 1:2274172/140‑1 (MQ=255) gCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTa < 1:2340424/140‑1 (MQ=255) ccGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTAt < 2:322599/140‑1 (MQ=255) ccGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTAt < 2:3303484/140‑1 (MQ=255) ccGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTAt < 2:3639555/140‑1 (MQ=255) gTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTGCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGAGAAACAAGAGAGAGTATCg < 2:4519004/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 1:3234736/140‑1 (MQ=255) tCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGc < 2:4100307/140‑1 (MQ=255) cAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCt < 2:4987054/140‑1 (MQ=255) gagaTGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTAt < 2:2692171/140‑1 (MQ=255) gagaTGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTAt < 1:2762257/140‑1 (MQ=255) gagaTGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTAt < 1:3104006/140‑1 (MQ=255) gagaTGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTAt < 2:586056/140‑1 (MQ=255) aTGAACACGCAAACCGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATCATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGCGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATGGCTATGTATTAc > 2:1191980/1‑140 (MQ=255) aTGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCAc > 1:608621/1‑140 (MQ=255) tGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCGAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATGGCTAGGTATCAcc > 1:1053998/1‑140 (MQ=255) aaCACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGTTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCtt < 1:1865251/140‑1 (MQ=255) acacGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTc > 1:78506/1‑140 (MQ=255) cacGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCg > 1:2975933/1‑140 (MQ=255) cGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCggg > 1:4743588/1‑140 (MQ=255) gCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGt < 1:4262847/140‑1 (MQ=255) aGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCcaca < 1:4192690/140‑1 (MQ=255) gACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACaaa > 1:1682416/1‑140 (MQ=255) cGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACa > 1:1899145/1‑140 (MQ=255) cTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACaga > 1:2221802/1‑140 (MQ=255) cTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACaga < 2:4777624/140‑1 (MQ=255) cTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACaga < 1:536950/140‑1 (MQ=255) cTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACaga < 1:4958703/140‑1 (MQ=255) cTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACaga < 1:4958792/140‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 2:3540181/140‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 1:5022147/140‑1 (MQ=255) tCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGCGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACagaag < 2:4347134/140‑1 (MQ=255) cGCTGCGGATATGCAGGTATCACTGGTCAATAATGGCCCCGTGGCATTAGGGTTGAAGGTAAGAGCCAGCGTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGGATCGCTATGTAGCACCTACGGGGGCCACAGACagaaga > 2:185668/1‑140 (MQ=255) tGCGGATATGCAGGGATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATGCTGGTTGCAGGCATGAGCAAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAAAAAGAGAGCGTCTCGATATGTATGACCGTCTGGGTCCACAAAAcgaagagga > 2:2362367/1‑140 (MQ=255) cGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCGCCGTGACATTCTGGGTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAACCAAGAGAGAGTATCGCTATGTACCACCTTCGGGTTCCACGAACAGAAGAAGAAt < 2:2548945/140‑1 (MQ=255) gATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGCTGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCAAGGGTTGTCACGGGAAACAAGACAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTa < 2:401242/140‑1 (MQ=255) gATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTa < 1:4930982/140‑1 (MQ=255) tatGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTaga < 1:3657434/140‑1 (MQ=255) tatGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTaga < 1:3936969/140‑1 (MQ=255) cAGGTAGAGCTGGTCAATGATGCCCCCGTGACATTCGGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGt < 2:1598100/140‑1 (MQ=255) aGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGGTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGtt < 2:54969/140‑1 (MQ=255) aTCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTa > 1:1355532/1‑140 (MQ=255) aTCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTa > 1:1198486/1‑140 (MQ=255) aTCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTa > 1:2713428/1‑140 (MQ=255) gCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCa > 1:4025673/1‑140 (MQ=255) gTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGttt > 1:624084/1‑140 (MQ=255) tCAATGATGGCCCCGTGGCATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTc > 1:1756785/1‑140 (MQ=255) cAATGATGGCCCCGTGACATGCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTAGCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCg < 2:3492751/140‑1 (MQ=255) tgatgGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTg > 1:4839426/1‑140 (MQ=255) tgGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGa > 1:3424320/1‑140 (MQ=255) tgGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGa > 2:281002/1‑140 (MQ=255) tgGCCACGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGa > 1:4144253/1‑140 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCCCAAACAGAAGACGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa > 2:964291/1‑140 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa > 1:4587580/1‑140 (MQ=255) gCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGGCACGGGAAACAAGAGAGAGCATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGaaa > 2:4932251/1‑140 (MQ=255) ccccTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCGAGCTTCCAAGGTTCTCACGGGAAACAAGAGAGAGCATCGCTATGTATCACATTCGGGTTCCACAACCAGAAGAAGAATTAGAACATTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATg < 2:3530072/140‑1 (MQ=255) cccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATg < 1:2426065/140‑1 (MQ=255) ccGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGt < 1:2753788/140‑1 (MQ=255) cGTGGCATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGtt < 1:158989/140‑1 (MQ=255) cGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGtt < 1:1004608/140‑1 (MQ=255) gTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTg > 1:3847444/1‑140 (MQ=255) gTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTg > 2:1356927/1‑140 (MQ=255) tGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGc > 1:154714/1‑140 (MQ=255) tGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGc > 1:4782941/1‑140 (MQ=255) gACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCg < 1:2552100/140‑1 (MQ=255) aCATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGt > 2:3778626/1‑140 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCGAGCTTCCGGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 2:5009977/140‑1 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTGCAGGGTTGTAACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 2:286057/140‑1 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 1:894884/140‑1 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 1:360392/140‑1 (MQ=255) cATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTa < 1:2095144/140‑1 (MQ=255) tgattGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGCGAGGATCGCTATGTATCACGTTCGGGTTCCACAAACAGAATAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGAAAATGATGCTTAAGcct > 2:2059707/4‑139 (MQ=255) gggggaGGTATGATGCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTGTGTATCACCTGCGGGTTCCACAGACAGAGGAAGAATTAGAGCTGTACTAGCATTTTCGCTGGGAAAGGTTGCGTAAGCCCCt > 2:1949168/6‑140 (MQ=255) gCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCa < 2:1007844/140‑1 (MQ=255) cAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCAt < 1:3155175/140‑1 (MQ=255) gTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCaa > 2:776309/1‑140 (MQ=255) gAGCCAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCaa < 2:859530/140‑1 (MQ=255) ccAGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAg > 1:2868866/1‑140 (MQ=255) aGCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGt < 1:427365/140‑1 (MQ=255) gCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACCAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTGCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCCTTACTATCAGCTTCGCTGGGAACTGTTGCGTAAGCCCCTCCATCAACCAAAAggcg > 1:204798/1‑138 (MQ=255) gCTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGtt > 1:3302017/1‑140 (MQ=255) cTTCCAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTc > 2:4473141/1‑140 (MQ=255) cAGGGTTGTCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGaa > 1:3370030/1‑140 (MQ=255) | TGACTATTTCGTCGAACGCTGCCGTCAGCAAGAGATGAACACGCAAACAGGACGCTTCGCTGCGGATATGCAGGTATCGCTGGTCAATGATGGCCCCGTGACATTCTGGTTGCAGGTATGAGCCAGCTTCCAGGGTTATCACGGGAAACAAGAGAGAGTATCGCTATGTATCACCTTCGGGTTCCACAAACAGAAGAAGAATTAGAGCGTTACTATCAGTTTCGCTGGGAAATGTTGCGTAAGCCCCTGCATCAACCAAAAGGTTCGGAACGC > NZ_CP025268/4079254‑4079526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |