Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 4,517,199 | T→C | D465G (GAC→GGC) | fecA ← | Fe(3+) dicitrate transport protein FecA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 4,517,199 | 0 | T | C | 99.8% | 1681.1 / NA | 501 | D465G (GAC→GGC) | fecA | Fe(3+) dicitrate transport protein FecA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (223/277); total (224/277) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.47e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 501 total aligned reads displayed.
GTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCGTGGCTCAAT > NZ_CP025268/4517063‑4517335 | ttgttCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGa > 1:1826112/1‑140 (MQ=255) tGGTATGACTCGACATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCTAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTTCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCaa < 2:4417226/140‑1 (MQ=255) gTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTGGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACt < 1:2873498/140‑1 (MQ=255) gTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACt > 2:1748572/1‑140 (MQ=255) gTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACt > 2:4154823/1‑140 (MQ=255) ccTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAAGTGCCCg > 2:4938341/2‑140 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCg > 1:437086/1‑140 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCg > 1:764107/1‑140 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCg > 1:1921285/1‑140 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCg > 1:842739/1‑140 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCg > 2:4520172/1‑140 (MQ=255) aCTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCg > 1:2071532/1‑140 (MQ=255) atatGTTCGAAACGCATACCCTGCGTGATGGTCCAGTTGCCGGTGTCGATTTGGTCATCCAGATACCAGGCGGGCGCCTGGGTGCCGTAACTCGTATCGCGGTCGTAA‑TGGCTTGTGTCTGACGGCAACGGCCCgcggct > 2:1438398/1‑140 (MQ=255) atatGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCgctgct > 2:2556386/1‑140 (MQ=255) atatGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCgctgct > 2:3242451/1‑140 (MQ=255) atatGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCgctgct > 2:2520101/1‑140 (MQ=255) atatGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCgctgct < 2:1956705/140‑1 (MQ=255) atGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCtgg < 1:3768770/140‑1 (MQ=255) ttCGCAACGCATCTCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACGAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAAAGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCtggtgg < 2:3027690/140‑1 (MQ=255) ttCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCtggtgg < 1:4979088/140‑1 (MQ=255) ttCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCtggtgg < 2:1623709/140‑1 (MQ=255) ttCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCtggtgg < 2:1810682/140‑1 (MQ=255) ttCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCAAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGCCGGCAACTGCCCGCTGCtggtgg < 1:1941884/140‑1 (MQ=255) cGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCg < 2:4071803/140‑1 (MQ=255) cGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCg < 1:4182019/140‑1 (MQ=255) gAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCgg < 1:1134818/140‑1 (MQ=255) gAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCgg < 1:3423644/140‑1 (MQ=255) gAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCgg < 2:2278681/140‑1 (MQ=255) cATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTgtagt > 1:2762669/1‑140 (MQ=255) aTACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTgtagta > 1:4571218/1‑140 (MQ=255) tACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTaa < 2:3816529/140‑1 (MQ=255) cccGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACg < 1:2966106/140‑1 (MQ=255) cGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCtgg < 1:1541650/119‑1 (MQ=255) cGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCAttt > 2:3334568/1‑140 (MQ=255) gTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTc > 2:352814/1‑140 (MQ=255) ggTACAGTTGCAGATGTCGATTTTGTCATCCAGCTCCCAGGCGTGAGCCTCGGTGACGGACCGAGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCg < 2:3898864/140‑1 (MQ=255) gTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGatt < 1:3952214/140‑1 (MQ=255) gTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGatt < 1:1980567/140‑1 (MQ=255) gTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCGCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGatt < 1:4837107/140‑1 (MQ=255) gCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGattcat < 2:1156460/140‑1 (MQ=255) gCCGATGTCGATTTTGTCACCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGTAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTATAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTTGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGattcat < 2:3649543/140‑1 (MQ=255) gATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGAttcattca > 2:4991767/1‑140 (MQ=255) tGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCaaa < 2:1627228/140‑1 (MQ=255) tGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCaaa < 1:122585/140‑1 (MQ=255) tGTCCATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGTAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCaaa < 2:2023551/140‑1 (MQ=255) gTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAAt < 1:1877277/140‑1 (MQ=255) gTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAAt < 2:1198929/140‑1 (MQ=255) cGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAg > 1:1608344/1‑140 (MQ=255) ttttGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGa < 2:4354552/140‑1 (MQ=255) ttGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAAGGGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAAGAGCGAt < 2:2757935/140‑1 (MQ=255) tCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgcc < 1:3844680/140‑1 (MQ=255) tCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgcc < 1:3471089/140‑1 (MQ=255) tCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgcc < 2:1877099/140‑1 (MQ=255) tCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgcc > 1:1312283/1‑140 (MQ=255) tCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGACGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGTGATAgcc < 2:4761949/140‑1 (MQ=255) cATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgccc > 2:3908009/1‑140 (MQ=255) ccAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgcccacg < 1:591241/140‑1 (MQ=255) ccAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgcccacg < 1:1025338/140‑1 (MQ=255) aCCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACt < 1:4426908/140‑1 (MQ=255) ggCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGt > 1:924066/1‑140 (MQ=255) ggCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGt > 1:1003399/1‑140 (MQ=255) ggCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGt > 1:2436985/1‑140 (MQ=255) ggCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTAAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGt > 1:3539657/1‑140 (MQ=255) gCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTg < 1:2500352/140‑1 (MQ=255) gCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAACAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTg < 2:4589323/140‑1 (MQ=255) tGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTgcgc > 2:1367074/1‑140 (MQ=255) tGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTgcgc > 1:4681488/1‑140 (MQ=255) cgcCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAgcc > 1:3700847/1‑120 (MQ=255) cgcCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCgg > 1:68865/1‑140 (MQ=255) ccTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGaa > 2:2133483/1‑140 (MQ=255) ccTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGaa < 1:1473495/140‑1 (MQ=255) cGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAggg > 1:5071174/1‑140 (MQ=255) ggTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGc < 1:1686255/140‑1 (MQ=255) ggTGCCCGAACGTGTATCGCTGGCGCAA‑GGGGTTGGGCCTGACGGCAACTGCCGGCTCCTGGTGGCGGTGGAGTAACGCACTTCATGCGGTGAGTCATCCAAATCGCGATAGCCGCCGGCCACTTCGTGCGCGGAAGGGc < 2:1545816/140‑1 (MQ=255) gTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGcc < 1:4271227/140‑1 (MQ=255) gCCGGAACGCGTAGCGGGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGAGGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGGTAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGa < 2:3984570/140‑1 (MQ=255) gAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCAt < 2:835943/140‑1 (MQ=255) cgTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGa < 1:2556386/140‑1 (MQ=255) cgTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGa < 1:2182783/140‑1 (MQ=255) tATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATc > 2:1269062/1‑140 (MQ=255) tATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATc < 1:424846/140‑1 (MQ=255) tATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATc < 2:4297700/140‑1 (MQ=255) gTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGt > 1:2022319/1‑140 (MQ=255) gTCGTAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGt > 2:4677712/1‑140 (MQ=255) tAA‑GGGCTTGGGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 2:3130433/140‑1 (MQ=255) tAA‑GGGCTTGCGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 1:3316137/140‑1 (MQ=255) tAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCACATAGCGCTAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 2:576725/140‑1 (MQ=255) tAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 1:2353908/140‑1 (MQ=255) tAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 2:763926/140‑1 (MQ=255) tAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 2:5107185/140‑1 (MQ=255) tAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 2:1023087/140‑1 (MQ=255) tAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 1:4799037/140‑1 (MQ=255) tAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 2:2874173/140‑1 (MQ=255) tAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 2:4250129/140‑1 (MQ=255) tAA‑GGGCTTGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 1:327794/140‑1 (MQ=255) tAA‑GGGCTGGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCACATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCg < 2:2427513/140‑1 (MQ=255) ttGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCGTGGCTCa < 1:3996021/140‑1 (MQ=255) ttGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCGTGGCTCa > 1:2651872/1‑140 (MQ=255) ttGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCGTGGCTCa < 2:705380/140‑1 (MQ=255) ttGAGCCGGACGGCAACTGCCCGCTGCAGGTGGCGGTGTAGTAACGCAATTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCCCGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTTGCGTGGCTCa > 2:3742439/1‑140 (MQ=255) | GTTGTTCTGGTATGACTCGATATGTTCGAAACGCATACCCGGCGTGATGGTCCAGTTGCCGATGTCGATTTTGTCATCCAGATACCAGGCGTGCGCCTCGGTGCCGGAACGCGTATCGCGGTCGTAA‑GGGCTTGAGTCGGACGGCAACTGCCCGCTGCTGGTGGCGGTGTAGTAACGCATTTCATGCGTTGATTCATTCAAATAGCGATAGCCCACGCCCACTTCGTGCGCGGAAGGGCCGATCATAAAGATCTGGCTGTAGCGTGGCTCAAT > NZ_CP025268/4517063‑4517335 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |