Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 581,197 | +G | intergenic (+50/+4) | CXP41_RS24355 → / ← CXP41_RS03085 | tail fiber assembly protein/class I SAM‑dependent methyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 581,196 | 1 | . | G | 97.7% | 2702.5 / 45.1 | 792 | intergenic (+49/+5) | CXP41_RS24355/CXP41_RS03085 | tail fiber assembly protein/class I SAM‑dependent methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (12/6); new base G (444/329); total (456/336) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 810 total aligned reads displayed.
AGCCTGGAAAAAATATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑T‑GATGTTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTG > NZ_CP025268/581057‑581332 | ggAAAAAATATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑T‑ggatg < 1:6704844/140‑5 (MQ=255) gAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGaa < 1:6574061/140‑1 (MQ=255) gAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGaa < 2:10456819/140‑1 (MQ=255) gAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGaa > 1:969462/1‑140 (MQ=255) aCCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGaaaa < 1:3606638/140‑1 (MQ=255) ccGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAAc > 1:8817065/1‑140 (MQ=255) gtgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACCTGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAt > 2:6937431/1‑140 (MQ=255) gtgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAt < 1:5051146/140‑1 (MQ=255) gtgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAt < 1:6056014/140‑1 (MQ=255) gtgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAt > 2:5096634/1‑140 (MQ=255) gtggtgAGACATCAACTGCACCTGCTATCGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGAGTATGCCGCAGCCCGTCTTAAGCAAGAACAGGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAt < 1:1152225/140‑1 (MQ=255) tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGGACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 1:7755816/1‑140 (MQ=255) tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 1:2517317/1‑140 (MQ=255) tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 2:6104872/1‑140 (MQ=255) tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 2:1554672/1‑140 (MQ=255) tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt < 2:2577857/140‑1 (MQ=255) tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 2:3870649/1‑140 (MQ=255) tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 1:5171832/1‑140 (MQ=255) tgtTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAtt > 2:4277834/1‑140 (MQ=255) tagATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCATGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCATAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCATGAAGCGGAAAACATtac > 2:9445098/3‑140 (MQ=255) tACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACa < 1:5799612/140‑1 (MQ=255) tACATCAACTGAACCTGATATTGAGTGGCATACGAACCCTGTCAGTGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAATATTACTACa < 2:9792794/140‑1 (MQ=255) aCATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTTAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAg < 2:3493204/140‑1 (MQ=255) aCATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAg < 1:1744409/140‑1 (MQ=255) tCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGTAG‑GATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTAc > 1:9290166/1‑140 (MQ=255) tCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACAt < 1:4406874/129‑1 (MQ=255) tCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTAc > 1:4654514/1‑140 (MQ=255) tCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTAc > 2:2905896/1‑140 (MQ=255) tCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTAc > 2:5274704/1‑140 (MQ=255) tCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTAc > 2:4954382/1‑140 (MQ=255) tCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTAc > 1:1010393/1‑140 (MQ=255) tCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTAc > 2:7763564/1‑140 (MQ=255) cAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTAcc < 2:8292467/140‑1 (MQ=255) tGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGa > 1:6347349/1‑140 (MQ=255) tGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGa > 1:5560845/1‑140 (MQ=255) cACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAAc > 2:4093827/1‑140 (MQ=255) ccTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCt < 1:8182042/140‑1 (MQ=255) cTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCtt < 2:7501512/140‑1 (MQ=255) gAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTaa < 1:896423/140‑1 (MQ=255) aGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGTACCTTGGTTTTAAc > 2:9671722/1‑140 (MQ=255) aGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAAc > 1:3888087/1‑140 (MQ=255) aGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAAc > 1:9969491/1‑140 (MQ=255) aGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAAc > 1:5956069/1‑140 (MQ=255) aGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAAc > 1:2878084/1‑140 (MQ=255) aGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAAc > 1:3096937/1‑140 (MQ=255) aGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAAc > 2:7057244/1‑140 (MQ=255) gTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACa > 1:2339928/1‑140 (MQ=255) gCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGACAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATtc > 2:6739590/1‑140 (MQ=255) ccTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATtct > 1:7609690/1‑140 (MQ=255) cGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGaa < 2:5500293/140‑1 (MQ=255) cGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGaa > 1:9866910/1‑140 (MQ=255) cGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGaa > 2:568085/1‑140 (MQ=255) gAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGaaa < 2:8014990/140‑1 (MQ=255) gAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGaaa < 2:7395656/140‑1 (MQ=255) gAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGaaa > 2:1140100/1‑140 (MQ=255) ccTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGct < 1:4006577/140‑1 (MQ=255) cTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctc > 2:10135354/1‑140 (MQ=255) cTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctc > 1:320350/1‑140 (MQ=255) cTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctc > 1:10703699/1‑140 (MQ=255) cTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGACTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctc > 2:10400629/1‑140 (MQ=255) tGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGaaaa < 2:1846747/91‑1 (MQ=255) tGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGaa < 1:1921747/133‑1 (MQ=255) tGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctct < 2:455072/140‑1 (MQ=255) tGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctct < 1:8301725/140‑1 (MQ=255) tGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGctct > 2:5825672/1‑140 (MQ=255) gTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTg > 2:4848122/1‑140 (MQ=255) tCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTga < 2:3217278/140‑1 (MQ=255) tCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTga < 1:10610823/140‑1 (MQ=255) tCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTga < 1:2213678/140‑1 (MQ=255) tCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTga < 2:8915194/140‑1 (MQ=255) gcAGGGAGTAATCAGTGGGATTATGCCGCAGCACGGCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTga < 1:8446103/139‑1 (MQ=255) cAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCtt > 2:9116540/1‑105 (MQ=255) cAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCtt < 1:9116540/105‑1 (MQ=255) cAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTgag > 1:9514428/1‑140 (MQ=255) gggAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGagag < 1:4964698/140‑1 (MQ=255) aGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGtat > 1:2113932/1‑140 (MQ=255) aGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGtat < 1:7956387/140‑1 (MQ=255) taagccttGGGATGATGCCGCTGCACGTCTTAAGCCAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTCTTTTTTTCCTGAAGCGGTAAACATTACTACAGTACCTTGAACAGTGGGTTTAACATTCTCGAACTGCGCGGCGAGTagat > 2:6197401/7‑140 (MQ=255) tAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAATCATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTATCATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTatat > 2:5950235/1‑140 (MQ=255) aTCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATAtgt > 1:1506981/1‑140 (MQ=255) aTCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATAtgt > 2:8730498/1‑140 (MQ=255) aTCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATAtgt > 1:7097588/1‑140 (MQ=255) ttGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTa > 1:5460115/1‑140 (MQ=255) gggATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGGGTATATGTGTTAAg > 1:10803795/1‑140 (MQ=255) gggATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAg > 2:2180310/1‑140 (MQ=255) tGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCcttctt > 1:10210372/1‑140 (MQ=255) tGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCcttctt > 1:450849/1‑140 (MQ=255) tGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCcttctt > 2:2408030/1‑140 (MQ=255) cGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGGGTTAAGCCTTCTTCGGAATCttt > 1:7332266/1‑140 (MQ=255) tCTTAAGCAAGATCATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTGTCCTGACGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTtg < 2:10837733/140‑1 (MQ=255) tCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTtg > 1:4862518/1‑140 (MQ=255) gCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGtttt > 2:9484347/1‑139 (MQ=255) gCAAGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTg > 2:3106348/1‑140 (MQ=255) aGAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGaaa > 1:6955475/1‑140 (MQ=255) gAACATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGtt < 2:2752954/108‑1 (MQ=255) aaCATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTga > 1:4258845/1‑94 (MQ=255) aaCATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAg > 2:649189/1‑140 (MQ=255) aaCATGCTGCGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAg > 1:3721957/1‑140 (MQ=255) gcGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCttt < 1:6152452/140‑1 (MQ=255) gcGGT‑TGGATGCTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTACGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCttt < 2:9217301/140‑1 (MQ=255) | AGCCTGGAAAAAATATCGGGTGTTGCTGAACCGTGTTGATACATCAACTGCACCTGATATTGAGTGGCCTACGAACCCTGTCAGGGAGTAATCATTGGGATTATGCCGCAGCACGTCTTAAGCAAGAACATGCTGCGGT‑T‑GATGTTATTTTTTTCCTGAAGCGGAAAACATTACTACAGTACCTTGAACCTTGGTTTTAACATTCTCGAAATGCTCTGAGAGTATATGTGTTAAGCCTTCTTCGGAATCTTTTGTGTTTGAAAAGATGCCTTTCTG > NZ_CP025268/581057‑581332 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |