| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,013,520 | +G | pseudogene (463/542 nt) | zapC → | cell division protein ZapC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,013,518 | 1 | . | G | 98.6% | 1955.6 / 15.5 | 567 | pseudogene (461/542 nt) | zapC | cell division protein ZapC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (5/3); new base G (267/292); total (272/295) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 603 total aligned reads displayed.
ATGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑G‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013379‑1013651 | aTGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGtt > 1:1139453/1‑140 (MQ=255) tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑g > 2:10055078/1‑140 (MQ=255) gggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑g‑ggcg > 1:7965374/1‑137 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCCCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCGGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑g‑ggcga < 1:5788357/140‑5 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑g‑ggcga < 1:5983061/140‑5 (MQ=255) cGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACg > 1:4503085/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCa > 2:10856101/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCa > 2:10310215/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCa > 2:4574600/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCa > 1:1872730/1‑140 (MQ=255) cGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCAtt > 2:9330926/1‑140 (MQ=255) ccTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTaca > 2:7122940/1‑138 (MQ=255) ttGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGa < 2:7719609/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 2:9653386/140‑1 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCCGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:5137164/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 1:6372083/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 1:386394/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:1407655/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTGATTGCGGGTCGCGCGATGCCGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:5657578/1‑140 (MQ=255) tACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGa > 2:1525975/1‑140 (MQ=255) cTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGaaa > 2:2576724/1‑140 (MQ=255) cTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGaaa > 2:1318767/1‑140 (MQ=255) ccGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAAGCGGGCGACAATGCCGCACTAGGCCTGCTGGCACAACCCAGCGTTGTCATTGCGGGTCGCGGGATGCAGTT‑G‑GTCGCCGCCATTACAAGCATGAACGACAGGCTGAAAACg < 2:4830184/139‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg > 2:4212783/1‑140 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 2:2979030/140‑1 (MQ=255) gCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 1:4207372/140‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:432390/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:7109169/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:3412700/1‑140 (MQ=255) aGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGtt < 2:3337904/140‑1 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTTTTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTATAATCATGAACGTCTGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 2:2363864/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGa > 2:5348701/1‑119 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:10764866/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:356852/1‑140 (MQ=255) tttGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTg < 2:674033/140‑1 (MQ=255) gCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACa > 1:5192453/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 2:2725164/1‑140 (MQ=255) ggTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCt > 2:8681260/1‑140 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 1:5443967/140‑1 (MQ=255) tCTGGCGAATATGCCGCACTATGCCTTCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAATCCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCgt < 2:5967498/140‑2 (MQ=255) tCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGTTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGa < 1:1540553/140‑1 (MQ=255) ggCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACa > 2:7848152/1‑140 (MQ=255) gCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAg > 1:6105537/1‑140 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 2:2100275/140‑1 (MQ=255) gCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTa > 2:4293610/1‑140 (MQ=255) cTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACgcgc < 1:5651503/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:8226335/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 2:8882156/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:5934638/140‑1 (MQ=255) aaTGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCAATAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 2:7539275/139‑1 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 1:3276335/1‑140 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 1:10565195/1‑140 (MQ=255) ctgctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACtt < 1:8861236/140‑1 (MQ=255) ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAg > 1:2181887/1‑140 (MQ=255) ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAg > 1:9029341/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 2:5378072/140‑1 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 1:8072404/140‑1 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 2:8534334/140‑1 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg > 2:401579/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:10351238/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:6105537/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 1:6703205/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:10580637/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:2426287/1‑140 (MQ=255) catccatGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAATATCATGAACGACAGGCTGATACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACTCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:82929/134‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:1658846/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:7233111/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:10005930/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:9208535/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATGAAAATCATGACCGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTGGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:6930818/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 2:9103053/140‑1 (MQ=255) ccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTc < 1:4704328/140‑1 (MQ=255) tGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCgg > 1:4965963/1‑140 (MQ=255) tGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCgg < 1:2305287/140‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 2:6424451/140‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTa < 1:1665384/140‑1 (MQ=255) gttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTac < 2:6612854/140‑1 (MQ=255) tgttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATAAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTacac > 2:10674289/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCCGTCTTCGGTACACAg > 2:3103040/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:6846021/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:172176/1‑140 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGTTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAAGAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTATGTGCAGTCTTCGTTACACAGCTa < 2:98590/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACATCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:1887615/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTACGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 1:779086/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 1:2616417/140‑1 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:8433914/1‑135 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTTGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 2:6285880/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa < 1:961389/140‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa < 2:7333736/140‑1 (MQ=255) tCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:9344220/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:2854994/1‑140 (MQ=255) cgcgATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa < 1:8639530/140‑1 (MQ=255) cgcgATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCAATAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTATGTGCAGTCTTCGGTACACCGCTACAGCAAAGaa < 2:8106985/140‑1 (MQ=255) gcgATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAAt < 1:3168154/140‑1 (MQ=255) gcgATGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAAt < 1:6559154/140‑1 (MQ=255) gcgATGCAGTTGG‑G‑CGACGCAATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAAt < 1:5035276/140‑1 (MQ=255) tGCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCGTCGGTACAGAGCTACAGCAAAGAATGGTg > 1:14070/1‑140 (MQ=255) tGCAGTT‑GTG‑CGACTCCATTAAAATCATTAACGTAAGGATGAAACCGCAGGTTAATGTTTAAAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCATACTTAAGTGCAGTCTTCTGTACACAGCTACAGCAAAGAATGTTg < 2:501728/140‑1 (MQ=255) gCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt > 2:3696175/1‑108 (MQ=255) gCAGTTGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGc < 1:7502689/140‑1 (MQ=255) | ATGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGTT‑G‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013379‑1013651 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |