| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,175,450 | +G | pseudogene (483/632 nt) | comR ← | TetR family copper‑responsive transcriptional repressor ComR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,175,448 | 1 | . | G | 98.9% | 2115.5 / 12.1 | 615 | pseudogene (485/632 nt) | comR | TetR family copper‑responsive transcriptional repressor ComR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/5); new base G (251/351); total (255/360) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 642 total aligned reads displayed.
CAGTTCGGGCCATAAACGCAAAGTCGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑C‑GGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAGTTGTTGATCATGAAG > NZ_CP025268/1175310‑1175582 | gTTCGGGCCATAAACGCAAAGTCGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCCGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑C‑ggg > 2:2102397/1‑139 (MQ=255) ttCGGGCCATAAACGCAAAGTCGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑C‑ggga > 2:432339/1‑138 (MQ=255) ttCGGGCCATAAACGCAAAGTCGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑C‑ggga > 1:7573705/1‑138 (MQ=255) ttCGGGCCATAAACGCAAAGTCGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑C‑ggga > 1:5550102/1‑138 (MQ=255) ttCGGGCCATAAACGCAAAGTCGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑C‑ggga > 1:2791739/1‑138 (MQ=255) aaaCGCAAAGTCGTTCCGGCCATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGACTTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCcgcg > 2:6512231/1‑140 (MQ=255) aaaCGCAAAGTCGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCcgcg > 2:5061262/1‑140 (MQ=255) aaaCGCAAAGTCGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCcgcg > 2:1786760/1‑140 (MQ=255) cGCAAAGTCGTTCCGGCAATCTGCATCAGTATTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCgcgcgc < 1:9717937/140‑1 (MQ=255) cAAAGTCGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCtt > 1:4877068/1‑140 (MQ=255) aaGTCGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGt > 1:7783734/1‑140 (MQ=255) cGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGtt < 1:511661/140‑1 (MQ=255) cGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGtt < 1:3952214/140‑1 (MQ=255) tCCGGCACTCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGAc > 2:1605789/1‑140 (MQ=255) tCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGAc < 1:10667650/140‑1 (MQ=255) aTCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATaaaaa < 2:10231281/140‑1 (MQ=255) cTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAAct < 1:3828663/140‑1 (MQ=255) cTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCAAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGGAG‑GGAGTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACAAAAAAAct > 2:5168606/1‑140 (MQ=255) gCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAActgc < 1:9356653/140‑1 (MQ=255) tCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGAAATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGAGGAGTCACGACACAGT‑GGGG‑CTGGATATCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACtgctgc > 1:10280577/1‑140 (MQ=255) cAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCa < 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tttCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTg < 1:5391374/140‑1 (MQ=255) tttCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTg < 2:4159480/140‑1 (MQ=255) tttCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTGGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTg < 1:7062971/140‑1 (MQ=255) tCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTgcg > 1:5183682/1‑140 (MQ=255) ccAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTgcgc < 2:8276822/140‑1 (MQ=255) cAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGct < 1:6036409/140‑1 (MQ=255) agccaagCACCTGCTCGGGCGCTGCTCGACAACCCCTCACTAATCCAATTAAGGAATTCAGCCAGAGGTGGCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCGAGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGAGCGctc < 2:7134671/134‑1 (MQ=255) aGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGTCATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGctc < 1:5296595/140‑1 (MQ=255) aGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGctc < 2:2552789/140‑1 (MQ=255) aGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGctc < 2:7616868/140‑1 (MQ=255) aGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGctc < 1:8220128/140‑1 (MQ=255) cTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGGTTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCa < 2:970387/140‑1 (MQ=255) cTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAAATAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCa < 2:7383194/140‑1 (MQ=255) tCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATg > 1:8818566/1‑140 (MQ=255) cgcgTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATgg > 2:2478441/1‑140 (MQ=255) gcgTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGc < 2:4399424/140‑1 (MQ=255) cgTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGGAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCg > 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cgcTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGAt > 1:8938274/1‑140 (MQ=255) cgcTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGAt > 1:1945024/1‑140 (MQ=255) cTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGAttt < 1:4096221/140‑1 (MQ=255) gATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCa < 2:6164387/140‑1 (MQ=255) aTCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCaa > 1:3008104/1‑140 (MQ=255) aTCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCaa > 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ttAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATc > 2:2426410/1‑140 (MQ=255) tAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTGGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCt < 2:3504752/140‑1 (MQ=255) aaTTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGga < 1:3236024/140‑1 (MQ=255) aaTTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATGTCCCCGCGCGCGTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGga < 2:10433964/140‑1 (MQ=255) ttCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGgaga < 1:3653051/140‑1 (MQ=255) ttCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGgaga > 1:799061/1‑140 (MQ=255) tGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAggg < 2:5270092/140‑1 (MQ=255) tGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAggg < 1:10773947/140‑1 (MQ=255) gCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGggt < 2:10600688/140‑1 (MQ=255) gATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGgtggtg < 2:6816520/140‑1 (MQ=255) gATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGgtggtg < 1:1536531/140‑1 (MQ=255) gATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGgtggtg > 1:1419525/1‑140 (MQ=255) gATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGgtggtg < 1:444589/140‑1 (MQ=255) gATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGgtggtg > 1:6810798/1‑140 (MQ=255) gATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGgtggtg < 2:1076862/140‑1 (MQ=255) gATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGgtggtg < 2:9551441/140‑1 (MQ=255) gATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGgtggtg < 2:220131/140‑1 (MQ=255) gATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGgtggtg < 1:10425755/140‑1 (MQ=255) gtgtCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCACAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAg < 2:7801045/140‑1 (MQ=255) gtgtCACGTCACAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAg < 1:2551293/140‑1 (MQ=255) gtcacgtcacAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAgtt > 2:1288247/1‑140 (MQ=255) gtcacgtcacAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAgtt > 2:5496499/1‑140 (MQ=255) tcacgtcacAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAgttg < 2:4874123/140‑1 (MQ=255) acgtcacAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAgttgtt < 2:2852180/140‑1 (MQ=255) acgtcacAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAgttgtt < 2:8063887/140‑1 (MQ=255) acgtcacAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAgttgtt < 1:7230329/140‑1 (MQ=255) acgtcacAGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAgttgtt < 2:5872940/140‑1 (MQ=255) gtctcAGTGGGGG‑G‑GGATGTCCCCGCGCGCGTGTCGTTGACATAACATCTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCATCGTATGGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAGTTGTTGa < 2:9375052/140‑1 (MQ=255) aGT‑GGGG‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGAGATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAGTTGTTGATCATg > 2:5377809/1‑140 (MQ=255) gggg‑CGGGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCACAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAGTTGTTGATCATGAag < 2:9873084/140‑1 (MQ=255) | CAGTTCGGGCCATAAACGCAAAGTCGTTCCGGCAATCTGCATCAGTTTTTCCAGCGATGCACCTTCGCGTGCGCTGATCGACATCCCCTGAATAATACAATTAAGGAATTCTGCCAGATGTGTCACGTCACAGT‑GGGG‑C‑GGATTTCCCCGCGCGCTTGTCGTTGACATAAAAACTGCTGCAAAGTGCGCTCTTGCATCGCATGGCGTGATTTCAACGTATTGGCGATATCTCCTGAATCTGGGGAGAGGGTGGTGCAGTTGTTGATCATGAAG > NZ_CP025268/1175310‑1175582 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |