| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,215,634 | +C | pseudogene (402/405 nt) | tfaP → | tail fiber assembly protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,215,634 | 1 | . | C | 99.6% | 2637.6 / 0.8 | 776 | pseudogene (402/405 nt) | tfaP | tail fiber assembly protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base C (485/288); total (487/289) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
Only 100 of 807 total aligned reads displayed.
GGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCAGA > NZ_CP025268/1215495‑1215767 | ggCAGTTTAATGCTGCTTTTGGAAGACTTAAAGAAGTTTAGATGAAACAATATTATTTGTTTCTTGATTATCTGGAAGCACTGGATCTGTTTTATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATCGCCTACGCCTCCGGCAGtt < 2:6508547/140‑1 (MQ=18)ggCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGtt > 1:8783760/1‑140 (MQ=255) ggTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGttcaggc > 1:6862419/1‑135 (MQ=255) aGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATCTAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTTCGCCTCCGGCAGTTCTGGCCAGa > 2:8606598/1‑140 (MQ=21) aGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGa > 2:9466591/1‑140 (MQ=255) aGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGa > 1:3481620/1‑140 (MQ=255) gCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACa < 1:10010833/140‑1 (MQ=255) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACAt > 1:3901010/1‑140 (MQ=255) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACAt > 2:5750031/1‑140 (MQ=255) cATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACAt > 1:8181842/1‑140 (MQ=255) aTTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATc < 1:4252877/140‑1 (MQ=255) aTTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATc < 1:10718863/140‑1 (MQ=255) ttGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATcc > 2:3540806/1‑140 (MQ=255) ggAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgc > 2:3313136/1‑140 (MQ=255) gAAGACTTAACGAAGATGAGCTGAAACAATATAATGTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCATATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:2692784/140‑1 (MQ=18) gAAGACTTAAAGACGATGAGCTGAAACAATATAAATTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCTGATATTGAATGGCCGACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:9894620/140‑1 (MQ=18) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:9696280/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:6968086/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:8862723/140‑1 (MQ=255) gAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 1:10153225/140‑1 (MQ=255) gAAGACTGAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGgcg < 2:7076997/140‑1 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 2:9757144/1‑140 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 2:7542234/1‑140 (MQ=255) aCTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGt > 2:177816/1‑140 (MQ=255) cTTAAAGAAGATGATCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTg < 2:1936503/140‑1 (MQ=255) cTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGTTTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTg < 2:4683941/140‑1 (MQ=255) cTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTg < 1:6642882/140‑1 (MQ=255) ttAAAGAAGATGAGCTGAAACACTATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGc > 2:5268681/1‑140 (MQ=255) aagaagATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTgg > 2:10838719/1‑140 (MQ=255) aagaagATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTgg > 1:6413340/1‑140 (MQ=255) gaagaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATACAGTGCGCCAGATATTGAAAGGCCTACGCCTCCGTCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTa > 1:2866362/1‑140 (MQ=17) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt > 1:4342178/1‑140 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt > 1:2512218/1‑140 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt > 2:2486140/1‑140 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt < 2:3218039/140‑1 (MQ=255) gaTGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCt < 1:4621947/140‑1 (MQ=255) tGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGt < 1:9062588/140‑1 (MQ=255) gAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGt > 1:443239/1‑140 (MQ=255) aCAATATCATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCCGTGCCCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCAc > 2:9152938/1‑140 (MQ=11) aCAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCAc < 2:10018795/140‑1 (MQ=255) tataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACcgcg > 2:5961972/1‑140 (MQ=255) tataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACcgcg > 1:1343990/1‑140 (MQ=255) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt > 1:10478813/1‑140 (MQ=255) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt < 2:16944/140‑1 (MQ=255) ataATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGt < 1:5999670/140‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGNACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATg < 1:5873757/140‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATg < 1:2225503/140‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATg < 1:9243165/140‑1 (MQ=255) ggCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACCTCCAGTGCGGCAGAGATTGTATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCCGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCACTGTTAt > 2:7880359/1‑140 (MQ=11) ggCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGAATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAAt > 2:6166922/1‑140 (MQ=255) gATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGc < 1:2015724/140‑1 (MQ=255) aTTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGca < 1:4885523/140‑1 (MQ=255) cTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCg < 2:8027615/140‑1 (MQ=255) cTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCg < 2:505514/140‑1 (MQ=255) aaGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACTCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCTGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTaa > 2:6336154/1‑140 (MQ=11) aaGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTaa > 2:3098461/1‑140 (MQ=255) aaGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTaa > 2:8413824/1‑140 (MQ=255) aaGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTaa > 1:5297959/1‑140 (MQ=255) aCTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCt > 2:4090781/1‑140 (MQ=255) cTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTg > 1:951929/1‑140 (MQ=255) ggTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTc > 2:37520/1‑140 (MQ=255) gTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTct > 1:1745723/1‑140 (MQ=255) gTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTct > 2:7269855/1‑140 (MQ=255) gTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTct > 2:9034321/1‑140 (MQ=255) tACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTctgcctg > 2:5350896/1‑140 (MQ=255) aCATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTctgcctgc > 1:1830988/1‑140 (MQ=255) aTCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGt < 1:5071274/140‑1 (MQ=255) aTCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGt < 1:8987083/140‑1 (MQ=255) aTCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGt < 1:8591481/140‑1 (MQ=255) ccAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCa > 1:7722722/1‑140 (MQ=255) ccAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCa > 1:7195633/1‑140 (MQ=255) ccAGTGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCa > 2:10579311/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGttt > 1:9415836/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGttt > 2:93091/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGttt > 2:1374443/1‑140 (MQ=255) cgcCAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTAc > 1:6188360/1‑140 (MQ=255) ccAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGt < 1:8923954/140‑1 (MQ=255) cAGATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTc < 1:7516055/140‑1 (MQ=255) gATATTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCg < 1:5565812/140‑1 (MQ=255) atatTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGGTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCgg > 1:7846058/1‑140 (MQ=255) atTGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGcc > 1:6097725/1‑140 (MQ=255) tGAATGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTg > 2:4346754/1‑140 (MQ=255) aaTGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCa > 2:2715200/1‑140 (MQ=255) aaTGGCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTGGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCa > 2:6894200/1‑140 (MQ=255) ggCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAAta > 2:7665371/1‑139 (MQ=255) ggCCTACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAAAGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAAtt > 2:817096/1‑140 (MQ=255) gcctACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAAttt > 2:38654/4‑140 (MQ=255) cctACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTCTCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTc > 2:10332209/3‑140 (MQ=255) cctACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTc > 2:667647/3‑140 (MQ=255) cctACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTc > 2:2262313/3‑140 (MQ=255) cctACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTc > 1:1129204/3‑140 (MQ=255) cctACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTGACGTCCGGCCTGCAATTTc > 1:4801838/3‑140 (MQ=255) tACGCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAg < 1:3349949/140‑1 (MQ=255) gCCTCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTg > 1:3114979/1‑140 (MQ=255) tCCGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAAt < 2:9609385/140‑1 (MQ=255) ccGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATc > 1:1581225/1‑140 (MQ=255) cGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 1:7382954/1‑140 (MQ=255) cGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 1:4128162/1‑140 (MQ=255) cGGCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCa > 2:5535564/1‑140 (MQ=255) ggCAGTTCAGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCAg < 1:7118921/140‑1 (MQ=255) | GGCAGGGTAAGGCTGCATTGGGAAGACTTAAAGAAGATGAGCTGAAACAATATAATTTGTGGCTGGATTATCTGGAAGCACTGGAACTGGTTGATACATCCAGTGCGCCAGATATTGAATGGCTTACGCCTCCGGCAGTT‑AGGCCAGATGACATCCGGCGCGGTGCTGGTATCTGTTGCCGTCACCGCGTCAATGTAATCCAGCACAGCGTTAAGTCTGGTTGTTTCTGCCTGCGTCAGTTTACGTCCGGCCTGCAATTTCAGTTGAATCAGA > NZ_CP025268/1215495‑1215767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |