| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,851,714 | +C | pseudogene (345/1502 nt) | uhpB ← | signal transduction histidine‑protein kinase/phosphatase UhpB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,851,710 | 1 | . | C | 99.2% | 1755.4 / 3.7 | 506 | pseudogene (349/1502 nt) | uhpB | signal transduction histidine‑protein kinase/phosphatase UhpB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/2); new base C (273/229); total (275/231) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 613 total aligned reads displayed.
GGCGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑CCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGTTAGCCAGT > NZ_CP025268/3851571‑3851844 | ggggagaTCGTGCAAGACCACAAGACATCTCGGTGCCAGTGTCAGGCCGCAAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTCAcgccg < 2:10401/137‑1 (MQ=255)ggCGTGATAGTGCCATAACACCAGACATTTCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACTGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgccg < 2:4111363/140‑1 (MQ=255)ggCGAGCTCGTGCCAGAACACCAGCCATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACCGCGCAGTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgccg < 2:9460437/140‑1 (MQ=255)ggCGAGATAGTGCCCCCACACCAGACAGCTCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAACGTCAGCAACAGCGCATTCCCCGACTCTGTGCCGTGCCACAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgccg < 2:1182591/140‑1 (MQ=255)ggCGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATCTCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTACAGTCAGAAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgccg < 2:3819100/140‑1 (MQ=255)ggCGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgccg < 2:4932425/140‑1 (MQ=255)ggCGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgccg < 2:5639308/140‑1 (MQ=255)ggCGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAAcgccg < 1:7290463/140‑1 (MQ=255) cGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGCCTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACgccg‑cc < 2:7332649/140‑1 (MQ=255) cGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACgccg‑cc < 2:2613897/140‑1 (MQ=255) cGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACgccg‑cc < 1:150762/140‑1 (MQ=255) cGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACgccg‑cc < 1:2365156/140‑1 (MQ=255) gagaTAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑ccc < 1:8827280/140‑1 (MQ=255) gagaTAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑ccc > 1:3234017/1‑140 (MQ=255) gagaTAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑ccc > 1:1054688/1‑140 (MQ=255) aTAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCATGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑ccccct > 2:4624009/1‑138 (MQ=255) tAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑ccccctg < 1:2217524/140‑4 (MQ=255) tAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑ccccctg < 1:6416017/140‑4 (MQ=255) tAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑ccccctg < 2:10895239/140‑4 (MQ=255) aGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑ccccctgt < 1:5196752/140‑5 (MQ=255) gCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCACCAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAAc > 2:6775140/1‑140 (MQ=255) ccAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCACCAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACa > 2:3919854/1‑140 (MQ=255) ccAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTg > 1:3931183/1‑140 (MQ=255) cAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTgc > 1:7449575/1‑140 (MQ=255) cAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTgc > 1:1273270/1‑140 (MQ=255) cAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTgc < 2:3733470/140‑1 (MQ=255) gACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTgcgc > 1:7749876/1‑140 (MQ=255) atCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCCCGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTc > 2:7062347/1‑140 (MQ=255) atCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTc > 1:5424777/1‑140 (MQ=255) ggggCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACg < 1:8276973/140‑1 (MQ=255) ggggCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACg > 1:6923177/1‑140 (MQ=255) ggggCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACg < 1:4224529/140‑1 (MQ=255) ggCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCt > 2:1696209/1‑140 (MQ=255) ggCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCt > 1:10159567/1‑140 (MQ=255) cAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑ccc > 1:2896592/1‑107 (MQ=255) gCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATgg > 1:7118601/1‑140 (MQ=255) gCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATgg > 1:252481/1‑140 (MQ=255) cGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGc > 1:2471674/1‑140 (MQ=255) cAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCCTTCCACGACTCTGTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTGAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGAt < 2:7957166/140‑1 (MQ=255) cAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGTCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGAt < 1:4067278/140‑1 (MQ=255) cAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGAt < 2:5411514/140‑1 (MQ=255) cAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGAt < 2:10190421/140‑1 (MQ=255) aGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACGGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCNAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATa > 1:5889887/1‑140 (MQ=255) cgccAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCACAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAgcgc < 2:6635034/140‑1 (MQ=255) cgccAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCATTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAgcgc < 1:5675705/140‑1 (MQ=255) ccAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCga > 2:9674996/1‑140 (MQ=255) ccAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCga < 2:8753879/140‑1 (MQ=255) ccAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCga > 2:4757288/1‑140 (MQ=255) cAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCgag < 1:4674571/140‑1 (MQ=255) tAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCa < 1:4294326/140‑1 (MQ=255) aaaaGTCAGCACCAGCGCAGTCCACGACTCATGGCCGGGCCAACGCCAGGGCAGCGACGGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCCCGGTGCGCCAGTCACGCGGAGGGCGATAGCGCGAGATCa < 2:10529560/139‑1 (MQ=255) tCAGCACCAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCt < 2:1074030/140‑1 (MQ=255) tCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCACAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCt < 2:1588555/140‑1 (MQ=255) tCAGCAACAGCGCAGTCCACGACTCTTTTCCGTGCCAAAGCCATGGCAGCGAGTGAAACAACGCCGCCGCCGTTATCGCCGCCCCCTGTTTCAGCAAGGTGCGACAGTCACGCAGATTGCGATAGCGCGAGATCAGCGCt < 2:1937456/140‑1 (MQ=255) aGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTAc < 2:3293325/140‑1 (MQ=255) aGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTAc < 2:2960323/140‑1 (MQ=255) aGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTAc < 2:5880302/140‑1 (MQ=255) cAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACgg > 1:1163861/1‑140 (MQ=255) cAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACgg > 2:232549/1‑140 (MQ=255) cAACAGCGCATACCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCCAGGAGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACgg > 2:5996494/1‑140 (MQ=255) gcgcATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGt < 1:10340739/140‑1 (MQ=255) cgcATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTa > 1:3575749/1‑140 (MQ=255) agcATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGAGTGAAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATTGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTa > 2:5097198/2‑140 (MQ=255) cATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAAc > 1:910510/1‑140 (MQ=255) cATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAAc > 1:4525811/1‑140 (MQ=255) ttCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGt < 2:2524065/140‑1 (MQ=255) ccACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCa < 1:9840590/140‑1 (MQ=255) ccACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCa < 1:7989482/140‑1 (MQ=255) aCGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGt < 1:9575890/140‑1 (MQ=255) cGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTa > 1:1886268/1‑140 (MQ=255) cGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGGAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCGGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTa < 2:3110271/140‑1 (MQ=255) gACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTaa > 1:6718618/1‑140 (MQ=255) aCTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTaaa < 2:285340/140‑1 (MQ=255) tttGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTAc > 1:7841113/1‑140 (MQ=255) tttGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTAc < 1:5024991/140‑1 (MQ=255) tttGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTAc < 2:5224258/140‑1 (MQ=255) tttGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTAc > 2:8282572/1‑140 (MQ=255) gCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGatcatc > 2:8525220/1‑140 (MQ=255) cAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGatcatcca > 2:7734502/1‑138 (MQ=255) ggCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGaaa > 1:8370363/1‑140 (MQ=255) gccAGCGACAGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTCACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCGACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGaaa < 2:8940484/138‑1 (MQ=255) cAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAAt < 1:8122363/140‑1 (MQ=255) cGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGACAATggg > 2:3566622/1‑140 (MQ=255) cGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATggg > 1:379952/1‑140 (MQ=255) gACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGt > 2:4544250/1‑140 (MQ=255) gACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGt > 2:1401350/1‑140 (MQ=255) gCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTaaa < 1:3702175/140‑1 (MQ=255) caacaaCGCCGCCGCCGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAac > 1:2014224/1‑140 (MQ=255) gccgccgccGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGc < 1:10000444/140‑1 (MQ=255) gccgccgccGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGc < 1:3087463/140‑1 (MQ=255) gccgccgccGTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGc < 2:4259713/140‑1 (MQ=255) ccgccgccgTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGcc > 1:1084520/1‑140 (MQ=255) gccgccgTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTg > 1:6118455/1‑140 (MQ=255) gccgTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCCGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGt > 2:5733627/1‑140 (MQ=255) cgTTAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGTTa < 1:9341371/140‑1 (MQ=255) tAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGTTAGcc < 2:7460611/140‑1 (MQ=255) tAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGTTAGcc < 2:9284098/140‑1 (MQ=255) tAACGCCGCCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCAGCGTTAGcc < 2:638119/140‑1 (MQ=255) cgccgcCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGTGATCAGCGATACGGGCAGTAACTTCAGTAAAATACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGTTAGCCAGt < 2:2146541/140‑1 (MQ=255) cgccgcCCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGTTAGCCAGt < 1:2788130/140‑1 (MQ=255) | GGCGAGATAGTGCCAGAACACCAGACATATCGGGGCCAGCGTCAGGCCGCCAGTTAAAGTCAGCAACAGCGCATTCCACGACTCTTTGCCGTGCCAAAGCCAGGGCAGCGACTGCAACAACGCCGCCGCCGTTAACGCCG‑CCCCTGTAACAGCAAGGTGCGCCAGTCACGCTGATGGCGATAGCGCGAGATCAGCGCTACGGGCAGTAACGTCAGTAAACTACCGATCATCAATAACGGAAAATGGGTTAAACCGACCGCCTGCGTTAGCCAGT > NZ_CP025268/3851571‑3851844 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |