| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 2,998,678 | 0 | T | C | 99.8% | 4064.3 / NA | 1174 | *410* (TAA→TAG) | CXP41_RS15650 | IS3‑like element IS2 family transposase |
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Only 100 of 1174 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) aaTGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCg > 1:3222996/1‑140 (MQ=255) gTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGa > 2:6329028/1‑43 (MQ=255) gTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAAt > 2:1152889/1‑140 (MQ=255) gTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAAt > 2:8188568/1‑140 (MQ=255) gTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGACGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACACAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAAt > 1:4453131/1‑140 (MQ=255) tAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGTCATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAAACCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTGATAATg > 2:1859487/1‑140 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |