| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,546,251 | A→G | *228* (TAA→TAG) | gntX → | DNA utilization protein GntX |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,546,251 | 0 | A | G | 99.8% | 2059.0 / NA | 592 | *228* (TAA→TAG) | gntX | DNA utilization protein GntX |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (244/347); minor base T (0/1); total (244/348) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 593 total aligned reads displayed.
TTGCCCGTGCAAGGTCGCCATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAAAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGGAAGAAGGGACACAAATCCGC > NZ_CP025268/3546114‑3546387 | ttGCCCGTGCAAGGTCGCCATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTagag < 1:4180818/140‑1 (MQ=255) gCCCGTGCAAGGTCGCCATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGcc < 1:9756852/140‑1 (MQ=255) gCCCGTGCAAGGTCGCCATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGcc < 1:4050738/140‑1 (MQ=255) gCAAGGTCGCCATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCgatg > 1:343669/1‑140 (MQ=255) cAAGGTCGCCATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCgatga < 2:6485082/140‑1 (MQ=255) gTCGCCATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATggg < 1:10270576/140‑1 (MQ=255) gTCGCCATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATggg < 2:4447857/140‑1 (MQ=255) gTCGCCATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATggg < 1:4489478/140‑1 (MQ=255) tCGCCCTCTGGCGCTTGTGGATGCGGTCGTTCCCACCGGAAGGACCGTCGCAGAGCTTGCGCCGTTGCATTTCCGCCATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCGGGTGCCTTTGTCGACCCGTGTAGAGCCTCGATGAGGGGc < 2:1431231/140‑1 (MQ=255) tCGCCATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGc < 2:1963157/140‑1 (MQ=255) ccATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGta > 2:10022058/1‑140 (MQ=255) cATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGtat < 2:8695101/140‑1 (MQ=255) cATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGtat < 1:7037116/140‑1 (MQ=255) ggTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATaa < 1:8791996/140‑1 (MQ=255) ggTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATaa < 1:9450132/140‑1 (MQ=255) ggTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATaa < 1:426882/140‑1 (MQ=255) gctGATTGTGGATGATGTCGCGACCCCCGGAAGAACCGTCGCAGACCTGCCGCCGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCGGACCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGCACCTTGTAGAGCCTCGATGATGTGCGTATTATaa < 2:8121415/138‑1 (MQ=255) gTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAAc > 1:7305857/1‑140 (MQ=255) gTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAAc > 2:2140149/1‑140 (MQ=255) tGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAAcc < 1:9179877/140‑1 (MQ=255) ttGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAAc > 1:10413699/1‑140 (MQ=255) ttGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAAc > 2:7368005/1‑140 (MQ=255) gtgGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTa > 2:5893302/1‑140 (MQ=255) tgGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTaa > 1:119285/1‑140 (MQ=255) gatgatGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTaaaa > 2:1223791/1‑140 (MQ=255) gatgatGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTaaaa < 2:1696709/140‑1 (MQ=255) gatgatGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTaaaa < 1:2840734/140‑1 (MQ=255) tgTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTc < 2:5150388/140‑1 (MQ=255) tgTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTc > 1:7477986/1‑140 (MQ=255) tgTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTc < 2:10775354/140‑1 (MQ=255) tgTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTc < 1:2748000/140‑1 (MQ=255) tgTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTc < 2:1831228/140‑1 (MQ=255) tgTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTc < 1:15710/140‑1 (MQ=255) tgTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTc < 1:2040428/140‑1 (MQ=255) tgTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTc < 1:2111554/140‑1 (MQ=255) tgTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCCAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTc < 1:10193825/140‑1 (MQ=255) tgTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGGTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTc < 2:4956261/140‑1 (MQ=255) tgTCGTTACCACCGGAACGACCGTCTCAGAGAGTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCATTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATGATAACCACCTAAAATAgac < 2:6958401/140‑3 (MQ=255) gTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCa > 2:3306805/1‑140 (MQ=255) gTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCa > 1:8944378/1‑140 (MQ=255) gTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCa > 1:10502918/1‑140 (MQ=255) tCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCaa < 1:7576182/140‑1 (MQ=255) cGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAAc > 2:6328818/1‑140 (MQ=255) tACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTAt < 1:1373969/140‑1 (MQ=255) tACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGGGCCTTGGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTAt < 1:263135/140‑1 (MQ=255) ccaccGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTa < 2:8310373/140‑1 (MQ=255) ccaccGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTa < 2:9757544/140‑1 (MQ=255) ccaccGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTa < 1:2465688/140‑1 (MQ=255) ccaccGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTa < 1:3371420/140‑1 (MQ=255) ccaccGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTa < 1:6150853/140‑1 (MQ=255) caccGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAg < 1:8421348/140‑1 (MQ=255) accGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAgg > 1:8091934/1‑140 (MQ=255) ccGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGc < 1:8250844/140‑1 (MQ=255) ccGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGc < 2:3858990/140‑1 (MQ=255) ccGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGc < 2:2698509/140‑1 (MQ=255) ccGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGc < 1:2554442/140‑1 (MQ=255) ccGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAAGGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGGCACCTATTAGGc < 2:725798/140‑1 (MQ=255) ggAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCa < 2:8474119/140‑1 (MQ=255) ggAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCa < 1:3244655/140‑1 (MQ=255) ggAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCa < 1:6871693/140‑1 (MQ=255) ggAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCa < 1:7740453/140‑1 (MQ=255) gAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCAt > 2:954023/1‑140 (MQ=255) aaGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCAtt < 1:1008772/140‑1 (MQ=255) aCCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCa < 2:286010/134‑1 (MQ=255) aCCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTa < 2:5473557/140‑1 (MQ=255) aCCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTa > 1:7949718/1‑140 (MQ=255) cGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATg < 1:484691/140‑1 (MQ=255) gTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGa > 2:3022791/1‑140 (MQ=255) gTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGa > 1:1771076/1‑140 (MQ=255) tCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGAt > 1:5563230/1‑140 (MQ=255) tCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGAt < 2:9209622/140‑1 (MQ=255) tCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGAt > 1:8691267/1‑140 (MQ=255) agagATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATNGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGt < 1:5885980/140‑1 (MQ=255) cgcAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGa < 2:3924275/140‑1 (MQ=255) cAGTTGCTTTTACGCCATGGTGCGGCGGCTGTCCACGTCCGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGGATTATCACCAACGACAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTCTGAACCGTATTTCCGAtg < 2:7749797/140‑1 (MQ=255) ttGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGAtgctg < 2:3399592/140‑1 (MQ=255) ttGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGAtgctg > 2:5677706/1‑140 (MQ=255) aCGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAgcg < 1:3886282/140‑1 (MQ=255) gCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCa < 2:8864831/140‑1 (MQ=255) tGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACttt > 1:10698881/1‑140 (MQ=255) cggcggCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTCTTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCaa > 2:1048690/1‑140 (MQ=255) gcTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAActgc > 1:4710064/1‑140 (MQ=255) gcTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATAATCACCAACAAAAAAAGTCAACTAATAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCAGATGCTGCACAAGCGCACAATGCCAAActgc > 2:6252597/1‑140 (MQ=255) tGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATaa < 1:10014812/59‑1 (MQ=255) tCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGc < 2:6825219/140‑1 (MQ=255) tCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGc < 1:2288476/140‑1 (MQ=255) ggTGCCTTTGTCGTACCTTGTAGAGCCTCGATGAGGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTTCTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGga < 2:7481341/140‑1 (MQ=255) ggTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGga < 2:7631193/140‑1 (MQ=255) ggTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGga < 1:6546439/140‑1 (MQ=255) ggTGCCTGTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGga < 2:6087245/140‑1 (MQ=255) gTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAATCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGgaa > 2:4005902/1‑140 (MQ=255) gTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGgaa > 2:4742641/1‑140 (MQ=255) gTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGgaa > 1:5687836/1‑140 (MQ=255) gTGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGgaa > 1:9914734/1‑140 (MQ=255) tGCCTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGgaag < 1:10889933/140‑1 (MQ=255) cTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGGaagaag < 2:3684158/140‑1 (MQ=255) cTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGGaagaag < 1:5251883/140‑1 (MQ=255) cTTTGTCGAACCTTGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGGaagaag < 2:9111125/140‑1 (MQ=255) aCCTTGTAGAGCCTCGATGTTGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAAGCAGGACGAAGGGACACaaa > 2:4215703/1‑140 (MQ=255) tGTAGAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGGAAGAAGGGACACAAATCcg > 1:8860897/1‑140 (MQ=255) | TTGCCCGTGCAAGGTCGCCATATGGTGATTGTGGATGATGTCGTTACCACCGGAAGTACCGTCGCAGAGATTGCGCAGTTGCTTTTACGCAATGGTGCGGCGGCTGTCCAGGTCTGGTGCCTTTGTCGAACCTTGTAAAGCCTCGATGATGGGCGTATTATAACCAACTAAAATAGTCAACTATTAGGCCATTACTATGATCCGTATTTCCGATGCTGCACAAGCGCACTTTGCCAAACTGCTGGCAAATCAGGAAGAAGGGACACAAATCCGC > NZ_CP025268/3546114‑3546387 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |