| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,769,101 | A→G | *281* (TAA→TAG) | yibA → | HEAT repeat domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,769,101 | 0 | A | G | 99.9% | 2328.0 / NA | 672 | *281* (TAA→TAG) | yibA | HEAT repeat domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (475/196); minor base T (1/0); total (476/196) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 672 total aligned reads displayed.
ACTGTTTATGATGATATCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAACGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACCGTGGA > NZ_CP025268/3768964‑3769237 | aCTGTTTATGATGATATCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCg < 1:6884193/140‑1 (MQ=255) tttATGATGATATCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAg > 2:9778108/1‑140 (MQ=255) ttATGATGATATCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGt < 2:5401868/140‑1 (MQ=255) ttATGATGATATCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGt < 1:10918121/140‑1 (MQ=255) ttATGATGATATCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGt < 2:7976432/140‑1 (MQ=255) atgatgATATCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTg < 2:953455/140‑1 (MQ=255) tgatgaTATCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGc < 1:6073077/140‑1 (MQ=255) atgatATCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCt < 1:8422936/140‑1 (MQ=255) atatCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATg < 2:7618680/140‑1 (MQ=255) tatCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGc > 1:9071597/1‑140 (MQ=255) tatCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGc > 1:3575305/1‑140 (MQ=255) tatCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGc > 1:6550400/1‑140 (MQ=255) tatCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGc > 1:6737641/1‑140 (MQ=255) tatCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAAAATCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGATCATAGCGTGAGTTGCCTATGc > 1:2308671/1‑140 (MQ=255) atCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGca < 2:2846195/140‑1 (MQ=255) cATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGcaca < 1:10829466/140‑1 (MQ=255) tGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTg > 1:2623700/1‑140 (MQ=255) gtaGCGGCGGGTGAATTAGGTGTTACAACGCTCCTTCCTGTTTTAGATTCGATGGTGGACAAGTTTGCTGACAATGATCTTATAACTTCCGCTAGTGATAAGGTGATGCGTTGCTCGCGTGAGTTGCCTATGCACAgggg > 2:6694042/3‑140 (MQ=255) aaGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTggg > 2:5020150/1‑140 (MQ=255) aGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTgggg > 1:10259969/1‑140 (MQ=255) gCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTggggg > 1:7802149/1‑140 (MQ=255) gCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTggggg > 2:4655523/1‑140 (MQ=255) gCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTggggg > 1:10662410/1‑140 (MQ=255) tGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGAt > 2:6919879/1‑140 (MQ=255) tGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGAt > 1:3262274/1‑140 (MQ=255) cGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGcac > 2:1404675/1‑128 (MQ=255) cGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGca < 1:9931060/127‑1 (MQ=255) cGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTc > 2:555000/1‑140 (MQ=255) cGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTc > 2:2186478/1‑140 (MQ=255) cGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTc > 1:4241487/1‑140 (MQ=255) ttAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGc > 2:526252/1‑140 (MQ=255) tAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCa < 1:344102/140‑1 (MQ=255) tAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCa < 1:5382410/140‑1 (MQ=255) tAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCa < 1:9205500/140‑1 (MQ=255) tAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCa < 1:4999773/140‑1 (MQ=255) tGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGt > 2:233842/1‑140 (MQ=255) tGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGt > 2:5752689/1‑140 (MQ=255) tAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCa > 2:8172336/1‑140 (MQ=255) cTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTc > 1:5123717/1‑140 (MQ=255) aCTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTCTTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGa > 2:1204732/1‑140 (MQ=255) cTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGAc < 2:2959268/140‑1 (MQ=255) tGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGcg > 1:3701459/1‑139 (MQ=255) tGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCt > 1:1295150/1‑140 (MQ=255) ttttAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTgg > 1:5775552/1‑140 (MQ=255) gATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGt < 1:7603018/140‑1 (MQ=255) aTACTATGTTGTACAAGTTTGAGGACAATGAAAGTATAACTTCCGCTATTGATCAGCTGAAGCGTGCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACCGGGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTg > 2:5142881/1‑140 (MQ=255) aCTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCTCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGCTTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGaa > 2:9845275/1‑140 (MQ=255) tATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAACGTGAAAt > 2:6263279/1‑140 (MQ=255) tATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAAt > 2:10272223/1‑140 (MQ=255) tATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAAt > 1:5257534/1‑140 (MQ=255) tATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAAt > 2:4371364/1‑140 (MQ=255) tATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAAt > 2:3070693/1‑140 (MQ=255) tATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAAt > 2:2739659/1‑140 (MQ=255) tATGTTGTACAAGGTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCCGATGCTCGTCCGGCGGGAACGTGAAAt > 2:7309463/1‑140 (MQ=255) tgttgtACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATcc > 1:460686/1‑140 (MQ=255) tACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCt > 1:9378496/1‑140 (MQ=255) tACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCt > 1:1427923/1‑140 (MQ=255) tACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCt > 1:2409816/1‑140 (MQ=255) tACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCt < 1:4764191/140‑1 (MQ=255) tACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCt > 1:5660831/1‑140 (MQ=255) tACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCt > 1:6393064/1‑140 (MQ=255) tACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCt < 1:6932442/140‑1 (MQ=255) cAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGa < 2:8551158/140‑1 (MQ=255) acggttGATGACAATGAGATTATAACTTCCGCGATGGATAAGCGGAAGCGTGCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGGGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCTGAGGCGCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGAc > 2:4043718/5‑140 (MQ=37) aaGTTTGATGACACTGAAATTATAACTTCCGCTAGTGATAAGCTGATGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACCGTGGGGGAGTCCCGCCGGCACGGTGCCGATGCTCGACCGGCTGGTACGTGAAATCCTGGCTgcc > 2:9224569/1‑138 (MQ=255) gTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCAGAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCg > 2:10882235/1‑140 (MQ=255) gTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTg < 2:10477646/136‑1 (MQ=255) gTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCg > 2:2524730/1‑140 (MQ=255) gTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCg > 1:1983253/1‑140 (MQ=255) gTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCg > 2:8355007/1‑140 (MQ=255) gTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCg > 2:6346141/1‑140 (MQ=255) gTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCg > 1:7509378/1‑140 (MQ=255) gTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCg > 2:1638155/1‑140 (MQ=255) tttGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTCTGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCgg < 1:3114011/140‑1 (MQ=255) tttGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGAGTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCgg < 1:1699956/140‑1 (MQ=255) ttGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCggg > 1:7221782/1‑140 (MQ=255) tgatgaCAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGt > 2:9396588/1‑55 (MQ=255) atgaCAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgtga > 2:8870447/1‑140 (MQ=255) atgaCAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgtga > 1:10460055/1‑140 (MQ=255) atgaCAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgtga > 1:4492459/1‑140 (MQ=255) aaTGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGtgagtgag > 2:7755656/1‑140 (MQ=255) aaTGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGtgagtgag > 1:9719097/1‑140 (MQ=255) aaTGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGtgagtgag > 1:8178800/1‑140 (MQ=255) aaTGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGtgagtgag > 2:3818631/1‑140 (MQ=255) aaTGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGAGAAATCCTGGCTGACCGGGtgagtgag > 1:391686/1‑140 (MQ=255) ttCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATGGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCgctg > 2:1961351/1‑140 (MQ=255) ccGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCgctggc < 1:2812698/140‑1 (MQ=255) cGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCgctggct > 1:10010617/1‑140 (MQ=255) cGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCgctggct > 1:9567852/1‑140 (MQ=255) cGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCgctggct > 2:10537171/1‑140 (MQ=255) cTGAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGc > 1:6657616/1‑140 (MQ=255) gAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGTCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCt > 2:2000661/1‑140 (MQ=255) gAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCt > 2:5973043/1‑140 (MQ=255) gAAGCGTTCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCt < 1:8784171/140‑1 (MQ=255) ttCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGGAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACCGt > 1:8244366/1‑140 (MQ=255) ttCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGACAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACCGt > 2:4204136/1‑140 (MQ=255) tCATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACCGTg < 2:338606/140‑1 (MQ=255) cATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACCGTgg > 2:711644/1‑140 (MQ=255) cATAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACCGTgg > 2:364829/1‑140 (MQ=255) aTAGCGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACCGTGGa < 1:7317891/140‑1 (MQ=255) | ACTGTTTATGATGATATCATTGAAGCTGCGGGTGAATTAGGTGATAAAACGCTACTTCCTGTTTTAGATACTATGTTGTACAAGTTTGATGACAATGAAATTATAACTTCCGCTATTGATAAGCTGAAGCGTTCATAACGTGAGTTGCCTATGCACAGTGGGGGATTCCCGCCGGCACGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACCGTGGA > NZ_CP025268/3768964‑3769237 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |