| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,965,748 | T→C | H134R (CAC→CGC) | gppA ← | guanosine‑5'‑triphosphate,3'‑diphosphate diphosphatase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,965,748 | 0 | T | C | 99.7% | 2458.3 / NA | 702 | H134R (CAC→CGC) | gppA | guanosine‑5'‑triphosphate,3'‑diphosphate diphosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (381/319); minor base A (1/1); total (382/320) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 705 total aligned reads displayed.
CCTGCCCCAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGTGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCAA > NZ_CP025268/3965611‑3965883 | ccTGCCCCAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGgcgc < 2:4312831/140‑1 (MQ=255) gCCCCAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGa < 1:10566189/140‑1 (MQ=255) cccAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATc < 2:7259462/140‑1 (MQ=255) aGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGc < 1:4047597/140‑1 (MQ=255) aGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGc < 1:2650889/140‑1 (MQ=255) atgaCGAGCGGCAAAAGAGCGTTCCAGCCCGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcac < 2:7969948/137‑1 (MQ=255) aTTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcac < 1:6100285/140‑1 (MQ=255) aTTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcac < 1:7185016/140‑1 (MQ=255) aTTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcac < 1:6993607/140‑1 (MQ=255) aCGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGcaccac < 2:1949029/140‑1 (MQ=255) gATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCAccacca > 2:7532965/1‑140 (MQ=255) cGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGGTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAgtg < 2:3143513/140‑1 (MQ=255) ggCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAgtgg > 2:7404958/1‑140 (MQ=255) ggCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAgtgg > 2:8493555/1‑140 (MQ=255) ggCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAgtgg > 1:10013598/1‑140 (MQ=255) ggCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAgtgg > 2:1186298/1‑140 (MQ=255) gCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAgtggt > 1:2266073/1‑140 (MQ=255) cAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGGTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAgtggtg < 2:9678325/140‑1 (MQ=255) ttCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGc > 1:1010435/1‑140 (MQ=255) ttCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGc < 2:2737474/140‑1 (MQ=255) tCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGcc < 2:10490274/140‑1 (MQ=255) gTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAAt > 1:3558578/1‑140 (MQ=255) tGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATc > 2:8950493/1‑140 (MQ=255) tGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATc > 1:6881728/1‑140 (MQ=255) gACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCa < 2:669521/140‑1 (MQ=255) aCGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGc > 2:354714/1‑104 (MQ=255) cGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGa > 2:1507208/1‑140 (MQ=255) cGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGa < 1:4878149/140‑1 (MQ=255) cccATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGc > 2:4241935/1‑140 (MQ=255) ccATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCt < 1:9701602/140‑1 (MQ=255) aTCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTc < 1:3740817/140‑1 (MQ=255) aTCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTc < 2:3336644/140‑1 (MQ=255) cAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGNACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCtt < 1:6670665/140‑1 (MQ=255) ggCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGa > 2:6923190/1‑116 (MQ=255) gCTGAACAAGGAGGTGGTTTTTGCAGCCGTGCCGGATACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTTTATCATCCTCCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGGGAGCAACGCCCTGATAAAGGAGACGTGCTGCCTCTTctc > 2:9544734/1‑138 (MQ=255) gCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCAc < 2:5760149/140‑1 (MQ=255) gCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCAc < 1:7491921/140‑1 (MQ=255) gCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCAc > 2:7147224/1‑140 (MQ=255) gCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTGCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCAc < 2:9732162/140‑1 (MQ=255) tGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCg > 1:9351517/1‑140 (MQ=255) aacaacGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCt > 1:4542199/1‑140 (MQ=255) acaacGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTg < 1:1645598/140‑1 (MQ=255) caacGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGa < 1:5967147/140‑1 (MQ=255) aacGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGAt < 2:5306193/140‑1 (MQ=255) cGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCa > 1:8515330/1‑140 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTTCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc < 2:9296651/140‑1 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc < 1:7883021/140‑1 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc < 1:919483/140‑1 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc < 1:5078228/140‑1 (MQ=255) gAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCAc < 2:1688453/140‑1 (MQ=255) ggtggtTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCt > 2:10286245/1‑140 (MQ=255) tggtTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGt > 1:7267159/1‑140 (MQ=255) tggtTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGt > 2:5516130/1‑140 (MQ=255) tgtgCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCgg > 1:1170288/1‑140 (MQ=255) tgtgCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCgg > 1:6277440/1‑140 (MQ=255) gtgCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGa < 1:10386888/140‑1 (MQ=255) tgCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGAc > 2:4915319/1‑140 (MQ=255) cACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACaa > 1:8327897/1‑140 (MQ=255) aCCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATCTCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGGGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACaag > 2:8178035/1‑139 (MQ=255) aCCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAACTCAGACTTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCTGACAAc < 2:5017180/140‑1 (MQ=255) aCCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAAc > 1:4236595/1‑140 (MQ=255) ccGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCCGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCg > 1:1716169/1‑140 (MQ=255) cGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCga > 1:542495/1‑140 (MQ=255) cGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCga > 1:7707864/1‑140 (MQ=255) cGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCga > 2:3827554/1‑140 (MQ=255) tGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGAt < 1:3226824/118‑1 (MQ=255) tGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCgaga > 2:8845726/1‑140 (MQ=255) ccGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCgagact > 2:10627476/1‑138 (MQ=255) ccGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAAt > 2:3260283/1‑140 (MQ=255) gTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTGCACCGCTGATCACCTGTACCGGACTCCCTAGAATTTc > 2:7745749/1‑140 (MQ=255) ttACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTcc < 1:3827554/140‑1 (MQ=255) tACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCt > 1:57335/1‑140 (MQ=255) cAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTgcg > 2:4502320/1‑140 (MQ=255) gTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCt < 1:4756753/140‑1 (MQ=255) cAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTg < 1:8852852/140‑1 (MQ=255) cAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGCGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTg > 1:9055904/1‑140 (MQ=255) tACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCa > 2:4726772/1‑140 (MQ=255) tACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTACCTGCGCTTTGGCa > 1:10304474/1‑140 (MQ=255) gaCTCGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCa < 2:20935/139‑1 (MQ=255) gCTCCGCCTATGTCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 1:9532024/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTcc < 2:6113442/123‑1 (MQ=255) gCTCCGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATaaa > 1:5652014/1‑140 (MQ=255) gCTCCGCCTATAACCACCAGCAGGCTCTGATCGGCACCACCATTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGATTACTCTTCACCGCTGATCACCTGTCACGTACAACCGAGAATTTCCTGAGCTTTGGCAATaaa > 2:8296723/1‑140 (MQ=255) ccGCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATc > 1:2014568/1‑140 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAc > 2:10119753/1‑140 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAc > 1:1358311/1‑140 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAc > 1:8059825/1‑140 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAc > 1:10792808/1‑140 (MQ=255) gCCTATATCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCAc > 1:2845352/1‑140 (MQ=255) tataTCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCg > 1:3428053/1‑140 (MQ=255) tatCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCa > 2:1289005/1‑140 (MQ=255) atCCACCACCAGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCGGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCAt < 1:7623680/140‑1 (MQ=255) accaccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGAc > 1:6438777/1‑140 (MQ=255) caccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACgg > 1:186020/1‑140 (MQ=255) caccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACgg > 2:5194631/1‑140 (MQ=255) caccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACgg > 2:3983033/1‑140 (MQ=255) caccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACgg < 2:2816661/140‑1 (MQ=255) caccaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACgg > 2:2302838/1‑140 (MQ=255) accaGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGc < 2:6399314/140‑1 (MQ=255) caGGCGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCaa > 2:9184489/1‑140 (MQ=255) | CCTGCCCCAGATTACGATCGGCAAAATAGCGTTCCAGCCAGGTGACGCAGCCCATCGACAGGCTGAACAACGAGGTGGTTTGTGCACCCGTGCCGGTTACCAGTTCAGTACTGGCTCCGCCTATATCCACCACCAGGTGCTGATCGGCACCACCAGTGGTGTGAGCAACGCCCTGATAAATCAGACGTGCTTCCTCTTCACCGCTGATCACCTGTACCGGACAACCGAGAATTTCCTGCGCTTTGGCAATAAAATCACCCGCATTGACGGCAA > NZ_CP025268/3965611‑3965883 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |