| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,396,984 | T→C | G331G (GGT→GGC) | nnr → | bifunctional ADP‑dependent NAD(P)H‑hydrate dehydratase/NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,396,984 | 0 | T | C | 99.5% | 2264.1 / NA | 653 | G331G (GGT→GGC) | nnr | bifunctional ADP‑dependent NAD(P)H‑hydrate dehydratase/NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (410/238); minor base A (2/1); total (414/239) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 654 total aligned reads displayed.
CGAGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGTCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCATCCTG > NZ_CP025268/4396847‑4397120 | aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc > 1:9223951/1‑140 (MQ=255) aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc > 2:10075061/1‑140 (MQ=255) aGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAAGTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGc > 2:4023578/1‑140 (MQ=255) aCTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAag < 1:2819793/140‑1 (MQ=255) cTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAaga > 1:1230037/1‑140 (MQ=255) tGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAagag < 1:6247764/140‑1 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATNAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 1:5899330/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAagagg > 2:6476645/1‑139 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 1:10577768/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 1:8769829/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 1:6978723/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 1:5447035/1‑140 (MQ=255) gACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGt > 2:8026401/1‑140 (MQ=255) aCCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCTCGACCGGAATTGAGGGTGCATGAACTGACGATGGAATCTCTTCGCGAAAGCCTGGAATGGGCCGTTGTGGTGGGGATTGGTCGCGGGCTGGGCCAGCACGAGTg > 2:4824622/1‑140 (MQ=255) aCCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTg > 1:1409268/1‑140 (MQ=255) aCCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGGCTGGGCCAGCAAGAGTg > 2:940848/1‑140 (MQ=255) cccGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTgg < 1:5779587/140‑1 (MQ=255) cGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCACGAGTgggg > 2:7071881/1‑140 (MQ=255) gCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGACTTGTTGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTggggg > 2:7495980/1‑140 (MQ=255) cAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCCTGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑a > 2:9552983/1‑140 (MQ=255) cAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGAGGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑a > 2:776811/1‑140 (MQ=255) tGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑aaaa < 2:10269594/140‑1 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCa > 2:9661005/1‑140 (MQ=255) gcgcCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCa > 1:3611049/1‑140 (MQ=255) gccgcTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCaaa > 1:2111345/1‑140 (MQ=255) tGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAtt > 2:5816085/1‑140 (MQ=255) cACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCGCGGTCTGGGCCAGAAAGTGTGGGGG‑ACAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAtttt > 2:1246408/1‑140 (MQ=255) cACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAtttt > 1:2347771/1‑140 (MQ=255) cGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCg < 1:7241667/140‑1 (MQ=255) gACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGc > 1:8442646/1‑140 (MQ=255) aCCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCa < 1:1824635/140‑1 (MQ=255) cGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCACAAAGTTGAGAATTTTCGCaaa > 2:4611540/1‑140 (MQ=255) cGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCaaa < 1:5156150/140‑1 (MQ=255) ggAATTGATGGTTCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAAc < 1:7641227/140‑1 (MQ=255) gAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCACAAAGTTGAGACTTTTCGCAAAcc > 2:3201980/1‑140 (MQ=255) gAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAAcc > 2:1393486/1‑140 (MQ=255) aaTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGACTTTTCGCAAACCg < 1:8527930/140‑1 (MQ=255) aaTTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCg < 2:2067364/140‑1 (MQ=255) tgctGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAtg < 1:4912690/137‑1 (MQ=255) gttGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAtgt < 1:7516221/138‑1 (MQ=255) aTGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGAtgt‑t > 2:3312911/1‑140 (MQ=255) gTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑tgtg < 1:3396171/140‑1 (MQ=255) tGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGAGTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTgg > 2:5734254/1‑140 (MQ=255) gCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTggg > 2:10507140/1‑140 (MQ=255) cATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGa < 1:9636865/140‑1 (MQ=255) cATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGa < 1:4064219/140‑1 (MQ=255) cATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGa < 1:641761/140‑1 (MQ=255) cATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGGGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCACGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCACACCGATGT‑TGTGGGa < 2:509061/140‑1 (MQ=255) aTGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGGAAAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGa < 2:5234113/140‑1 (MQ=255) acagACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAAAGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATATTCGCAAACCGAGGT‑GGTGGGATGCCg < 2:4145197/137‑1 (MQ=255) aCTGACGATGGACTCTCTGACCGACCGCCAGGAATGGGCCGCTGTGGCGGTGATGGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAACAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGAGGCCg < 2:2784204/140‑1 (MQ=255) cTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGa < 1:5354479/140‑1 (MQ=255) tGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGAt > 1:4633783/1‑140 (MQ=255) gACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGGGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATg > 2:1933219/1‑140 (MQ=255) gACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGaa < 1:2310813/140‑1 (MQ=255) aCTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAAc < 1:4536085/140‑1 (MQ=255) aCTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAAc > 2:2634198/1‑140 (MQ=255) ctctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTTGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAAcc < 2:6855512/140‑1 (MQ=255) ctctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAAcc > 1:8239048/1‑140 (MQ=255) ctctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAAcc > 1:5504608/1‑140 (MQ=255) ctctTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACctg > 1:3092971/1‑140 (MQ=255) aaaGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCg < 1:6647626/117‑1 (MQ=255) aaaGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑AGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatc > 2:9879104/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 2:10728880/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa > 1:2009832/1‑140 (MQ=255) aGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaa < 1:8998292/140‑1 (MQ=255) gCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaat < 2:3639749/140‑1 (MQ=255) gCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGcaatcaat < 2:6666202/140‑1 (MQ=255) ccTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCATGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGTACCTGCTGGCaatcaatc > 2:9740883/1‑140 (MQ=255) ggAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCg > 2:233221/1‑140 (MQ=255) aTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATa < 2:1572441/140‑1 (MQ=255) aTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATa < 2:8136480/140‑1 (MQ=255) aTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATa < 1:2703686/140‑1 (MQ=255) aTGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATa < 1:3994533/140‑1 (MQ=255) gggCCGAAGAGGTGGTGATTGGGCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAAAGTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCAGTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAg < 2:7639360/140‑1 (MQ=255) ggCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGc > 2:9112716/1‑140 (MQ=255) gCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCg > 2:1774704/1‑140 (MQ=255) gCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCg < 1:7940950/140‑1 (MQ=255) gCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCg < 1:8145567/140‑1 (MQ=255) gATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTca < 1:9898035/140‑1 (MQ=255) tgtgGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTcaca > 1:4776403/1‑140 (MQ=255) tggtgATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATcgc < 2:8505981/140‑1 (MQ=255) gtgATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGt < 1:4299561/140‑1 (MQ=255) gATTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGa < 2:8971096/140‑1 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCCAGAGTGGGGG‑AAATAAGCACTGCAAAAAGTTGAGACTGTGCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCACTCACTCCCGAACAGCGTCACAATCGCGTGAt > 2:6375933/1‑140 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACctgctg < 2:450583/105‑1 (MQ=255) aTTGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGAt > 1:3252155/1‑140 (MQ=255) ttGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATc > 2:7159881/1‑140 (MQ=255) tgttCCCGGTCTGGGCCAGCAAGGGTGGGTG‑AAAAAAGCACTGCAAACAGTTGCGAATTTTCGC‑AAGCGGTGTGTGTGGGATGCCGATGCATTGACCCTGCTGGCAATCATTCCCGATAAGCGTCCCAGGCGCGTGATCa > 2:3839618/4‑140 (MQ=255) tGGTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCa > 1:8571663/1‑140 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGNCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcg > 1:9407805/1‑140 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcg < 1:10074078/140‑1 (MQ=255) gTCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcg < 1:1540977/140‑1 (MQ=255) tCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgc > 1:7784155/1‑140 (MQ=255) tCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgc > 1:6756849/1‑140 (MQ=255) tCCCGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgc > 2:6085417/1‑140 (MQ=255) cccGTTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGACCGCCAACTAGTTGAGCATTTTCGCAAACCCATGT‑TGTGGGACGCCGATGCATGGAACCTGCTTGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcggc < 2:8302092/140‑3 (MQ=255) cccGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgcc < 2:5511602/140‑1 (MQ=255) cGGTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCAcgccgc > 1:10892945/1‑140 (MQ=255) gTCTGGGCCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCAt > 1:7450626/1‑140 (MQ=255) | CGAGTACTGACCCGCAGTGAAAACATTGCGCCGCTGCTGACTGCACGACCGGAATTGATGGTGCATGAACTGACGATGGACTCTCTTACCGAAAGCCTGGAATGGGCCGATGTGGTGGTGATTGGTCCCGGTCTGGGTCAGCAAGAGTGGGGG‑AAAAAAGCACTGCAAAAAGTTGAGAATTTTCGCAAACCGATGT‑TGTGGGATGCCGATGCATTGAACCTGCTGGCAATCAATCCCGATAAGCGTCACAATCGCGTGATCACGCCGCATCCTG > NZ_CP025268/4396847‑4397120 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |