| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,598,944 | 0 | C | . | 95.3% | 2524.9 / 107.3 | 592 | pseudogene (3963/5423 nt) | CXP41_RS08400 | ECSE_1600 family autotransporter |
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Only 100 of 682 total aligned reads displayed.
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2:435977/1‑140 (MQ=255) ccgccgATAGGGGGTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCGCCAGGCCTAACGTTCATATCACCTGCTGTGGTGTCATTTCCCGTCATCACACGGCTGTTATGGATTTTAATGTGTTGTGTTGGCCTATTATTGGCTGAGTggg > 2:3835508/1‑140 (MQ=255) cgccgATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTATTGTGTTGTCTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGa > 2:6351456/1‑140 (MQ=255) tAGTGGTTTTCGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGaa < 1:189054/140‑1 (MQ=255) gTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAg < 1:5182166/140‑1 (MQ=255) tGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCACGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGc > 2:3545620/1‑140 (MQ=255) 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1:7395981/1‑140 (MQ=255) | AACGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGCCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCAC > NZ_CP025268/1598805‑1599078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |