| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 939,446 | (A)7→8 | intergenic (‑289/‑255) | trxB ← / → lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 939,439 | 1 | . | A | 96.0% | 3591.2 / 112.4 | 966 | intergenic (‑282/‑262) | trxB/lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (11/28); new base A (265/661); total (276/690) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 1197 total aligned reads displayed.
CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑AA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCT > NZ_CP025268/939300‑939571 | ctGCTACTTAAATGTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTNATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa‑g > 1:6159866/1‑140 (MQ=255) tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa‑g‑a > 1:3016297/1‑140 (MQ=255) tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa‑g‑a > 2:3372913/1‑140 (MQ=255) tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa‑g‑a > 1:4492817/1‑140 (MQ=255) tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa‑g‑a > 1:6926926/1‑140 (MQ=255) tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa‑g > 1:2060135/1‑139 (MQ=255) aattAATTTTCCCTCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa < 1:1477346/138‑1 (MQ=255) tAATTTTCCCGCTGTCTAAGCCGATTAAATGATGAATAACGGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCCTGTTGTACTAAAAATCGATGTATTGCTTTTACAATCCCATGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑T‑aa‑a‑aa‑aat < 2:1760147/140‑2 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:139463/140‑2 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa > 2:3961990/1‑139 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa > 2:4584925/1‑139 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:5006784/140‑2 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:3490698/140‑2 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:6264685/140‑2 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 1:7087454/140‑2 (MQ=255) tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:3140199/140‑2 (MQ=255) tAAATTGCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATATGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTTCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:6765296/140‑2 (MQ=255) attttACCTCTTTATAATCCGATTAATTGATGAATAAACGCCCCTTTTAATGAATATCTGGCATGCTTTACTAATAATCGATGTTTTTCTGTGACAATCCCCTGGTGTTTTTCGAAAACATTCGATGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaaca < 2:84750/138‑4 (MQ=255) aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaaca < 1:3451506/140‑4 (MQ=255) aaTTTCCCCGTTTTTATGCAGATTAACTGATCAATAAACTCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCTATGTTTTTCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTTCTAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaaca < 1:7356993/140‑4 (MQ=255) aTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaacag > 1:4835583/1‑136 (MQ=255) aTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaaca < 1:9693569/139‑4 (MQ=255) tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaacagt < 1:10706942/140‑6 (MQ=255) tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGACATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaacagt < 1:1843475/140‑6 (MQ=255) cccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTAtt < 2:10955715/140‑1 (MQ=255) cccGATTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTAtt < 2:1457619/140‑1 (MQ=255) ccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 1:8344045/132‑2 (MQ=255) tttATAATACGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCACTGGTGTTTTTCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTtat < 2:8096251/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTtat < 2:6413823/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTtat < 1:5933187/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTtat < 1:4672139/140‑1 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTtat < 1:2814938/140‑1 (MQ=255) tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTatat < 2:2091669/140‑1 (MQ=255) tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTatat < 1:6693228/140‑1 (MQ=255) tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTatat < 2:6045877/140‑1 (MQ=255) aaGCCGATTAAATGATGACTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTATTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATgcg < 2:8971859/140‑1 (MQ=255) aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATgcg < 1:781493/140‑1 (MQ=255) aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATgcg < 1:4021431/140‑1 (MQ=255) aGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATgcgc < 2:3724657/140‑1 (MQ=255) gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCa < 2:1977459/140‑1 (MQ=255) gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCa < 1:1042725/140‑1 (MQ=255) ccGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCAt < 2:7423584/140‑1 (MQ=255) ccGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCAt < 2:11447852/140‑1 (MQ=255) ttAAATGATTAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCa < 1:5497459/135‑1 (MQ=255) ttAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa > 1:570084/1‑115 (MQ=255) aaaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACcat > 1:8130062/1‑140 (MQ=255) catgatgAATAAACGCCCCTGTTAATGAATCTCTGGCAAGTTGTACTAAAAATCGATGTATTGCTTAGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGATGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTAGACTTATATGCGCATAACcatg < 2:486613/139‑1 (MQ=255) aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:1178742/140‑1 (MQ=255) atgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgcatg < 1:9286149/140‑1 (MQ=255) aaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAACAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑AA‑A‑AATAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTaa < 2:10496935/140‑1 (MQ=255) tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 2:5623853/140‑1 (MQ=255) aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 1:2386724/140‑1 (MQ=255) aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 2:440378/140‑1 (MQ=255) aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGATTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 1:6433578/140‑1 (MQ=255) aCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAcc > 1:9048882/1‑140 (MQ=255) aCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAcc < 2:10807105/140‑1 (MQ=255) tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCAt < 1:5060239/135‑1 (MQ=255) tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa < 1:5819497/140‑1 (MQ=255) tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTGTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGCA‑G‑AA‑ATAA‑TACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGtttc > 2:9615284/1‑139 (MQ=255) tGTTAATGAATATCTGGCATGGTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGtata > 2:7233898/1‑140 (MQ=255) tAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCg < 2:7703811/140‑1 (MQ=255) tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:11122732/111‑1 (MQ=255) tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 2:5125752/140‑1 (MQ=255) tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 1:5330269/140‑1 (MQ=255) tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 2:2391350/140‑1 (MQ=255) tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt > 2:4179079/1‑140 (MQ=255) tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 1:11533732/140‑1 (MQ=255) atCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTg > 1:11358988/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCa < 2:11204268/101‑1 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTg < 1:3676724/133‑1 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:2237510/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:3225246/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa < 1:7963447/140‑1 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:10846948/1‑140 (MQ=255) tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:2942922/82‑2 (MQ=255) tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 1:1000225/140‑1 (MQ=255) tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 2:10291412/140‑1 (MQ=255) ggCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt < 2:701279/111‑1 (MQ=255) ggCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAAt < 2:9435313/140‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:8888432/140‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:2262451/140‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:8501670/140‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGAATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:8600026/140‑1 (MQ=255) gtACTAAAAATCGATGTTGTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAt < 2:9243995/140‑1 (MQ=255) tACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATg > 2:5453972/1‑140 (MQ=255) cTAAAAATCGATGTTGTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTATTATATGCGCATAACCATGCATGGAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAACACTACCTATGGc > 2:8857203/1‑140 (MQ=255) tAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCg < 2:3252022/140‑1 (MQ=255) tAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCg < 1:10155405/140‑1 (MQ=255) aaTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGa > 1:9488197/1‑140 (MQ=255) tCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACa < 2:5818881/140‑1 (MQ=255) cGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTatat > 2:9782823/1‑74 (MQ=255) gATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGATAAAACATTAGATGAATA‑AA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCTTGGACAGa < 2:2639274/140‑1 (MQ=255) gCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTc < 1:4276375/140‑1 (MQ=255) ggTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑AATA‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGcag > 1:2602595/1‑138 (MQ=255) tttGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCcaca < 1:3910879/140‑1 (MQ=255) ttGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAACTACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACaa > 1:8683872/1‑140 (MQ=255) ttGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGAGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACaa > 2:8331719/1‑140 (MQ=255) tGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTtat < 1:7633931/40‑1 (MQ=255) aaaCATTCGAGGAN‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAAc > 1:9975678/1‑140 (MQ=255) gAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCAGCCCCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGtcttct < 1:1298226/140‑1 (MQ=255) | CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑AA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCT > NZ_CP025268/939300‑939571 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |