| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,013,520 | +G | pseudogene (463/542 nt) | zapC → | cell division protein ZapC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,013,518 | 1 | . | G | 97.9% | 1964.6 / 28.9 | 579 | pseudogene (461/542 nt) | zapC | cell division protein ZapC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/8); new base G (297/269); total (301/278) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 639 total aligned reads displayed.
ATGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCC > NZ_CP025268/1013379‑1013652 | tGCCGGGCGCTGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACGATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGGTGTGATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑g > 2:4213882/1‑140 (MQ=255) ccGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑ggg < 1:4078033/140‑2 (MQ=255) ccGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑ggg < 2:201679/140‑2 (MQ=255) ccGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑ggg < 2:5485377/140‑2 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑gggcga < 1:5853663/140‑5 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑gggcga < 1:5611728/140‑5 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑gggcga > 1:8547214/1‑136 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATTCCGCACTAAGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCa > 1:1174219/1‑140 (MQ=255) ccTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTaaa > 2:3443307/1‑140 (MQ=255) tGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAAt > 2:137741/1‑140 (MQ=255) gCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATc < 1:8949822/140‑1 (MQ=255) gTTTGGTTGAGCTATACTCACGAGCAGGTCAAGTTGCTGGTCGTTTAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTTTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCAt < 1:9150138/140‑1 (MQ=255) gTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAAACTGGCGAAAATGCCGCTCTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCAt < 1:6899273/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGTCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 2:8117140/140‑1 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 1:6441834/140‑1 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGCTGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 2:6642125/1‑140 (MQ=255) tACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGa > 2:1823300/1‑140 (MQ=255) aCTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCTCTATGCCTGCTGGGACAACCCTGCGGTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCC‑GATG‑GGCGACGCCATTACAATCATGAACGAGAGGCTGaa > 2:5190409/1‑140 (MQ=255) aCTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGaa > 2:847331/1‑140 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCTAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCAAAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 1:2350659/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:8949697/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:9067329/140‑1 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTATAATCATGAACGACAGGCTGTAACCGCAGGt > 1:10381745/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:7408420/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt < 2:4808013/140‑1 (MQ=255) aGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGtt < 2:565544/140‑1 (MQ=255) ggTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTa > 1:449257/1‑140 (MQ=255) ggTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTa > 1:11358670/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:809383/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑gggcga > 1:5034659/1‑94 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGACGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGTCAGGCTGAAACCGCAGGTTat > 2:7560969/1‑139 (MQ=255) aTTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGtt < 2:9854867/140‑1 (MQ=255) aTTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGtt > 1:3196100/1‑140 (MQ=255) tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc > 2:7840054/1‑140 (MQ=255) gCTGGTCGGTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTGGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCAGTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTgccc > 2:3302119/1‑137 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 1:3656284/1‑140 (MQ=255) ggTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCt < 1:7446695/140‑1 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 1:7321310/140‑1 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 1:4246724/140‑1 (MQ=255) cGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCa < 2:6146479/140‑1 (MQ=255) cGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCa < 2:2463180/140‑1 (MQ=255) tGGCGAACATGCCGCCCTATGGCTGCTGGCACAACCCTGCGTGGTTATTGCGGGTCGCGCGTTGGAGG‑TG‑GGCGACGCCCTTAAAATCATGAACGACAGGCAGTAACCGCAGGTTTTTGTGGACAGCGTCAGCCTCGGAc > 2:11505284/1‑140 (MQ=255) gCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAg > 1:544030/1‑140 (MQ=255) aTGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGtc > 2:369849/1‑139 (MQ=255) acACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAACATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAAcg > 2:10426279/2‑140 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:1005220/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 2:2958913/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 1:9941979/1‑140 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa < 1:4924160/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa < 1:8354113/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGAGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCaa > 2:5326825/1‑140 (MQ=255) ctgctgGCACAACCCTGCGTTGTTATT‑‑‑‑‑‑‑GCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 1:6016479/140‑1 (MQ=255) gctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTaa > 1:8708970/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCGTCGAACAGGCAGTCTATCGCGCCAACTTAAGTg > 1:11222019/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg > 1:9233437/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 2:5806516/140‑1 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGGTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGGCTAACGCGCCAACTTAAGTg > 1:4671237/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 1:9766086/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:495639/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:450065/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:2589606/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:9593752/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:9220489/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:7840598/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:6553184/1‑140 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGCAACCGCAGGTTAATGTTGTCAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTCAGTGCAGt < 2:1632739/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:2269040/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:3056897/140‑1 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 2:11021417/140‑1 (MQ=255) gttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTac < 1:9079783/140‑1 (MQ=255) gttgttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTac < 1:3284255/140‑1 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 1:7082387/1‑125 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:3819062/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:6971705/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:1417635/1‑140 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGc < 1:3480341/140‑1 (MQ=255) tATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGc < 2:11387025/140‑1 (MQ=255) aTTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCt > 1:10611649/1‑140 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:9342676/140‑1 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:7244363/140‑1 (MQ=255) tGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTAc < 1:7121934/140‑1 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 1:6691862/1‑140 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 2:6867660/1‑140 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACa > 2:2215884/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 1:3118584/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa < 2:10575717/140‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa < 1:7644788/140‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa > 1:9440967/1‑140 (MQ=255) gTCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTACAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTATTGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaa < 2:2787368/140‑1 (MQ=255) tCGCTCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTACAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCTGGTTAAGGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTACCGCGCCCACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGATACAGCaaa > 2:6364569/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaag > 2:10110635/1‑139 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:6261831/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 2:5941721/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 2:3944151/1‑140 (MQ=255) gcgcgATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGa < 1:11420333/140‑1 (MQ=255) cgcgATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa > 1:1892874/1‑140 (MQ=255) gcgATGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAAt < 1:1660611/140‑1 (MQ=255) tGCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACTCAGCTACAGCAAAGAATGGTg < 2:4648749/140‑1 (MQ=255) gCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAGTCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGc < 1:3777006/140‑1 (MQ=255) gCA‑G‑TTGGGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTACCGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGc < 2:8788240/140‑1 (MQ=255) | ATGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCA‑G‑TT‑GGCGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGCC > NZ_CP025268/1013379‑1013652 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |