| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | 1292725 = | 684 (1.000) | 222 (0.380) | 70/232 | 2.6 | 39.8% | intergenic (+182/+2) | narI/CXP41_RS06830 | respiratory nitrate reductase subunit gamma/RtT sRNA |
| ? | NZ_CP025268 | = 1293258 | 92 (0.160) | intergenic (‑44/+3) | CXP41_RS06840/CXP41_RS06845 | RtT sRNA/tRNA‑Tyr | |||||
Only 100 of 401 total aligned reads displayed.
CGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGA > NZ_CP025268/1293120‑1293396 | cGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTg > 1:1327536‑M2/1‑139 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTga > 2:2135319‑M2/1‑138 (MQ=255) cccTTCGGGTCGTGGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGATTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgat > 2:11011051‑M2/1‑137 (MQ=255) ttCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCGTAGTCGAAGCGTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCGTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggt < 2:9089445‑M2/140‑7 (MQ=255) cGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTATTCGATGATTCTCATACTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtgg > 1:3883045‑M2/1‑132 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggt > 1:172844‑M2/1‑131 (MQ=255) ggtgcCTGCGGCAACGCTCTCTCCCTGACGCACGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAANATTTTATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:6166068‑M2/3‑126 (MQ=255) ggtgcCCGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCGTAGTCGAAGCTGCTCATCCTTCCCCGCTTTGGCAGAATATTTGCTTGCGGATACGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:7812235‑M2/3‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:4481558‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:7117382‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:4894728‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:5159034‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:1002434‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:3807236‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:8220916‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:7831342‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:711929‑M2/1‑126 (MQ=255) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGTCA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaa < 2:7697174‑M2/140‑17 (MQ=255) cTGCGTCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCTTGCCGAACCTTTGTCGTAGCTTCTGATCCTTCCCCGATTGGGCAGATTATTTTATTTCGTATTAGCTTGAGT‑GTTCTGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGa < 1:4320238/140‑1 (MQ=11) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 1:5360074‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 2:3162780‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCGTCGTCGAAGCGTCTCCGCCGTCCCCGCATGGGCAGACTATTTGAGTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGACAGTgatggtggtgggggaagga > 2:10281486‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCACTCTCGCTGACGCTCGAGCCGCACCTGAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGACTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAACGTgatggtggtgggggaagga > 2:5717363‑M2/1‑121 (MQ=255) cacGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTGAGTCGACTCTTCTCATCCTTCCCCGCAAGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtgctgggggaaggattactca > 2:1868225‑M2/2‑114 (MQ=255) ctctcGCTGACGCTCGAGCCGACCCTTAGTCGAAGCTTCACCTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctg > 1:8394095‑M2/1‑108 (MQ=255) ctctcGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGAGTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctg > 2:3277574‑M2/1‑108 (MQ=255) ctctcGCTGACGCTCGAGCCGAACCTGAGTCGAAGCTTCTCCTCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctg > 2:1493334‑M2/1‑108 (MQ=255) ctcGCTGCCGCTCCAGGCGAACCTTCGTCGAAGCGTCTCCTCCTTCCCCGCTGGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGTCTTTTGAAAGTgatggtggggggggaaggattactcagcgctgcg > 1:318126‑M2/1‑106 (MQ=255) ctcGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcg < 2:9269392‑M2/140‑35 (MQ=255) tGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCATGGTCTTTTGAACCTgctggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgctt > 2:2870003‑M2/1‑101 (MQ=255) ccgctCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCAGCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGAGTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGCAAGAgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcg > 1:2311503‑M2/2‑99 (MQ=255) gcTCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGA‑ATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACg > 2:4633627/1‑140 (MQ=14) tCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAGGGGCAGAATATTTACTAGCGGATGCG‑TTGGGACGTTCAGGGACGTTGGAATGTGATGGTGGTGGGGGGAGGATTAGAACCTTCGAAGTAGATGACGGc > 1:3051480/1‑140 (MQ=2) tCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgagagcttcgccca < 2:10572070‑M2/140‑46 (MQ=255) gAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCGTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttc > 1:6960663‑M2/1‑93 (MQ=255) agtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagagcggcgcccatcgcgcgtggggtagttgccg < 1:8536477‑M2/138‑60 (MQ=255) gtcGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctg < 1:10032914‑M2/139‑61 (MQ=255) gAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcgg < 1:11192910‑M2/140‑64 (MQ=255) gAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcg < 1:1916206‑M2/118‑42 (MQ=255) gAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAGATTGTATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAATGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgatgcgagcttcgcacttggggtcggtgcgtgcgg < 2:4329933‑M2/140‑64 (MQ=255) aaGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCCGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggacggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggc < 2:2057192‑M2/140‑65 (MQ=255) aGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgaggca < 2:11487034‑M2/140‑66 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATAGTTGATTGCGGATTCGCTTGAGC‑GTTCAGGGACTGTTGACAGTgatggtggggggggacggattactcagcgctgcgcgcttcgcccgtcgggtcgttgccggcggcaa < 2:1075005‑M2/140‑67 (MQ=255) cTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaac > 2:11341833‑M2/1‑73 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgct < 2:4174334‑M2/140‑71 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCGTGAGA‑GTTCCGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgccctgcgggtcgttgcctgcggcatcgct < 1:6886219‑M2/140‑71 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAATGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgc < 1:6426254‑M2/140‑78 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgccggcggcaacgctctctcgc < 2:959978‑M2/140‑78 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATAGTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagagcttcgcgcttcgccctacgggtcgatgcctgccgcaacgctctctcgc < 2:11563191‑M2/140‑78 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagagctgagaccttctcccttcgggtcgttgcatgaggcaacgctctctcgct < 2:4758263‑M2/140‑79 (MQ=255) gCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAAccc > 1:1467070/1‑140 (MQ=255) cttggGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGA‑ATTCAGGGGCTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgct > 1:8472977‑M2/3‑56 (MQ=255) aTGGGCATCTTCTTTGATTGCGGCTGCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctc > 2:9834432‑M2/1‑55 (MQ=255) aTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctc < 2:1356840‑M2/140‑86 (MQ=255) aTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttg > 1:4738018‑M2/1‑55 (MQ=255) gggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgctcgcttcgcacttcgggtcgttgcatgcggctacgctctctcgctggcgcacga < 2:8586262‑M2/140‑88 (MQ=255) gggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgtttcctgcggcaacgctctctcgctggcgcacca < 1:357697‑M2/140‑88 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgtttcctgcggcaacgcgctcgcgctggcgcgcgag < 1:10566522‑M2/140‑89 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgag < 1:11563176‑M2/140‑89 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgatctctcgctgtcgctcgag < 2:5464540‑M2/140‑89 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcatcgcccttcgggtcgtggcctgcggcaaccctctctcgcaggcgctcgag < 1:2885810‑M2/140‑89 (MQ=255) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattcctcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgatgcctgcggcaaagctctctcgctggcgcgcgagt < 2:5288680‑M2/140‑90 (MQ=255) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgaggcaacgcactctcgctggcgctcgagt < 2:3573665‑M2/140‑90 (MQ=255) tttGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaacctt < 1:11457942‑M2/140‑98 (MQ=255) ttGATTGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcga < 2:5755648‑M2/134‑93 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga < 2:6484037‑M2/140‑104 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagagctgcgcgcttcgcccttcgggacgttgcctgaggcaacgatctctcgcttgcgctcgaatcgaaccttagtcga < 2:7407325‑M2/140‑104 (MQ=255) gCGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGATAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaa > 1:2729125‑M2/1‑36 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAGA‑GTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggacggattactcagcgcggcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaaagctctatcgctggcgctcgagtcgtaccgtggtcgaag < 1:8139056‑M2/140‑106 (MQ=255) 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1:7189029/140‑1 (MQ=255) cAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttgggcgaatcttcaaatccttccccgc < 1:573469‑M2/140‑124 (MQ=255) cAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCATATTGTGTGGTAATGATTGAGAtg > 1:9338980/1‑140 (MQ=255) cAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtg < 2:10132479/140‑1 (MQ=255) cAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtg > 2:1634060/1‑140 (MQ=255) aGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgca > 2:6836354‑M2/1‑16 (MQ=255) 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1:7425980‑M2/140‑130 (MQ=255) cTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggc > 2:4960178‑M2/1‑11 (MQ=255) tattgaAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggca > 1:8000340‑M2/3‑10 (MQ=255) tttGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcag < 1:7536430‑M2/140‑132 (MQ=255) tttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggg > 2:805196/1‑140 (MQ=255) ttGAAAGTgatggtggtgggggcaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcggtgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccgtggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggcaga > 1:10981843‑M2/1‑8 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |