| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 678,922 | A→G | R123G (AGG→GGG) | ybeU → | DUF1266 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 678,922 | 0 | A | G | 99.8% | 1987.6 / NA | 573 | R123G (AGG→GGG) | ybeU | DUF1266 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (369/203); minor base T (0/1); total (369/204) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 576 total aligned reads displayed.
CATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGAGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGG > NZ_CP025268/678784‑679058 | gCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGttt < 2:5688540/140‑1 (MQ=255) gCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGttt > 1:5099500/1‑140 (MQ=255) gCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGttt < 1:1250630/140‑1 (MQ=255) gCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGttt < 2:4604205/140‑1 (MQ=255) ccccTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCa > 1:7822225/1‑140 (MQ=255) ccTGAAGAGTGGAAAGCATTAAGTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑g < 2:10789920/140‑1 (MQ=255) tGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑ggg > 1:666457/1‑140 (MQ=255) tGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑ggg < 2:7727449/140‑1 (MQ=255) gAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGt > 1:2218095/1‑140 (MQ=255) aaGAGTGGAAAGCATTAGTTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTc > 2:9851874/1‑140 (MQ=255) aaGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTc > 1:7156724/1‑140 (MQ=255) aaGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTc > 1:9801486/1‑140 (MQ=255) aaGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTc > 1:3420596/1‑140 (MQ=255) aaGAGGGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTGTCTGTCAC‑GGGTc > 1:10793654/1‑140 (MQ=255) agagTGGATATCATTAATTGCTTGTGGGTCGGAGAGTGTGTTGATTTTTTCACAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGTAGGGTGTATGAAAGCCTTGGTTTATGTTAGTATGTTTTTTCTGTAAC‑GGGTCg < 2:10951932/140‑1 (MQ=255) gagTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCgg > 2:4899827/1‑140 (MQ=255) agTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGgt < 2:3508092/140‑1 (MQ=255) gTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGgtg > 1:9093479/1‑140 (MQ=255) gTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGgtg < 2:5248915/140‑1 (MQ=255) gTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGgtg < 2:1471129/140‑1 (MQ=255) tGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGgtgt > 1:8896006/1‑140 (MQ=255) tGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGgtgt > 1:305412/1‑140 (MQ=255) aGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGtgtg > 2:5989627/1‑136 (MQ=255) aGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGAGTATGTTCGAATGGGGTGTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTca > 1:5378920/1‑140 (MQ=255) cATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTcaac > 2:6930705/1‑140 (MQ=255) tAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAg > 1:1108684/1‑140 (MQ=255) tggtggCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGa > 2:3197956/1‑140 (MQ=255) tggtggCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGa > 1:5876657/1‑140 (MQ=255) tggtggCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGa > 1:10594191/1‑140 (MQ=255) ggtggCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGAc > 1:8012305/1‑140 (MQ=255) ggtggCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGAc > 1:7291665/1‑140 (MQ=255) tCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGgaaga > 1:6465396/1‑140 (MQ=255) cGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGgaagaa > 1:10009441/1‑140 (MQ=255) cGGAGAGAGGGTGGATTTATACCCTATTCGTTGCCCAATCCGCTATGTTCTGTGGGGTAGGGGGAATCATAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGgaagaa < 2:11388024/140‑1 (MQ=255) gagagaGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAagaaga < 1:11174732/140‑1 (MQ=255) gagagaGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAagaaga < 2:8528287/140‑1 (MQ=255) gggTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGttt > 1:2830223/1‑140 (MQ=255) ggTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTa > 2:2578709/1‑140 (MQ=255) gTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTAt < 1:1826340/140‑1 (MQ=255) tataCCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGttt > 2:8171198/1‑131 (MQ=255) ataCCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCaa < 2:4071188/140‑1 (MQ=255) taCCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAAt > 2:3893271/1‑140 (MQ=255) taCCCAATGCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGATGAGAGTTTATGGCTGCAAt > 2:6359023/1‑140 (MQ=255) cAATTCGTTGCCCAAACCGCTTTGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGTATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcg < 1:9425010/140‑1 (MQ=255) cAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcg < 2:1843134/140‑1 (MQ=255) cAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcg < 2:1108684/140‑1 (MQ=255) cAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcg < 1:4830845/140‑1 (MQ=255) cAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcg < 2:8012305/140‑1 (MQ=255) aaTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGATGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTGTGTTCGCATGGGGTTTCTGTGAC‑GGGTCGGGGTGCTCTAGAGGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTGTATGGGTGGAATcgcgg > 2:11202870/1‑139 (MQ=255) aaTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcgc < 1:2299339/140‑1 (MQ=255) aaTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcgc > 1:8723232/1‑140 (MQ=255) aaTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcgc < 2:6978352/140‑1 (MQ=255) aaTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGATGCAATcgcgc > 2:8399090/1‑140 (MQ=255) aaTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGAGTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGGCGGTGTGCTCAACCAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCTATcgcgc > 2:1383160/1‑140 (MQ=255) aTTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCTC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCACTcgcgcg > 2:6652226/1‑140 (MQ=255) ttCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGt > 1:6537099/1‑140 (MQ=255) ttCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGt < 2:726015/140‑1 (MQ=255) gTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTa > 1:173746/1‑140 (MQ=255) tGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGACTGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATg > 2:6817989/1‑140 (MQ=255) gCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGt > 1:9593601/1‑140 (MQ=255) aaCCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGTGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAg < 2:5110743/140‑1 (MQ=255) aCCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGc > 1:3783045/1‑140 (MQ=255) aCCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGc > 1:8493562/1‑140 (MQ=255) cTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCAc < 2:2493695/140‑1 (MQ=255) aTGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCACTCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCa > 2:5473183/1‑140 (MQ=255) gtgCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCAtt > 1:4341261/1‑140 (MQ=255) cTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACt > 1:4638814/1‑140 (MQ=255) tgtgGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCACTCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTa > 2:1044117/1‑140 (MQ=255) tgtgGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTa > 1:10251562/1‑140 (MQ=255) gtgGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTAt > 1:9265882/1‑140 (MQ=255) ggggAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcgc > 1:1986354/1‑111 (MQ=255) ggggAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATca > 2:2296364/1‑140 (MQ=255) ggggAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATca < 1:5542804/140‑1 (MQ=255) ggggAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATca > 1:6247152/1‑140 (MQ=255) gAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAg < 1:3622443/140‑1 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGc > 1:9904003/1‑140 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGc > 2:7194514/1‑140 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGc > 1:6850481/1‑140 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGc > 1:3949759/1‑140 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGc > 1:827713/1‑140 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGc > 2:10672745/1‑140 (MQ=255) aaGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGc > 2:9063745/1‑140 (MQ=255) gggggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCTGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTg > 2:4319334/1‑140 (MQ=255) gggggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTg > 2:11589879/1‑140 (MQ=255) ggggAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTgg > 2:200702/1‑140 (MQ=255) gAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATg < 1:5993045/140‑1 (MQ=255) aaTCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCACGGGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATg > 1:11388917/1‑140 (MQ=255) aTCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCa > 1:7553866/1‑140 (MQ=255) ggATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCg > 2:7532786/1‑140 (MQ=255) ggATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCg > 1:3521628/1‑140 (MQ=255) ggATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCg > 2:1748907/1‑140 (MQ=255) gATTATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGc < 2:1011765/140‑1 (MQ=255) tATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTa < 1:4548594/140‑1 (MQ=255) tATGTTCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTa > 2:3417685/1‑140 (MQ=255) tCGAATGGGTTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGGGTCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTACGTACGAGCTCAACATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGt < 1:401839/140‑1 (MQ=255) tCGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGt < 1:2497271/140‑1 (MQ=255) cGAATGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGtt > 2:9681970/1‑140 (MQ=255) aaTGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATcgcg > 2:8880447/1‑75 (MQ=255) aaTGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAg < 2:9373540/140‑1 (MQ=255) aaTGGGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAg < 2:288757/140‑1 (MQ=255) | CATCGCTCTTCCCCTGAAGAGTGGAAAGCATTAATTGCTGGTGGCTCGGAGAGAGGGTTGATTTATACCCAATTCGTTGCCCAAACCGCTATGTGCTGTGGGGAAGGGGGAATCAAAGCCTGGGATTATGTTCGAATGAGGTTTCTGTCAC‑GGGTCGGTGTGCTCAACAAGTGGCTGACGGAAGAAGAGAGTTTATGGCTGCAATCGCGCGTCTATGTACGAGCTCACCATTACTATCACAGCTGGATGCACTATTTTTCCGCCTATTCGTTAGG > NZ_CP025268/678784‑679058 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |