| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,101,377 | 0 | T | C | 99.6% | 1471.0 / NA | 460 | *388* (TAA→TAG) | CXP41_RS05705 | IS3‑like element IS3 family transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (275/182); minor base G (2/0); total (277/183) | |||||||||||
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Only 100 of 460 total aligned reads displayed.
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(MQ=17) ttttGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGccc > 1:1495041/1‑140 (MQ=14) ttttGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGccc < 2:10607179/140‑1 (MQ=14) ttttGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCCTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGccc < 1:1306609/140‑1 (MQ=14) cttattatGGACACTGGACTATGAGAGGTTCTTGTTTTCATATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCTACTGTGCCGCCGCCAACGATTGTAATCACATTCGATATACTTAAACACCGTTTCCCGCTTTATTTCCCGGc < 2:7027211/135‑1 (MQ=1) | ATCGACTGGCTGATAACGCACTTTACGAGGCGAAAGAGACCGGGCGTAATAAGGTGGTTGTGAGGGATGTGGTGAATTTTTGTGAGTCACCATAAAGCGGCATTTTGATCCTACCCACGTAATATGGACACAGGCTTAAGCGAGGTTCTTGTTTTCAAATTGTTCCGGACTGAGGCCGCCACACCAACTGTGCCGCCGCCACCGATTGTAATCACATTCGATATAATTAAACACCGTTGCCCGCATTATTTCCCGGCTGATAAAGTGT > NZ_CP025268/1101242‑1101509 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |