| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 111,264 | A→G | *130* (TAA→TAG) | mutT → | 8‑oxo‑dGTP diphosphatase MutT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 111,264 | 0 | A | G | 99.8% | 1576.6 / NA | 453 | *130* (TAA→TAG) | mutT | 8‑oxo‑dGTP diphosphatase MutT |
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 453 total aligned reads displayed.
TGGCTGGTCGAACGCTGGGAAGGGGAGCCGTGGGGTAAAGAAGGGCAACCCGGTGAGTGGATGTCGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACGTCTGTAAGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCTTATCAGGCCTAAAGGGATTTCTAACTCATTGATAAATTTGTTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACG > NZ_CP025268/111127‑111399 | tGGCTGGTCGAACGCTGGGAAGGGGAGCCGTGGGGTAAAGAAGGGCAACCCGGTGAGTGGATGTCGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACGTCTGTAGGt < 1:7402502/140‑1 (MQ=255)tGGCTGGTCGAACGCTGGGAAGGGGAGCCGTGGGGTAAAGAAGGGCAACCCGGTGAGTGGATGTCGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACGTCTGTAGGt < 2:2998218/140‑1 (MQ=255)tGGCTGGTCGAACGCTGGGAAGGGGAGCCGTGGGGTAAAGAAGGGCAACCCGGTGAGTGGATGTCGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACGTCTGTAGGt > 2:2090504/1‑140 (MQ=255) gCTGGTCGAACGCTGGGAAGGGGAGCCGTGGGGTAAAGAAGGGCAACCCGGTGAGTGGATGTCGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACGTCTGTAGGTCa > 1:9869762/1‑140 (MQ=255) 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1:5612365/140‑1 (MQ=255) tGCGAAGCTTAAACGTCTGTAGGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCTTATCAGGCCTAAAGGGATTTCTAACTCATTGATAAATTTGTTTTTGTAGGt < 1:3955337/140‑1 (MQ=255) tGCGAAGATTAAACGTCTGTAGGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCTTATCAGGCCTAAAGGGATTTCTAACTCATTGATAAATTTGTTTTTGTAGGt < 2:245031/140‑1 (MQ=255) gCGAAGCTTAAACGTCTGTAGGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCTTATCAGGCCTAAAGGGATTTCTAACTCATTGATAAATTTGTTTTTGTAGGTc < 1:11329429/140‑1 (MQ=255) aGCTTAAACGTCTGTAGGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCTTATCAGGCCTAAAGGGATTTCTATCTCATTGATAAATTTGTTTTTGTAGGTCGGag > 2:6110533/1‑139 (MQ=255) aGCTTAAACGTCTGTAGGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCTTATCAGGCCTAAAGGGATTTCTAACTCATTGATAAATTTGTTTTTGTAGGTCGGAt < 2:8553879/140‑1 (MQ=255) ttAAACGTCTGTAGGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGTACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCTTATCAGGCCTAAAGGGATTTCTAACTCATTGATAAATTTGTTTTTGTAGGTCGGATAAg < 2:8683795/140‑1 (MQ=255) gTCTGTAGGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCTTATCAGGCCTAAAGGGATTTCTAACTCATTGATAAATTTGTTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTc < 1:5968139/140‑1 (MQ=255) tGTAGGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCTTATCAGGCCTAAAGGGATTTCTAACTCATTGATAAATTTGTTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCAcg > 1:7126748/1‑140 (MQ=255) tGTAGGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCTTATCAGGCCTAAAGGGATTTCTAACTCATTGATAAATTTGTGTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCAcg > 1:10967900/1‑140 (MQ=255) tGTAGGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCTTATCAGGCCTAAAGGGAGTTCTAACTCATTGATAAATTTGTTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCAcg > 1:3689028/1‑140 (MQ=255) tGTAGGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCGTATCAGGCCTAAAGGGAGATCTAACTCCTTGATAAAGTTGTTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCAcg > 2:11018199/1‑140 (MQ=37) tGTAGGTCAGATAAGGCGTGTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGAGGCGACGCTG‑GCGCGGCTTATCAGGCCTCTAGGGCTGGCTTACTCATTGGTACATTTGGTTGGGTAGGTCGGATAGGGCGTTCAcg > 2:7049224/1‑140 (MQ=255) | TGGCTGGTCGAACGCTGGGAAGGGGAGCCGTGGGGTAAAGAAGGGCAACCCGGTGAGTGGATGTCGCTGGTCGGTCTTAATGCCGATGATTTTCCGCCAGCCAATGAACCGGTAATTGCGAAGCTTAAACGTCTGTAAGTCAGATAAGGCGTTTTCGCCGCATCCGACATTCGCACACGATGCCTGATGCGACGCTG‑GCGCGTCTTATCAGGCCTAAAGGGATTTCTAACTCATTGATAAATTTGTTTTTGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACG > NZ_CP025268/111127‑111399 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |