| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 1,219,333 | G→A | intergenic (‑230/+27) | iraM ← / ← CXP41_RS24360 | anti‑adapter protein IraM/protein YmgK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 1,219,333 | 0 | G | A | 100.0% | 102.3 / NA | 28 | intergenic (‑230/+27) | iraM/CXP41_RS24360 | anti‑adapter protein IraM/protein YmgK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (13/15); total (13/15) | |||||||||||
ATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATGCATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCTAAACATTATGGTTGCCTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAG > NZ_CP025268/1219214‑1219444 | agggCTTATATAACCTAAAATTTAAAGCACTGAATCTCAATGGATGTTTAACAAAATGAGATTTTGAGAAAGCAATAAATTATTTAATTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATc < 2:1876761/138‑1 (MQ=255) gtcTTATATAAAATACAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCt < 2:7941087/138‑1 (MQ=255) cTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGt < 1:2481/140‑1 (MQ=255) cAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGcc > 1:427401/1‑140 (MQ=255) gATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCa > 2:1206621/1‑84 (MQ=255) gATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCa < 1:1206621/84‑1 (MQ=255) gagaTTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCTAAACATTATGGt < 2:427401/140‑1 (MQ=255) tgtgAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTCCTTTGTGCCAATTTGCTAAACATTATGGTTGCCttt > 2:9394794/1‑140 (MQ=255) tAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCTAAACATTATGGTTGCCTTTTTATATAACGa < 1:10846476/140‑1 (MQ=255) ttGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCTAAACATTATGGTTGCCTTTTTATATAACGATaataat > 1:683476/1‑140 (MQ=255) tGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCaaa > 1:4896616/1‑45 (MQ=255) tGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCaaa < 2:4896616/45‑1 (MQ=255) cGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCTAAACATTATGGTTGCCTTTTTATATAACGATAATAATGAAtata > 2:7943782/1‑140 (MQ=255) ttttAGATTAGATTAGCTATAATGTTATAAATTCTAATGACTGCACATCCTGTAATTAAAAAATAGAATTTATTCTACTTTGTGCCAATTTGATAAACATTATGGTTGCCTTTTTATATAAAGTTAATAATGAATATAAg < 2:10878272/140‑1 (MQ=255) tttAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTaaa < 2:11070895/59‑1 (MQ=255) tttAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTaaa < 2:11071213/59‑1 (MQ=255) tttAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTaaa < 2:11071263/59‑1 (MQ=255) tttAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTaaa > 1:11070895/1‑59 (MQ=255) tttAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTaaa > 1:11071263/1‑59 (MQ=255) tttAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTaaa > 1:11071213/1‑59 (MQ=255) gTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCTAAACATTATGGTTGCCtttt > 1:1890011/1‑104 (MQ=255) gTTTAGCTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCTAAACATTATGGTTGCCtttt < 2:1890011/104‑1 (MQ=255) cTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCTAAACATTATGGTTGCCTTTTtat < 1:10108355/101‑1 (MQ=255) cTATAATGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCTAAACATTATGGTTGCCTTTTtat > 2:10108355/1‑101 (MQ=255) aTGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCttt > 1:11511549/1‑50 (MQ=255) aTGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCttt < 2:11511549/50‑1 (MQ=255) aTGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCt < 2:3131691/73‑1 (MQ=255) aTGTTATACATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCt > 1:3131691/1‑73 (MQ=255) | ATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTAGCTATAATGTTATGCATTCAAATGACTGAACATCCTGTAATTAAAACATAGCCTTTATGCTACTTTGTGCCAATTTGCTAAACATTATGGTTGCCTTTTTATATAACGATAATAATGAATATAAG > NZ_CP025268/1219214‑1219444 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |