| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 1,798,989 | T→C | *327* (TAA→TAG) | btuC ← | vitamin B12 ABC transporter permease BtuC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 1,798,989 | 0 | T | C | 99.6% | 2410.5 / NA | 692 | *327* (TAA→TAG) | btuC | vitamin B12 ABC transporter permease BtuC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (390/299); minor base G (3/0); total (393/299) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 692 total aligned reads displayed.
ACCGGCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGTTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTCGCCCCTG > NZ_CP025268/1798852‑1799125 | gCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAACATCGTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTGTGCGGCTCACGt > 1:6644314/1‑140 (MQ=255) gCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGCCAGAATGGAATCCTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGCTAACGt > 1:6499704/1‑140 (MQ=255) gCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACAACGGTCGTAAGAATGGAATCTTGCTTCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAATATCTTAGCTTTTAATCATAGGCCGTGTTTTTGCGGGTTACGt > 2:11617814/1‑140 (MQ=255) gCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTGCACCGTCGATATCTTTCACTACGGGCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCATGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATATACCGTCTGTTTGAGGCTAACGt > 2:11142526/1‑140 (MQ=255) 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ACCGGCGAACTTCTCCAGCGTGGTCACTTCACCGTCGATATCTTTCACTACGGTCGTCAGAATGGAATCTTGCATCGTTTCTCCTGGGTGTGGTCAGTAAAAATCTTAGCTTTTAATCATAGACCGTCTTTTTGCGGTTAACGTCCTGCTTTTAACAATAACCAGATAAACACCGGCGCACCTAACGTTGCGGTGACCACGCCAATAGGCAGCTCTGCGGCAGCTAATGCCAGGCGCGCTACAATATCGGCCAGCAGCAATGCGCTCGCCCCTG > NZ_CP025268/1798852‑1799125 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |