| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,088,812 | A→G | G251G (GGT→GGC) | tsuA ← | thiosulfate utilization transporter TsuA/YeeE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,088,812 | 0 | A | G | 99.9% | 2472.4 / NA | 712 | G251G (GGT→GGC) | tsuA | thiosulfate utilization transporter TsuA/YeeE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (387/324); minor base T (0/1); total (387/325) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 712 total aligned reads displayed.
CTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACACCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGAT > NZ_CP025268/2088675‑2088946 | cTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcc < 2:6853691/140‑1 (MQ=255)cTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcc < 2:6414385/140‑1 (MQ=255)cTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcc > 2:5308626/1‑140 (MQ=255) ggCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcccc > 2:928974/1‑140 (MQ=255) ggCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGcccc < 2:2769780/140‑1 (MQ=255) gCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCa > 1:1762422/1‑140 (MQ=255) aCCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTCACACCAGGAAAACGCCCCAGt < 2:4301576/140‑1 (MQ=255) aCCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGt < 1:7505572/140‑1 (MQ=255) aaGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAAt < 2:11176380/140‑1 (MQ=255) aaGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAAt < 1:5267386/140‑1 (MQ=255) cgggttaGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTa > 2:4664525/7‑140 (MQ=255) cccaccgTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCAGCGCGACCGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTAt < 2:9109299/134‑1 (MQ=255) ccATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGATCTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTAt < 2:4474073/140‑1 (MQ=255) cATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTAtt > 2:9487319/1‑140 (MQ=255) cAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCAAGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCa < 2:193931/140‑1 (MQ=255) caccacCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCa > 1:1827219/1‑140 (MQ=255) accaccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCAc > 1:5875115/1‑140 (MQ=255) ccTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCcgc > 1:9148602/1‑140 (MQ=255) aaCCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAACACGCCCCCGGTAATGTAGTTCATGTCACCCGCGAc > 2:9613978/1‑140 (MQ=255) aaCCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGAc > 2:3686628/1‑140 (MQ=255) aaCCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGAc > 2:6649660/1‑140 (MQ=255) ccccGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGAcc < 2:2646572/139‑1 (MQ=255) cGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGa < 1:5621420/140‑1 (MQ=255) gCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGaa > 2:8448296/1‑140 (MQ=255) cTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGaaa > 2:7314716/1‑140 (MQ=255) cTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGaaa < 1:4842429/140‑1 (MQ=255) tACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAAt > 1:1244567/1‑140 (MQ=255) tAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCa < 1:3683821/140‑1 (MQ=255) tAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCa < 1:224083/140‑1 (MQ=255) tgttgtTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGaa > 1:6349253/1‑140 (MQ=255) tgtttgtGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAatat > 2:5090376/1‑140 (MQ=255) tttgtGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTg > 1:1605203/1‑140 (MQ=255) tttgtGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTg > 2:11293544/1‑140 (MQ=255) tttgtGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTg > 2:7575562/1‑140 (MQ=255) tttgtGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTg > 1:8755757/1‑140 (MQ=255) tttgtGCATCAGCTGCGCGAACGAGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATCTATTTCATGTCACCCGCGACCAGACATTGCAGAATATTg > 2:1694508/1‑140 (MQ=255) tgtgCATCAGCTGCGCGATCGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGCCTTCAATAACTGACCCCACGACGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTGAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGc < 2:8271131/140‑1 (MQ=255) tgtgCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGc > 2:4836524/1‑140 (MQ=255) tgtgCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGc < 2:11453328/140‑1 (MQ=255) tgtgCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGc > 1:6686379/1‑140 (MQ=255) tgtgCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCATTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGc < 1:10979052/140‑1 (MQ=255) gCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAACCGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATCTTGGCCGt > 1:8062652/1‑140 (MQ=255) gCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATCTTGGCCGt > 2:10117599/1‑140 (MQ=255) gCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGt > 1:2430442/1‑140 (MQ=255) aTCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTg > 2:10032706/1‑140 (MQ=255) aGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTgggg > 2:10388658/1‑140 (MQ=255) gcgcGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGt > 1:8500666/1‑140 (MQ=255) gcgcGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGt > 2:3835071/1‑140 (MQ=255) gcgcGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGt < 1:4999414/140‑1 (MQ=255) cgcgAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTg > 1:3541582/1‑140 (MQ=255) gcgGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTa < 1:7314716/140‑1 (MQ=255) gcgGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTa < 2:3409650/140‑1 (MQ=255) ggAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAAc < 1:10650047/140‑1 (MQ=255) gAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAAcc < 1:9790088/140‑1 (MQ=255) aaCTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAAccc < 2:7703182/140‑1 (MQ=255) tCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGACGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGt < 2:217990/140‑1 (MQ=255) tCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGt > 2:5788626/1‑140 (MQ=255) tCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCACTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGATGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGt > 1:2636280/1‑140 (MQ=255) ttGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGt > 1:5450055/1‑140 (MQ=255) ggCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTg > 1:3879638/1‑140 (MQ=255) cTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCt < 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1:5818657/140‑1 (MQ=255) ggAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCg > 1:4287097/1‑140 (MQ=255) ggAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGATGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCAGGTTGATTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCg > 2:8769336/1‑140 (MQ=255) gAAAACGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGa > 1:9557770/1‑140 (MQ=255) aaaaCGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGAt < 1:10868709/140‑1 (MQ=255) aaaaCGCCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGAt < 2:315949/140‑1 (MQ=255) | CTGGCACCGAAGCCCATCAGTACACCACCTAACCCGCTACGTAATGTTGTTTGTGCATCAGCTGCGCGAACGCGGAACTCACGGCTCGCTTTGGCTGCAATAAATGACCCCACGAAGATCCCTAACACCAGGAAAACACCCCAGTTAATGTATTTCATGTCACCCGCGACCAGAAATTGCAGAATATTGGCCGTTGGGGAAGTGATTCCTAACCCAAACATGCGTCCGGTTGCTTCACTCAGGGGCCAGGCTAAAAGCGCAATCAAACCGAT > NZ_CP025268/2088675‑2088946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |