| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,118,541 | T→C | *465* (TAA→TAG) | wcaM ← | colanic acid biosynthesis protein WcaM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,118,541 | 0 | T | C | 99.6% | 3542.0 / NA | 1022 | *465* (TAA→TAG) | wcaM | colanic acid biosynthesis protein WcaM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (479/536); minor base G (3/1); total (484/538) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 1022 total aligned reads displayed.
CTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATTTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGACAGCAGTGTTTCTT > NZ_CP025268/2118404‑2118677 | cTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTa > 1:6708196/1‑140 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCTTTGTGGATTGCAGTATCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACt > 2:11203755/1‑140 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACt > 1:7615794/1‑140 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACt > 2:7658939/1‑140 (MQ=255) tGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACt > 2:7485522/1‑140 (MQ=255) ttCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTcc > 2:10429428/1‑140 (MQ=255) ttCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTcc > 1:10000153/1‑140 (MQ=255) ttCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTcc > 1:11551000/1‑140 (MQ=255) ttCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCg < 1:10138488/140‑1 (MQ=255) ttCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCg > 1:6524758/1‑140 (MQ=255) tCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCgg < 1:91640/140‑1 (MQ=255) gCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCt < 2:5423772/140‑1 (MQ=255) ttACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTa < 2:3360008/140‑1 (MQ=255) cccTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAAtc > 1:2993055/1‑140 (MQ=255) ccTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAAtct > 2:2404984/1‑140 (MQ=255) ccTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAAtct > 1:1037121/1‑140 (MQ=255) ccTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGGTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAAtct > 2:2869184/1‑140 (MQ=255) tGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAAtcttc < 1:150983/140‑1 (MQ=255) aaTTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTtctc > 2:11576239/1‑140 (MQ=255) aTTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTGTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTcc < 1:602476/140‑1 (MQ=255) ttGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCca > 2:4025761/1‑140 (MQ=255) tGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCcac < 2:8294018/140‑1 (MQ=255) tGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCcac < 1:853621/140‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt < 2:4341121/140‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt > 2:4738871/1‑140 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt < 2:1691323/140‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAAAGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt < 1:10609796/140‑1 (MQ=255) aTTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGAATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAt > 2:10887533/1‑140 (MQ=255) ttACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTTGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACAtt < 1:2529087/140‑1 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACa > 1:2193207/1‑140 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACa > 2:3850899/1‑140 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTAGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAGTCTAAAGTTAATCTTATCCACATGAACa > 2:2652167/1‑140 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACGACGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTATCCACCTTAACa < 1:784215/140‑1 (MQ=255) tGAATTACTTGTGATGTTACACCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACa > 1:6989093/1‑140 (MQ=255) tACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATg < 1:11228518/140‑1 (MQ=255) tACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATg < 1:366180/140‑1 (MQ=255) tACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATg < 2:6807956/140‑1 (MQ=255) cTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGt > 2:3224931/1‑140 (MQ=255) tgtgATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCt > 1:2324593/1‑106 (MQ=255) gtgATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGAt < 2:301193/140‑1 (MQ=255) gATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTa > 1:3199587/1‑140 (MQ=255) gATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTa > 1:10804591/1‑140 (MQ=255) agTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAAt < 2:5687020/139‑1 (MQ=255) gTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATc > 1:8858311/1‑140 (MQ=255) gccgcTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGAATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTc < 1:4956350/140‑1 (MQ=255) gattagTTGTGGATTGCAGTAGCATTGGTCTTAAGTATGTCTCACTTTTTCCAGTAATTGTCTCAAATCTACTCCATCAGTTCAGTAAATCTAAAGTTAATCTACTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGat < 2:10723136/135‑1 (MQ=255) cTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGata > 1:5608606/1‑140 (MQ=255) cTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGata < 2:11313476/140‑1 (MQ=255) cTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGata < 2:2166639/140‑1 (MQ=255) ttCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGatat > 1:2063222/1‑140 (MQ=255) ttCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGatat < 1:5143664/140‑1 (MQ=255) ttCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGatat < 1:9420035/140‑1 (MQ=255) tCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATc > 2:4225899/1‑140 (MQ=255) tgtgGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACg < 2:6989093/140‑1 (MQ=255) tgtgGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACg < 1:1825930/140‑1 (MQ=255) tgtgGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACg < 1:1616304/140‑1 (MQ=255) ggATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAg < 2:6422716/140‑1 (MQ=255) aTTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCt < 2:11424176/140‑1 (MQ=255) tGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCttt > 1:5444032/1‑140 (MQ=255) gCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTg < 1:9665449/140‑1 (MQ=255) cAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGt > 2:206398/1‑140 (MQ=255) aGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTc < 2:5024420/140‑1 (MQ=255) aGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTc < 1:4392455/140‑1 (MQ=255) tAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCt < 2:5978177/140‑1 (MQ=255) tAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCt < 2:9670685/140‑1 (MQ=255) tGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttca < 2:9438984/140‑1 (MQ=255) gTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATc > 1:5317684/1‑106 (MQ=255) gTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATc < 2:5317684/106‑1 (MQ=255) gTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcat > 1:6253404/1‑140 (MQ=255) gTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCCACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcat > 2:10081250/1‑140 (MQ=255) gTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAAGCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCAAATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATCTCGACGGAGCTTTGTCATTTttcat > 2:8882942/1‑140 (MQ=255) ttCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCttt < 1:404608/127‑1 (MQ=255) ttCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcatt > 1:8196131/1‑140 (MQ=255) ttCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcatt > 1:3394910/1‑140 (MQ=255) ttCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcatt > 1:8632284/1‑140 (MQ=255) ttCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcatt > 1:4667320/1‑140 (MQ=255) ccTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTttcattca < 2:8696436/140‑1 (MQ=255) aaGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATAGGGTGAGTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCGGTGTCCTTTTTCATTCACCg > 1:276608/1‑140 (MQ=255) tATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTc < 2:8135076/122‑1 (MQ=255) tATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTc < 2:5207854/122‑1 (MQ=255) tATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCAt > 1:11351215/1‑140 (MQ=255) tGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTc > 1:8355638/1‑120 (MQ=255) tGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGa > 2:1392015/1‑140 (MQ=255) tGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGa > 1:9885216/1‑140 (MQ=255) tGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGa > 2:3709649/1‑140 (MQ=255) aCTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAAc < 2:7191142/140‑1 (MQ=255) aCTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCCCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAAc < 2:4537830/140‑1 (MQ=255) cTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATg < 1:11464539/82‑1 (MQ=255) tCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACAt < 1:11025177/140‑1 (MQ=255) tCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACAt < 2:8502052/140‑1 (MQ=255) tCCAATTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACAt < 2:10228535/140‑1 (MQ=255) cATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACAttt > 1:1278065/1‑140 (MQ=255) aTTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTg < 2:6147564/140‑1 (MQ=255) aTTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTg < 2:9124189/140‑1 (MQ=255) ttttCCAGGAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCa < 1:3786903/140‑1 (MQ=255) ggAATGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGAca > 2:7948978/1‑140 (MQ=255) gAAGGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGAcag < 1:7485522/140‑1 (MQ=255) aaTGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGAcagc > 2:6664396/1‑140 (MQ=255) aTGGTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGAcagca < 1:6879590/140‑1 (MQ=255) ggTCGCAAATCTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGACAGCAgt < 2:1857960/140‑1 (MQ=255) | CTTGTTCGATTTTTTTCGCCAGCATCAATTACCCTGAATTGATTACTGAATTACTTGTGATGTTACGCCGCTTCGTTGTGGATTGCAGTAGCATTGTTCCTAAGTATGACTCCATTTTTCCAGGAATGGTCGCAAATTTACTCCCTCAGTTCCGGCAATCTAAAGTTAATCTTCTCCACATTAACAATATGGTGATTAATCCTGTCGATATCGACGGAGCTTTGTCCTTTTTCATTCACCGCATGAACATTTGCAAGAGACAGCAGTGTTTCTT > NZ_CP025268/2118404‑2118677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |