| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 2,193,631 | T→C | A439A (GCA→GCG) | yehB ← | fimbrial biogenesis outer membrane usher protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 2,193,631 | 0 | T | C | 99.8% | 1534.1 / NA | 439 | A439A (GCA→GCG) | yehB | fimbrial biogenesis outer membrane usher protein |
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 446 total aligned reads displayed.
TTTTTGCGGCCAAAATCGTTCTGGTAATAATCGGCAATGTCATAGACATCGTTTTCATCACGGCGATAATTATCTTTATTGTTTGCCCAAACGTGATCGTTAAATGTCCGGTAATCACGCGACGAATAACGCCAGGCTGCCAGACCAAAACGCGTCGACGTTTGGCTCACAAATTTGTTGTAGGCAATTTGATAACTTTGCCCGTCAAACACATCGCCGTTGTCTTGTTTACTATGCGACTTAGTGGCATCGACGGAAATGGCACCAATGCGTG > NZ_CP025268/2193494‑2193767 | tttttGCGGCCAAAATCGTTCTGGTAATAATCGGCAATGTCATAGACATCGTTTTCATCACGGCGATAATTATCTTTATTGTTTGCCCAAACGTGATCGTTAAATGTCCGGTAATCACGCGACGAATAACGCCAGGCCGc < 1:9299021/140‑1 (MQ=255)tttttGCGGCCAAAATCGTTCTGGTAATAATCGGCAATGTCATAGACATCGTTTTCATCACGGCGATAATTATCTTTATTGTTTGCCCAAACGTGATCGTTAAATGTCCGGTAATCACGCGACGAATAACGCCAGGCCGc < 1:400619/140‑1 (MQ=255) ttttGCGGCCAAAATCGTTCTGGTAATAATCGGCAATGTCATAGACATCGTTTTCATCACGGCGATAATTATCTTTATTGTTTGCCCAAACGTGATCGTTAAATGTCCGGTAATCACGCGACGAATAACGCCAGgccgcc < 1:10535030/140‑1 (MQ=255) ttttGCGGCCAAAATCGTTCTGGTAATAATCGGCAATGTCATAGACATCGTTTTCATCACGGCGATAATTATCTTTATTGTNTGCCCAAACGTGATCGTTAAATGTCCGGTAATCACGCGACGAACAACGCNAGgccgcc < 1:6189164/140‑1 (MQ=255) 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1:5562937/140‑1 (MQ=255) cgcgACGAATAACGCCAGGCCGCCAGACCAAAACGCGTCGACGTTTGGCTCACAAATTTGTTGTAGGCAATTTGATAACTTTGCCCGTCAAACACATCGCCGTTGTCTTGTTTACTATGCGACTTAGTGGCATCGACGGa < 1:8887055/140‑1 (MQ=255) cgacgaATAACGCCAGGCCGCCAGACCAAAACGCGTCGACGTTTGGCTCACAAATTTGTTGTAGGCAATTTGATAACTTTGCCCGTCAAACACATCGCCGTTGTCTTGTTTACTATGCGACTTAGTGGCATCGACGGaaa < 1:4534732/140‑1 (MQ=255) cgacgaATAACGCCAGGCCGCCAGACCAAAACGCGTCGACGTTTGGCTCACAAATTTGTTGTAGGCAATTTGATAACTTTGCCCGTCAAACACATCGCCGTTGTCTTGTTTACTATGCGACTTAGTGGCATCGACGGaaa > 2:6892923/1‑140 (MQ=255) cgacgaATAACGCCAGGCCGCCAGACCAAAACGCGTCGACGTTTGGCTCACAAATTTGTTGTAGGCAATTTGATAACTTTGCCCGTCAAACACATCGCCGTTGTCTTGTTTACTATGCGACTTAGTGGCATCGACGGaaa > 1:4676391/1‑140 (MQ=255) aTAACGCCAGGCCGCCAGACCAAAACGCGTCGACGTTTGGCTCACAAATTTGTTGTAGGCAATTTGATAACTTTGCCCGTCAAACACATCGCCGTTGTCTTGTTTACTATGCGACTTAGTGGCATCGACGGAAATGGCAc < 2:19728/140‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |