| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 255,488 | G→A | R20C (CGT→TGT) | pepD ← | cytosol nonspecific dipeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 255,488 | 0 | G | A | 99.8% | 3328.7 / NA | 866 | R20C (CGT→TGT) | pepD | cytosol nonspecific dipeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (430/433); minor base C (1/1); total (432/434) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 866 total aligned reads displayed.
ACCTGCGGTAGCAGGTTTACGAATCAGGATATTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACGGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAACACAAGACA > NZ_CP025268/255354‑255624 | gCGGTAGCAGGTTTACGAATCAGGATATTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGACTAGAACAGATTTTGGc < 2:8991303/140‑1 (MQ=255) cGGTAGCAGGTTTACGAATCAGGATATTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCa > 2:4925175/1‑140 (MQ=255) cGAATCAGGATATTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAg < 2:1073979/140‑1 (MQ=255) cGAATCAGGATATTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAg < 2:7993917/140‑1 (MQ=255) aTCATGCTATTAACTACCTGATCGGGTTCGACATGGTAACCTTTCTCTGTTGCCCAACCAACAATGTTTTCAGCGTGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACCGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCgg < 1:6947533/140‑1 (MQ=255) aTCAGGATATTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCgg < 2:1587948/140‑1 (MQ=255) aTCAGGATATTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCgg < 2:7580341/140‑1 (MQ=255) aTCAGGATATTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCgg < 2:1837883/140‑1 (MQ=255) atTACCTACCTGATCGCGTTCGACATTGAAACCTTTCTCTTTTGCCCTTGGAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGgag < 2:7358710/140‑1 (MQ=255) atTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGgag < 1:161773/140‑1 (MQ=255) atTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGgag < 2:10503520/140‑1 (MQ=255) atTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGgag < 1:4056164/140‑1 (MQ=255) atTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGgag < 2:5511922/140‑1 (MQ=255) atTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGgag < 1:3192321/140‑1 (MQ=255) atTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGgag < 1:57549/140‑1 (MQ=255) atTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGgag < 1:10998394/140‑1 (MQ=255) tacctaccTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGAt > 2:9857744/1‑140 (MQ=255) tacctaccTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGAt < 2:11438607/140‑1 (MQ=255) ctacctGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGTAGATAAt < 1:8252853/140‑1 (MQ=255) ctacctGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAAt < 1:5397548/140‑1 (MQ=255) ctacctGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAAt < 1:350931/140‑1 (MQ=255) ctacctGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAAt < 2:5894100/140‑1 (MQ=255) acctGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTg > 2:11620861/1‑140 (MQ=255) acctGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTg > 1:2695080/1‑140 (MQ=255) acctGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTg > 1:1333041/1‑140 (MQ=255) acctGATCGCGTTCGACAAGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTg > 2:472138/1‑140 (MQ=255) cctGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTga > 1:7589501/1‑140 (MQ=255) ctGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTgag < 1:9070823/140‑1 (MQ=255) ctGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTgag < 1:5202479/140‑1 (MQ=255) tGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTgaga < 2:7036233/140‑1 (MQ=255) tGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTgaga < 1:10220357/140‑1 (MQ=255) tGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTgaga < 1:3630259/140‑1 (MQ=255) tGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTgaga < 1:4826834/140‑1 (MQ=255) gATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGAc > 2:2190400/1‑140 (MQ=255) aTCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACa > 1:5006823/1‑140 (MQ=255) cgcgTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGt > 1:3343866/1‑140 (MQ=255) cgcgTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTAGTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGt > 2:10999391/1‑140 (MQ=255) cgTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTc > 2:7845476/1‑140 (MQ=255) cgTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGGGGAGATAATTGAGACAGTTc > 2:6477647/1‑140 (MQ=255) ttCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAg > 1:5941798/1‑140 (MQ=255) ttCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAg > 1:3865326/1‑140 (MQ=255) tCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGa < 2:10327393/140‑1 (MQ=255) tCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGa > 1:2519583/1‑140 (MQ=255) aaaCCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAg < 2:4012132/140‑1 (MQ=255) aaCCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGt < 1:8788981/140‑1 (MQ=255) ccTTTCTGTTTTGCCCAACCAAGTATGTATTCTGCGTGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGTGGATTTGTACAGTTTGTGGGTATAATTTGCGAGAGCGGGTGTGGTGATAATTTTGACAGTTCAGTGACGTTTAGtct < 2:3798924/140‑1 (MQ=255) ttCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTCAGTCTCCt > 2:6365463/1‑140 (MQ=255) ttCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCt < 1:2455242/140‑1 (MQ=255) tctTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGt < 1:6349815/140‑1 (MQ=255) cccAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGACTAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCAc > 2:9259097/1‑140 (MQ=255) ccaacAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCa < 1:10012426/140‑1 (MQ=255) ccaacAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCa < 1:6086136/140‑1 (MQ=255) ccaacAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCATTGTCGATCACCCGCa > 2:513450/1‑140 (MQ=255) acaaTGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCaaaa < 1:9542927/140‑1 (MQ=255) acaaTGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCaaaa < 2:8545454/140‑1 (MQ=255) aTTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTAtt > 1:9283339/1‑140 (MQ=255) aTTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTAtt < 2:3225304/140‑1 (MQ=255) ttCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAATAATCCCACAGCTGCTGTGGAGATCATTGAGACAGTTAAGACACGTTAATTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTg > 2:5754717/1‑140 (MQ=255) ttCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTg < 1:10542236/140‑1 (MQ=255) ttCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTg > 2:7172167/1‑140 (MQ=255) ttCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTg > 1:2830635/1‑140 (MQ=255) tCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACCGTATTGc < 2:1979334/140‑1 (MQ=255) tCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGc < 1:7365424/140‑1 (MQ=255) aGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAg > 1:10854557/1‑140 (MQ=255) gCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAgg > 1:8400287/1‑140 (MQ=255) gAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTc > 1:7795283/1‑140 (MQ=255) gAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGGGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTc > 2:10039711/1‑140 (MQ=255) gTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTcac < 2:4224642/140‑1 (MQ=255) tGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAg > 1:8600545/1‑140 (MQ=255) ctTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGtt < 1:9143440/140‑1 (MQ=255) ctTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGACTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGtt < 1:11597120/140‑1 (MQ=255) aTGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCg > 2:11234522/1‑109 (MQ=255) gATAGGACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGa > 1:11255325/1‑140 (MQ=255) ggACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAAt < 2:840161/140‑1 (MQ=255) gACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAAtg > 2:2381986/1‑140 (MQ=255) gACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAAtg > 1:4253254/1‑140 (MQ=255) gACGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAAGTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAAtg > 2:3488060/1‑140 (MQ=255) cGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAAtgtt > 2:4432111/1‑140 (MQ=255) cGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAAtgtt < 1:6712219/140‑1 (MQ=255) cGGGTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAAtgtt > 1:6468779/1‑140 (MQ=255) ggTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAAtgttgt < 2:2695080/140‑1 (MQ=255) ggTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAAtgttgt < 2:8186950/140‑1 (MQ=255) ggTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAAtgttgt > 2:6181878/1‑140 (MQ=255) gTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTc > 2:1351116/1‑140 (MQ=255) gTGAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTc > 1:8027701/1‑140 (MQ=255) gAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCaa < 2:5369101/140‑1 (MQ=255) gAGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCaa < 1:4454162/140‑1 (MQ=255) aGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAac > 2:3013922/1‑140 (MQ=255) aGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAac > 1:2155030/1‑140 (MQ=255) aGGAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAac < 1:11089542/140‑1 (MQ=255) ggAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAaca < 2:9563070/140‑1 (MQ=255) ggAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAaca > 1:7224695/1‑140 (MQ=255) ggAATAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAaca < 1:3073649/140‑1 (MQ=255) aaTAGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAAtgttgt > 2:6788516/1‑133 (MQ=255) aGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAACACAAGa < 2:87437/140‑1 (MQ=255) aGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAACACAAGa < 1:1859848/140‑1 (MQ=255) aGAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAACACAAGa < 1:2277282/140‑1 (MQ=255) gAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAACACAAGAc > 2:942027/1‑140 (MQ=255) gAACAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAACACAAGAc < 1:9867291/140‑1 (MQ=255) aaCAGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAACACAAGACa > 1:4676604/1‑140 (MQ=255) | ACCTGCGGTAGCAGGTTTACGAATCAGGATATTACCTACCTGATCGCGTTCGACATGGAAACCTTTCTCTTTTGCCCAACCAACAATGTATTCAGCGAGTTGCTCTTCATGATAGGACGGGTGAGGAATAGAACGGATTTTGGCAAAAATATCCCACAGCGGCTGTGGAGATAATTGAGACAGTTCAGACACGTTAAGTCTCCTTGTCGATCACCCGCAAAACAGTATTGCAGGTCACAGGGTTAGCAGAAAATGTTGTCAACACAAGACA > NZ_CP025268/255354‑255624 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |