Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 3,098,977 | A→G | *97* (TAA→TAG) | yggU → | DUF167 family protein YggU |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,098,977 | 0 | A | G | 99.5% | 1273.9 / NA | 368 | *97* (TAA→TAG) | yggU | DUF167 family protein YggU |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (155/210); minor base T (0/2); total (155/213) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.11e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 390 total aligned reads displayed.
GTGAAGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAAGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGC > NZ_CP025268/3098840‑3099113 | gTGAAGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGt > 1:7608566/1‑140 (MQ=255) tGAAGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTa > 2:9909620/1‑140 (MQ=255) aaGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATc > 1:7162710/1‑140 (MQ=255) aaGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCAAAAAGCCAGGTGGTGATGGATAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAATTTAAAATCATTAATCAGCAACATATCCCTACAGATATCGGGGCGTTTATTAATTAGGTAtg > 2:3997570/1‑139 (MQ=255) actatctcGGTAAGCAATCCCGGGTTGCCAAAAGCCATGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTGTGCCTCCACAAACAAATTAAAAACATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATcc < 2:10171603/136‑1 (MQ=255) gTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCt < 2:3441578/140‑1 (MQ=255) gTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATGAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAAACGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCt < 2:1277317/140‑1 (MQ=255) tttCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTa > 1:4564215/1‑140 (MQ=255) tctcGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTCTCCTATg > 1:4248651/1‑140 (MQ=255) tctcGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATg < 2:2088144/140‑1 (MQ=255) tcGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCa > 2:4535481/1‑140 (MQ=255) aaGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAg > 2:2566374/1‑140 (MQ=255) aGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGt > 1:10154124/1‑140 (MQ=255) gctaTTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGtt < 1:3046358/137‑1 (MQ=255) tCCGGGTTGCCCATAGCCAGGTGGGGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTATTCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTCATTAGGTATCCTCTGCAAAATGTTGTccg > 2:1649413/1‑139 (MQ=255) tCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCt < 1:2641551/140‑1 (MQ=255) gggTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGc < 2:3196926/140‑1 (MQ=255) ggTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCa > 1:7370613/1‑140 (MQ=255) tGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAAcc > 1:8495384/1‑140 (MQ=255) ccAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCgg > 2:1069152/1‑140 (MQ=255) cAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGc < 2:2232550/140‑1 (MQ=255) cAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGc < 1:5058097/140‑1 (MQ=255) cAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGc < 2:325060/140‑1 (MQ=255) cAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATACCGACAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGTTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGc < 2:3114306/140‑1 (MQ=255) aaaTCCAGGTGGTTATTGAAAAAGGCGAACTTGGACGCCACAAACAAATTAATATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 2:11420547/140‑1 (MQ=255) aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 1:3370508/140‑1 (MQ=255) aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 2:6266511/140‑1 (MQ=255) aaaGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCaa < 1:1792161/140‑1 (MQ=255) aGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATg < 1:4062752/140‑1 (MQ=255) aGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATg < 1:10833792/140‑1 (MQ=255) aGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATg < 1:5229884/140‑1 (MQ=255) cAGGTGGTGATTGACAAACGCGAACTTGGCCTCCACAAACAAAATAACATCATTAATCCGCAACAACTCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCg < 2:932734/140‑1 (MQ=255) gtggtgATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTa > 1:2750873/1‑140 (MQ=255) gtggtgATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTa > 1:3690008/1‑140 (MQ=255) gtggtgATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTa < 2:181506/140‑1 (MQ=255) tggtgATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTaa < 1:8885626/140‑1 (MQ=255) gggtgCTTGAAACAGGCGAACTTGGCTGCCACAAACAAATTAAAAACATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTaa < 1:8288981/139‑1 (MQ=255) gtgATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCACAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAg > 1:2197786/1‑140 (MQ=255) tgATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGt > 1:10048520/1‑140 (MQ=255) tgATTGAAAAAGGCGAACTTGGACGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCACGCCAGAAATAGAGGCGTTAATTTATTAGGTATCCTATGAATCTAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGt > 2:8507062/1‑140 (MQ=255) aTTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGc > 2:5546622/1‑140 (MQ=255) aTTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGc > 1:10129633/1‑140 (MQ=255) atGAACAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCg < 2:7440146/139‑1 (MQ=255) aaaaaGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCGAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTCAAGTGCGTgt > 1:10233717/1‑139 (MQ=255) aaaaGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAACTCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAg < 2:10379917/140‑1 (MQ=255) gCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGc > 2:2838501/1‑140 (MQ=255) gAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGt > 1:10645820/1‑140 (MQ=255) aaCTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTc < 2:9124913/140‑1 (MQ=255) aCTTGGCCGCCACAAACAAATTAACCTCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCg < 1:10930650/140‑1 (MQ=255) ttGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGACAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCgct < 1:7119553/140‑1 (MQ=255) gccgccACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCgctgct > 1:1624529/1‑140 (MQ=255) gccgccACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCgctgct > 2:498506/1‑140 (MQ=255) ccgccACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCtt > 2:5397710/1‑140 (MQ=255) ccACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGc < 2:6815071/140‑1 (MQ=255) acaaacatATTAAAATCATTTTTCCTCAACAAATCCCGCCTGAAATCGCGGCGTTGTTTAATTAGGTTTCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTTCGTGAGCTGTAGTCGCTGCTTAGCGa < 2:3722863/140‑1 (MQ=255) aaacaaaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACt < 2:8684254/140‑1 (MQ=255) aacaaaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACtt < 2:5702804/140‑1 (MQ=255) aacaaaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACtt < 1:5373103/140‑1 (MQ=255) aacaaaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACtt < 1:6549541/140‑1 (MQ=255) acaaaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTc < 1:11415587/140‑1 (MQ=255) caaaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCg < 1:1996771/140‑1 (MQ=255) aaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGt < 1:8059712/140‑1 (MQ=255) aaTTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGt < 1:11134930/140‑1 (MQ=255) aaTCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGat > 2:8008857/1‑140 (MQ=255) cATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATc < 2:731551/140‑1 (MQ=255) cATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATc < 1:2284305/140‑1 (MQ=255) ttAATCCGCAACACATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTCTGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCACTGTCGGTAAAGTGAGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATAGCgg > 2:10934948/1‑139 (MQ=255) ttAATCCGCAACAACTCCCGCCAGAAACCGCGGCGATAATCACTTACCTATCCTATGCAAACACTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGATGCTTAGCTACTTCGGTCTTGATATCGt < 2:10516701/140‑1 (MQ=255) ttAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGt > 2:4767785/1‑140 (MQ=255) ttAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGt > 1:1488700/1‑140 (MQ=255) ttAATACGCAACACATCCCGCCAGAACTCGCGGCTTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTTCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGt < 2:11248220/140‑1 (MQ=255) aTCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGc < 1:3211736/140‑1 (MQ=255) aTCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGc < 2:2434185/140‑1 (MQ=255) aTCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGc < 1:248292/140‑1 (MQ=255) aTCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGc < 1:6240947/140‑1 (MQ=255) aTCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGAGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGCCTTCGGTCTTGATATCGTGGc < 2:1758567/140‑1 (MQ=255) caacaaATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCaaa > 1:1827706/1‑140 (MQ=255) caacaaATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCaaa > 2:5033812/1‑140 (MQ=255) aacaaATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAAc > 1:4487544/1‑140 (MQ=255) aacaaATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAAc > 2:10440627/1‑140 (MQ=255) aTCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGAcc < 1:9538857/140‑1 (MQ=255) aTCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAAAGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGAcc > 2:3024591/1‑140 (MQ=255) tCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCt < 2:6346848/140‑1 (MQ=255) cccGCCAGATATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCACACAGACCTc < 2:6903602/140‑1 (MQ=255) gCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGc > 2:5105452/1‑140 (MQ=255) cAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCgg > 1:9321078/1‑139 (MQ=255) aaaTCGCGGCGTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGa < 1:7908742/140‑1 (MQ=255) aaaTCGCGGAGATAATAAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCTGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGa < 2:9617422/140‑1 (MQ=255) gcggcgTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCg < 2:11510720/140‑1 (MQ=255) cggcgTTAATTAATTAGGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGc > 1:7713760/1‑140 (MQ=255) taattaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTgaaga > 1:2599936/1‑140 (MQ=255) attaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTTGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGaaa < 1:6004709/140‑1 (MQ=255) attaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGaaa < 1:11035505/140‑1 (MQ=255) attaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGaaa < 2:607856/140‑1 (MQ=255) attaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGaaa < 1:5604675/140‑1 (MQ=255) attaattagGTAACCTATGCAATAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGGTGAGTCCGCTGAAGaaa > 1:10787804/1‑140 (MQ=255) ttaattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCACGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAAc < 1:1233644/140‑1 (MQ=255) aattagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCg > 1:6903272/1‑140 (MQ=255) ttagGTCTCCTATGCAAACAGTTGTCCTCGCAACCGGCAAGGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGc < 1:9882032/140‑1 (MQ=255) ttagGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGc > 1:285614/1‑140 (MQ=255) | GTGAAGTTTCTCGGTAAGCAATTCCGGGTTGCCAAAAGCCAGGTGGTGATTGAAAAAGGCGAACTTGGCCGCCACAAACAAATTAAAATCATTAATCCGCAACAAATCCCGCCAGAAATCGCGGCGTTAATTAATTAAGTATCCTATGCAAAAAGTTGTCCTCGCAACCGGCAATGTCGGTAAAGTGCGTGAGCTGGCGTCGCTGCTTAGCGACTTCGGTCTTGATATCGTGGCCCAAACAGACCTCGGCGTTGATTCCGCTGAAGAAACCGGC > NZ_CP025268/3098840‑3099113 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |