| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 3,249,624 | C→T | intergenic (+117/‑30) | mzrA → / → yqjC | EnvZ/OmpR regulon moderator MzrA/DUF1090 family protein YqjC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 3,249,624 | 0 | C | T | 99.3% | 3735.7 / NA | 986 | intergenic (+117/‑30) | mzrA/yqjC | EnvZ/OmpR regulon moderator MzrA/DUF1090 family protein YqjC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (531/446); minor base G (4/3); total (535/451) | |||||||||||
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| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 986 total aligned reads displayed.
AACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAG > NZ_CP025268/3249487‑3249760 | aaCTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAg > 1:11586950/1‑140 (MQ=255) aCTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAgg > 1:61258/1‑140 (MQ=255) ctctCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGt < 2:10957952/140‑1 (MQ=255) aTCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAATAGGTCCGaa > 1:11025564/1‑140 (MQ=255) 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2:6189043/140‑1 (MQ=255) ttCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAg > 1:10416565/1‑140 (MQ=255) ttCCTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAg > 1:10161170/1‑140 (MQ=255) cTTTGTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGgag < 1:4603858/140‑1 (MQ=255) gTAATAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCa > 1:971865/1‑140 (MQ=255) | AACTCTCATCGCTTCGGATAACTTCCTGTTATCCGAAACATATCACTCACTTTGGTGATTTCACCGTAACTGTCTATGATTAATGAGGCGGTGGTTAACACTACCGCTTCGTTGTCTGGACAATCGTTCCTTTGTAACAGGTCCGAATCACAATGGAAGGTTCAAGAATGAAATACCGCATCGCTTTAGCTGTTTCTCTCTTTGCTCTTAGTGCCGGTAGTTATGCCACTACCCTGTGTCAGGAAAAGGAGCAAAATATCCTTAAGGAGATCAG > NZ_CP025268/3249487‑3249760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |