Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 3,435,263 | A→G | T122A (ACA→GCA) | fmt → | methionyl‑tRNA formyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NZ_CP025268 | 3,435,263 | 0 | A | G | 99.9% | 2322.6 / NA | 663 | T122A (ACA→GCA) | fmt | methionyl‑tRNA formyltransferase |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 722 total aligned reads displayed.
AACTGGTCGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTA > NZ_CP025268/3435126‑3435398 | aCTGGTCGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTgcac < 2:3253852/140‑1 (MQ=255) aCTGGTCGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTgcac < 1:1873446/140‑1 (MQ=255) aCTGGTCGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTgcac < 2:5789458/140‑1 (MQ=255) tGGTCGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCa < 2:3523542/140‑1 (MQ=255) gTCGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCCTGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCaag > 2:8159947/1‑139 (MQ=255) gTCGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAAt > 1:4324884/1‑140 (MQ=255) gTCGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAAt > 1:4092403/1‑140 (MQ=255) tCGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCGAGGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCGTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCACTc > 2:7634461/1‑140 (MQ=255) gCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCa < 1:5797549/140‑1 (MQ=255) gAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACg < 1:8370726/140‑1 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tcgtcgCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGaa < 1:1194965/140‑1 (MQ=255) cgtcgCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGaaa > 1:8584003/1‑140 (MQ=255) cgtcgCCTATGGGTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCGGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGGGATGCAGaaa > 1:6515300/1‑140 (MQ=255) gtcgCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAAc > 2:5925493/1‑140 (MQ=255) ccTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATAGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGgt > 1:6282587/1‑140 (MQ=255) tATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGgtgt < 1:10028662/140‑1 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ggCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTCTGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGGGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGAGCGATTACTGCTGACGATAcc > 2:7034754/1‑140 (MQ=255) ggCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGCTATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATAcc > 2:2328997/1‑140 (MQ=255) ggCGCGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGAt > 1:7972167/1‑124 (MQ=255) gcgcGGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCa > 1:285492/1‑140 (MQ=255) cgGTGCTGCACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTg < 2:10448542/140‑1 (MQ=255) tgctgcACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTa < 2:8585061/140‑1 (MQ=255) tgctgcACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTa < 1:9059205/140‑1 (MQ=255) tgctgcACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTa < 1:4614662/140‑1 (MQ=255) tgctgcACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTa < 1:2025090/140‑1 (MQ=255) | AACTGGTCGCCGAACTGCAGGCTGATGTTATGGTCGTCGTCGCCTATGGTTTAATTCTGCCGAAAGCAGTGCTGGAGATGCCGCGTCTTGGCTGTATCAACGTTCATGGTTCACTGCTGCCACGCTGGCGCGGTGCTACACCAATCCAACGCTCACTATGGGCGGGTGATGCAGAAACTGGTGTGACCATTATGCAAATGGATGTCGGTTTAGACACCGGTGATATGCTCTATAAGCTCTCCTGCCCGATTACTGCAGAAGATACCAGTGGTA > NZ_CP025268/3435126‑3435398 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |