Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 1,013,520 | +G | pseudogene (463/542 nt) | zapC → | cell division protein ZapC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,013,518 | 1 | . | G | 98.1% | 2025.0 / 25.0 | 592 | pseudogene (461/542 nt) | zapC | cell division protein ZapC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (5/6); new base G (293/288); total (298/294) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.71e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 631 total aligned reads displayed.
ATGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑G‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013379‑1013651 | tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑g > 1:5314848/1‑140 (MQ=255) tGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑g > 1:11314348/1‑140 (MQ=255) cGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑g‑ggc > 2:11137318/1‑138 (MQ=255) gggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑g‑ggcg > 1:5105662/1‑137 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAGATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGTTGCTGT‑T‑g‑ggcgt > 1:7214302/1‑136 (MQ=255) ggCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑g‑ggcga > 1:10279052/1‑136 (MQ=255) gCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATATGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑g‑ggcgac > 1:1941498/1‑135 (MQ=255) cGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACg > 1:9430427/1‑140 (MQ=255) cGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACg > 1:37565/1‑140 (MQ=255) aTGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCCGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCCCTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCCGT‑TGG‑G‑CGACggc > 2:9148435/1‑138 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCa > 1:9580921/1‑140 (MQ=255) tGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCa > 2:5059824/1‑140 (MQ=255) tGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGaa > 2:5888852/1‑140 (MQ=255) gTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACg > 1:3162051/1‑140 (MQ=255) ttGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATGTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGa < 2:4199071/140‑1 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 1:6946696/1‑140 (MQ=255) aGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAg > 1:10700903/1‑140 (MQ=255) gATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCt < 1:3330350/140‑1 (MQ=255) gATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCt < 1:1558782/140‑1 (MQ=255) tACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGa < 1:8308985/140‑1 (MQ=255) aCTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGaa > 1:4496230/1‑140 (MQ=255) aCTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGaa > 1:4322671/1‑140 (MQ=255) cACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAAcc < 2:4978489/140‑1 (MQ=255) ccGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTTTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCTTGAACGACAGGCTGAAACCg < 1:5531648/139‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:7201767/140‑1 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg > 1:10401830/1‑140 (MQ=255) aCGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCg < 2:8280771/140‑1 (MQ=255) gAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGGTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCa > 1:2145791/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGATCGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 2:11275993/1‑140 (MQ=255) cAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGt > 1:2089921/1‑140 (MQ=255) ggTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTa > 2:5297248/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTaa > 1:10016882/1‑140 (MQ=255) gTCAATTTGCTGGTCGGTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTat > 2:1259808/1‑139 (MQ=255) tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCTGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc < 2:10836208/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc < 1:11138622/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc < 1:9139904/140‑1 (MQ=255) tGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAc < 1:8569727/140‑1 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAACATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 2:795465/1‑140 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTa > 1:9825137/1‑129 (MQ=255) tGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGc > 1:3463816/1‑140 (MQ=255) gTCGTTGAATCTGGCGACAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCtt < 2:11506887/140‑1 (MQ=255) gTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAg > 1:4782210/1‑140 (MQ=255) gTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGGTGTTATTGCGGGTCGCGCGTTGCAGTGG‑G‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACAGCAGGTTTATGTTGAAAGCTTCAg > 2:3857368/1‑140 (MQ=255) ttGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGc < 2:5695747/140‑1 (MQ=255) tGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg > 2:890999/1‑119 (MQ=255) tGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAgg < 1:890999/119‑1 (MQ=255) tGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAAc < 2:2143416/140‑1 (MQ=255) tGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAAc > 1:5940223/1‑140 (MQ=255) ggCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACa > 1:5133453/1‑140 (MQ=255) gCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAg > 1:6007272/1‑140 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 1:7065559/140‑1 (MQ=255) cGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑GTG‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAgg < 2:4365597/140‑1 (MQ=255) aTGCCGCACTCTGCCTGCTGGCACAACCCGGCGTGGTTATTGCGGGTCGCGCGAGGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAACTCATGATCGACAGGCTGAAACCGCAGGTTCATGGTGACGGCTTCAGCGTCGCACAGGCCGtg > 2:69376/1‑139 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc < 1:7362062/140‑1 (MQ=255) tATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGcc > 2:6085712/1‑140 (MQ=255) ctgctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGTCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACtt < 1:10947686/140‑1 (MQ=255) ctgctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACtt < 2:3254980/140‑1 (MQ=255) gctgGCACAACCCTGCGTTGTTTTTGAGCGTCGCGCGATGAAGT‑TGG‑G‑CGACGGCATTAAATTCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGTTTAATGTGGACAGCGTCAGCCTCGAACTGGCTGTCTTTCGCGCGAAcgtta > 2:9526792/1‑136 (MQ=255) gctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTaa > 2:1666962/1‑140 (MQ=255) ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAg > 2:4813535/1‑140 (MQ=255) ctgGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAg > 2:3496892/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg < 2:1489738/140‑1 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg > 2:2926596/1‑140 (MQ=255) ggCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAAAGACAGGCTGATCCCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTg > 2:7469462/1‑140 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 1:3823118/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:8742281/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa < 2:3133104/140‑1 (MQ=255) cacaACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCa > 2:6806845/1‑140 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:2017695/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:4074950/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 1:8804320/140‑1 (MQ=255) caACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGt < 2:8519912/140‑1 (MQ=255) aCCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAATTCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCt > 1:2726828/1‑140 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt > 2:2781962/1‑140 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt > 1:7598143/1‑140 (MQ=255) cccTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCtt < 1:305468/140‑1 (MQ=255) tGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCgg < 2:553104/140‑1 (MQ=255) cGTTGTTATTGCGGGTCGCGAGATGCAGT‑T‑G‑GTCGACGCCATTAAAATCATGTACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCAAACTTAAGTGCAGTATTCGGTa > 1:1711581/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:10000064/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:6555503/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:8983674/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 2:2412843/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:6645933/1‑140 (MQ=255) ttATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAg > 1:4711716/1‑140 (MQ=255) ttGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTa < 2:2341840/140‑1 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTCATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGGCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTGCGGTACACAGCTACa > 1:3977034/1‑140 (MQ=255) gCGGGTCGCGCGAGGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGTCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACACGCAGTCTAAAGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTGCGGTACACAGCTACa > 2:5170329/1‑140 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCTATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTTCACAGCTACAGCa < 1:6263053/140‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa < 2:1912372/140‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCa < 1:7987131/140‑1 (MQ=255) gTCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaa < 1:6431796/140‑1 (MQ=255) tCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 1:2624161/1‑140 (MQ=255) tCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa < 1:4449578/140‑1 (MQ=255) tCGCGCGATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCaaa > 2:775559/1‑140 (MQ=255) cgcgATGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGAAAGATTCAGCCTCTAACAGTCAGTCTAACGCGCCACCTAAAGAGCATTCTAAGGTACACAGATACAGCAAAGaa > 2:9803421/1‑140 (MQ=255) cgcgATGCAGT‑TGG‑G‑AGACGCCATTAAAATCATGAACGCCAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGaa < 2:4508730/140‑1 (MQ=255) tGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTCAAATCATGAACGCCAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCCGTCTTCGGTACACAGCGACAGCAAAGAATGGTg > 2:4689425/1‑140 (MQ=255) tGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAATGAATGGTg > 2:10443046/1‑140 (MQ=255) tGCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTg < 1:11594237/140‑1 (MQ=255) gCAGT‑TGG‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTCTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGc < 2:3730952/140‑1 (MQ=255) | ATGCCGGGCGATGCGGCCTGCGTTTGGTTGAGCGATACTCACGAGCAGGTCAATTTGCTGGTCGTTGAATCTGGCGAAAATGCCGCACTATGCCTGCTGGCACAACCCTGCGTTGTTATTGCGGGTCGCGCGATGCAGT‑T‑G‑G‑CGACGCCATTAAAATCATGAACGACAGGCTGAAACCGCAGGTTAATGTTGACAGCTTCAGCCTCGAACAGGCAGTTTAACGCGCCAACTTAAGTGCAGTCTTCGGTACACAGCTACAGCAAAGAATGGTGC > NZ_CP025268/1013379‑1013651 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |