Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 2,828,516 | +G | coding (1081/1152 nt) | mltB ← | lytic murein transglycosylase B |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 2,828,516 | 1 | . | G | 98.6% | 2220.8 / 17.9 | 650 | coding (1081/1152 nt) | mltB | lytic murein transglycosylase B |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/7); new base G (180/458); total (182/468) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 678 total aligned reads displayed.
TGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGTTAC‑T‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATC > NZ_CP025268/2828377‑2828645 | tGTCAGTCAACAATTTATGCCGGACACGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑t < 1:10453688/140‑1 (MQ=255) tGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑t < 1:10212807/140‑1 (MQ=255) tGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑t < 1:9363040/140‑1 (MQ=255) tGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑t > 1:1238191/1‑140 (MQ=255) gtcagtcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑tg > 1:9183363/1‑139 (MQ=255) tcagtcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑tgt > 1:6048641/1‑138 (MQ=255) gtcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑tgtact < 2:1817160/140‑6 (MQ=255) gtcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGctac‑tgtact < 1:10722956/140‑6 (MQ=255) tcaAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTAGTAAATAGCTAC‑TGTACTc > 2:10656101/1‑140 (MQ=255) aTGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCgcgccagcgc > 2:1515625/1‑140 (MQ=255) tGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCgcgccagcgcc < 2:10030986/140‑1 (MQ=255) gCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCgcgccagcgcca < 2:4803105/140‑1 (MQ=255) gCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCgcgccagcgcca < 2:5825832/140‑1 (MQ=255) gCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCgcgccagcgcca < 2:7165033/140‑1 (MQ=255) gACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGc < 1:2007315/140‑1 (MQ=255) gACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGc < 1:8557743/140‑1 (MQ=255) aaGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTg < 2:400979/140‑1 (MQ=255) aaGATAGCACTGTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTg < 2:6832268/140‑1 (MQ=255) tAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCt < 1:491370/140‑1 (MQ=255) cACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAAc > 2:600400/1‑140 (MQ=255) tttCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGc < 2:2457882/140‑1 (MQ=255) tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa < 2:1996260/140‑1 (MQ=255) tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa > 1:10839261/1‑140 (MQ=255) tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa > 2:7930418/1‑140 (MQ=255) tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCa > 1:2403097/1‑140 (MQ=255) tCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACACGCGCCAGCGCCCCGGCATGTCCTAACTGCCa > 2:2221167/1‑140 (MQ=255) gTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGa < 2:4391048/140‑1 (MQ=255) tCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGAc < 1:3262273/140‑1 (MQ=255) aGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCg > 1:9033951/1‑140 (MQ=255) ggAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGc < 2:6355357/140‑1 (MQ=255) gAAGATGGAGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACGCGCGCCAGCGCCACGGCGTGTCCTAACTGCCAGACCGcc < 2:5284702/140‑1 (MQ=255) acgATGGTGTTGGCGTTTCAATATTACGAGGAGGATTCAGAAACAAGCTGCTTAGCCATAGTGAAGATCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTCCTCGCGCCAGCGCCACTGCTTGTACTAACTGCCAGACCGCCa < 2:2813152/138‑1 (MQ=255) aaGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCa < 2:5450380/140‑1 (MQ=255) cgATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGTATTCAGCAAAAATCTTATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACACGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAt < 2:9821678/139‑1 (MQ=255) aGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAACTCGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCCCGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAt < 2:1134381/140‑1 (MQ=255) aGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAt < 2:1101506/140‑1 (MQ=255) tGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGc > 1:352184/1‑140 (MQ=255) gtgtTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGt < 1:7438782/140‑1 (MQ=255) gtgtTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGt < 1:5321937/140‑1 (MQ=255) ttGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTACAG‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAAt > 2:1218306/1‑140 (MQ=255) ttGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAAt < 1:5492714/140‑1 (MQ=255) ttGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAAt > 1:2122857/1‑140 (MQ=255) ttGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAAt < 1:7719897/140‑1 (MQ=255) tGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATg < 2:9652033/140‑1 (MQ=255) gCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTCCTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATggg < 1:2867565/140‑1 (MQ=255) gCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATggg > 2:8815692/1‑140 (MQ=255) gCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATggg < 2:311934/140‑1 (MQ=255) gCGGTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGACAAAAGCTGAGTAGCCAGAGGGAAGCGCACGCCCCCCTCGTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCGTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAAAggg < 2:10460161/140‑1 (MQ=255) tGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCt > 1:7093204/1‑140 (MQ=255) gCAATTTTNCGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCNCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtg > 1:6318837/1‑140 (MQ=255) gCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtg > 1:1618004/1‑140 (MQ=255) gCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtg > 1:1456350/1‑140 (MQ=255) gCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtg > 1:2244013/1‑140 (MQ=255) aaTTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtgtg < 2:7602005/140‑1 (MQ=255) aaTTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCtgtg < 2:4980089/140‑1 (MQ=255) ttACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTg < 1:1786071/140‑1 (MQ=255) gaTTCAGACAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 1:8437101/140‑1 (MQ=255) gaTTCAGAACAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 1:4005387/140‑1 (MQ=255) gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 2:7393084/140‑1 (MQ=255) gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 2:804346/140‑1 (MQ=255) gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 2:9917548/140‑1 (MQ=255) gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 1:10538106/140‑1 (MQ=255) gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 2:11104178/140‑1 (MQ=255) gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 1:6150305/140‑1 (MQ=255) gaTTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGGAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGa < 2:4635139/140‑1 (MQ=255) tCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATgg < 2:8550591/140‑1 (MQ=255) aaaGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGaa > 1:3045057/1‑140 (MQ=255) aaaGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGaa > 2:3841971/1‑140 (MQ=255) ttAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCa < 1:7267064/140‑1 (MQ=255) tAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAg < 1:9814598/140‑1 (MQ=255) gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:6757418/140‑1 (MQ=255) gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:4287993/140‑1 (MQ=255) gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:9632029/140‑1 (MQ=255) gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:11316841/140‑1 (MQ=255) gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:10272380/140‑1 (MQ=255) gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:5038203/140‑1 (MQ=255) gCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 1:8274254/140‑1 (MQ=255) gCCAGAGCGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGCCCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGGGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGAc < 2:9778519/140‑1 (MQ=255) cAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGAGGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCg < 2:9029263/140‑1 (MQ=255) agGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAc < 1:2617843/140‑1 (MQ=255) agGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAc < 1:10043932/140‑1 (MQ=255) agGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCAGTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAc < 1:80152/140‑1 (MQ=255) gggAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTAcc > 2:6699470/1‑140 (MQ=255) gAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAg < 2:6162680/140‑1 (MQ=255) gAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAg < 2:3633671/140‑1 (MQ=255) aGCTCACGCCCCCCTCTTGTATAGAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTa < 2:9361006/140‑1 (MQ=255) aGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTa > 1:5748418/1‑140 (MQ=255) aGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTa > 2:3492059/1‑140 (MQ=255) aCGCCCCCCTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGt > 2:6546526/1‑140 (MQ=255) cccccTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGcc < 1:11520655/140‑1 (MQ=255) cccccTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGcc < 1:10981355/140‑1 (MQ=255) ccccTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGGAGCCg < 2:8368742/140‑1 (MQ=255) cccTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCgg > 2:5616832/1‑140 (MQ=255) ccTCTTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGt > 1:8761583/1‑140 (MQ=255) ctTGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGcc < 2:2586956/140‑1 (MQ=255) tGTAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCaa < 1:4658563/140‑1 (MQ=255) tAAATAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACa > 2:9132793/1‑140 (MQ=255) aaTAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATc > 1:7805680/1‑140 (MQ=255) aaTAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATc > 1:5621989/1‑140 (MQ=255) aaTAGCTAC‑TGTACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATc > 2:11448623/1‑140 (MQ=255) | TGTCAGTCAAAAATTTATGCCGGACAAGATAGCACTTTCGTCAGGAAGATGGTGTTGGCGTTGCAATTTTACGAGGAGGATTCAGAAAAAAGCTGATTAGCCAGAGGGAAGCTCACGCCCCCCTCTTGTAAATAGTTAC‑T‑TACTCGCGCCAGCGCCACGGCTTGTCCTAACTGCCAGACCGCCATTGCGTAATGGGTGCTGTGGTTGTAACGGGTGATGGTGTAGAAGTTCGGCAGACCGTACCAGTACTGGTAGCCGGTGCCAACATC > NZ_CP025268/2828377‑2828645 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |