| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | 780418 = | 440 (0.650) | 129 (0.190) +G |
28/272 | 10.4 | 22.4% | noncoding (1/76 nt) | CXP41_RS04110 | tRNA‑Lys |
| ? | NZ_CP025268 | = 2525162 | 461 (0.680) | intergenic (+1/‑46) | CXP41_RS13260/CXP41_RS13265 | tRNA‑Val/tRNA‑Val | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/780555‑780418‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < NZ_CP025268/2525162‑2525087 ||| CTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑Ga < 2:4960389/140‑2 CGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGACTCTGCGACCCATGGATAAAAAGTCAACTTCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCA‑G‑GT‑GG > 2:646944/1‑140 CGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑Gaggg > 1:7016748/1‑136 GGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGT < 2:5101168/140‑1 GTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GAGT‑GGTGGGT < 1:2440610/140‑1 GTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTG > 1:4909867/1‑140 TTACCCTCCCCGTTCTCTACCAGGAACCACCTTAAAACTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAAC < 2:5695581/140‑1 TTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑G < 2:8654185/110‑1 TTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑G > 1:8654186/1‑110 CACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACC > 2:10233601/1‑140 CACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATAGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑TT‑CGTGGGTGATGACGGGATCGAAACGACGACC > 2:3457820/1‑140 cTTCTCTACAATTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GAGT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCC < 2:5796122/139‑1 TTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCT < 1:10233602/140‑1 TCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GAGT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCT < 2:10095867/140‑1 TCTCTACCAGTAACCACCTTTAAAGTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGA < 1:10561321/125‑1 CTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GAGG‑GGGGGGTGATGTCGGGATCGAACCGCCGACCCCCTC > 2:5376760/1‑140 TCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑GAGG‑GGTGGGTCAGGACGGGATCGAACCGCCGACCCCATCa > 1:10464632/1‑139 AGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTC > 2:7466227/1‑132 tacCCACATTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGG < 1:1261855/137‑1 ACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCCTA‑GA‑GGTGGGTGAAGACTGGATAGAAACGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGA > 2:7744062/1‑140 CACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑ATAGGTGGGTGAAGACGGGATCTAACCGCCGACCCCCTCATTGAAAGtgctg > 2:2756447/1‑135 CCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCCAA‑GA‑GGTGGGTGATGGCGGGATCTAACCGCCGACCCACTCATTGTAAGGGATGTG > 1:7189857/1‑140 TTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAG < 1:21748/140‑1 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCT < 1:8340113/140‑1 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCT > 2:7366752/1‑140 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCT > 1:1128494/1‑140 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCT > 2:9037908/1‑140 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCT > 2:10227840/1‑140 GGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGAGGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCT > 1:8070736/1‑140 GTGGGTCGTGCAGTATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTG < 1:3170524/140‑1 GTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTG < 1:5656117/140‑1 GTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTG > 1:1531603/1‑140 GTGGGACGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTG > 2:5497141/1‑140 TGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGA > 1:9747551/1‑140 GGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAG < 1:8566474/140‑1 GGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAA > 1:4519094/1‑96 GTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGCGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCT < 2:1891615/140‑1 TCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGTTGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTc > 1:481172/1‑139 TCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTA > 2:10817441/1‑140 TCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTA > 2:10816400/1‑140 TCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTA > 1:481168/1‑140 CGTGCCGCATTCCAACCTGCGACCAATTCATTAATAGTCAACTGCTCGACCAACTGAGATAACGA‑CCC‑G‑GG‑GGTGGGTGAAGTAGTGATCGAACCGCCGAACCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:197123/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:3692202/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 2:5803477/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:6075511/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:2587168/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:8569005/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 2:4831617/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:4050657/140‑1 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACGGCTCTACCACCTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:6103954/140‑1 GTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 2:8047994/140‑1 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCACTTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCGCACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGGGATGAAGGGATCGAACCGCCGACCGCCTCCGCGTCAGGCAGGGGCTCTCCCAGCTGAGCTAAgc > 2:2334141/1‑138 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCCACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTGGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 2:3957202/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTAGCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:8424610/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTTGGTTATGAAGGGATCGAACCTCCGACCCCCTCCTGGTAAGGGAGTTGCTCTCACAGCTGAGATAATC > 1:2684938/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGTTGAGGGGATAGTAACGCCGACCCCCTCCTTGGCAGGGTGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTcagc > 2:7447798/1‑136 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGTTGACGGGATCGTACCGCCGACCCCCTCCTGGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:1244075/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGTAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:2983021/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGTAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 2:2749069/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 2:4198228/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 2:5643327/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:8823270/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 2:1107293/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:3938486/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:7701088/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:8332737/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:9373473/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:8367326/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCT > 1:2850733/1‑124 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCACAACCAGATGAGCTAATC > 1:5517178/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTGGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 2:10587401/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACC > 1:374199/1‑100 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACC < 2:374199/100‑1 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGAAGGGATCGAACCTCCGACCCACTCCAGGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATC > 1:5755456/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGAAGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTAGTAAGGGAGGTGATCTCCCAGCAGAGCTAATC > 2:6129845/1‑140 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGAAGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCAGAGCTcaac > 2:2983355/1‑136 GCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCA < 1:8718270/140‑1 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCAC > 1:1964172/1‑140 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCC < 1:3057009/100‑1 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCC > 2:3057008/1‑100 CAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACC > 2:4665620/1‑98 tGGATTCGAACTTTCGACCAATTGATTAAATTTAAACTGCTATCCCAACTGAGCTAACGA‑CCG‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:7225793/139‑1 cGGATTGGACCCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCACCTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:7538550/139‑1 agtATTCTAACCTGCGACCATTTGATTAAAAGTCAACTGCTATACCAAATGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:1111457/137‑1 AGGATTCTAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:9538139/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTACCGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTGGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:10208688/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:4961099/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:10098258/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:3493192/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:384563/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:992660/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:781323/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:11517251/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:9373472/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATAAAAAGACAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 1:992840/140‑1 AGGATTCGAACCTGCGAACAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCAGACCCCCTCCTTGTAAGGGATGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < 2:2558403/140‑1 TTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA < 1:7396895/131‑1 TTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAA > 2:7396894/1‑131 ATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAAC < 2:605090/69‑1 ATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑G‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAAC > 1:605090/1‑69 ||| CTTCGGGCCGTTGCTAACGCAACGTTATCCTTCACGTTCTCTACCAGTAACCACCTTTAAATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGA‑CCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NZ_CP025268/780555‑780418‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GT‑GGTGGGTGATGACGGGATCGAACCGCCGACCCCCTCCTTGTAAGGGAGGTGCTCTCCCAGCTGAGCTAATCACC < NZ_CP025268/2525162‑2525087 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |