New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NZ_CP025268 | = 1293101 | 5 (0.010) | 285 (0.490) | 87/234 | 1.5 | 56.4% | noncoding (114/132 nt) | CXP41_RS06840 | RtT sRNA |
? | NZ_CP025268 | 1293574 = | 436 (0.750) | noncoding (66/85 nt) | CXP41_RS06855 | tRNA‑Tyr |
Only 100 of 443 total aligned reads displayed.
CGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGT > NZ_CP025268/1292963‑1293240 | cGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTc > 2:7036461‑M1/1‑139 (MQ=255) cGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCATCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTc > 1:6764386‑M1/1‑139 (MQ=255) gCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcga < 1:6173018‑M1/140‑4 (MQ=255) cGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCCGAATATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGTAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaacct > 2:8651660‑M1/1‑133 (MQ=255) gCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaacctt < 1:5419030‑M1/140‑9 (MQ=255) gCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATGCGTTGGGACGTTCAGGGACTGGTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGACGGATTcgaaccttcgaagtcg > 2:2374859‑M1/1‑124 (MQ=255) tggcgctCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgat > 2:11120887‑M1/4‑122 (MQ=255) tggcgctCAAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaa > 1:4429837‑M1/4‑122 (MQ=255) cGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgac < 1:8308263‑M1/140‑22 (MQ=255) cGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgac < 1:7098116‑M1/140‑22 (MQ=255) cGCTCCAGTCGACCCTTGGTCGAAGCTACTCATCCTCCCCCGCATGGGCAGATTATTTTATTGCGGATTCGTATGGCAGTTCAGGGACTTTAGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgac < 2:11611859‑M1/140‑22 (MQ=255) ctctAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTCATTGCGGATTCGTTTGTTAGTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 1:2890321‑M1/140‑24 (MQ=255) ctctAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 1:11014256‑M1/140‑24 (MQ=255) cTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 2:1410952‑M1/140‑24 (MQ=255) cTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 1:1595168‑M1/140‑24 (MQ=255) cTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 1:8505871‑M1/140‑24 (MQ=255) tCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggc > 2:9178065‑M1/1‑116 (MQ=255) tCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggc > 2:5759214‑M1/1‑116 (MQ=255) cGAGTCGCACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATGGCGGATTCGTTGGGCAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggca < 2:4017477‑M1/140‑26 (MQ=255) cGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggca < 1:11283289‑M1/140‑26 (MQ=255) cGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggca < 1:10962628‑M1/140‑26 (MQ=255) cGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggca < 1:10656117‑M1/140‑26 (MQ=255) cGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGTTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggca < 1:11133215‑M1/140‑26 (MQ=255) gtcgaACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagat > 2:8031869‑M1/3‑112 (MQ=255) cGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagattt > 1:3240865‑M1/1‑110 (MQ=255) gAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagattta < 1:387133‑M1/140‑32 (MQ=255) gAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagattta < 1:3121016‑M1/140‑32 (MQ=255) aCCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttaca < 1:2337828‑M1/140‑34 (MQ=255) ttggtcgaaGCTTCTCATCCTTCCCCTCATGGGCAGAATATTTAATTGCTGATTCGTTGTGAAGTTCAGGGACTTTTGAATGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgtaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtc > 2:7219901‑M1/5‑104 (MQ=255) ttggtcgaaGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtc > 1:4065484‑M1/5‑104 (MQ=255) ttggtcgaaGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtc > 1:356783‑M1/5‑104 (MQ=255) ggtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctg > 1:5804868‑M1/3‑102 (MQ=255) gtcGACGCGTCTCATCCTGCCCCGCCTGGGCAGAATAATTTATTGCGGATTCGTGGGGAAGTTCCGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgc < 2:8444638‑M1/139‑40 (MQ=255) gAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGGTTGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTAATCATCGCTTCGCGCATCACCCATCGGGACGTTGccctcgc > 1:856906/1‑135 (MQ=14) aaGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccc > 1:1966234‑M1/1‑97 (MQ=255) tctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGTTTCGTTGGGTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttccagtctgctccctttgg < 1:5264373‑M1/140‑49 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTTGTAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggc < 2:6095698‑M1/140‑50 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggc < 1:6357160‑M1/140‑50 (MQ=255) tcATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTCATTGCGGATTCGTTTGGTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggcc < 2:10407363‑M1/140‑51 (MQ=255) ccTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctc > 1:11510521‑M1/1‑86 (MQ=255) ccTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgatccctttggccgctc > 1:4648258‑M1/1‑86 (MQ=255) cTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGCTAGTTCAGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcg < 2:3569167‑M1/140‑56 (MQ=255) tCCCCGCTTGGGCAGATTTTTTATTTGCGGCTTCTTTTGGGTGTTGCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg < 1:7260666‑M1/140‑58 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGTATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTGAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccgtcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggcagctcggg > 2:10740705‑M1/1‑83 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg < 1:10150481‑M1/140‑58 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg > 2:9797631‑M1/1‑83 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg > 1:2215489‑M1/1‑83 (MQ=255) cccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaa < 1:11403516‑M1/140‑60 (MQ=255) ccGCTTGGGCAGAATATTTAAGAGCGGATTCGTTGGGCAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaac < 1:9218729‑M1/140‑61 (MQ=255) ccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaac > 1:7595706‑M1/1‑80 (MQ=255) ccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaac < 1:7489513‑M1/140‑61 (MQ=255) ccGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaac < 2:4485327‑M1/140‑61 (MQ=255) cGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaacc < 1:6712359‑M1/140‑62 (MQ=255) gCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccc > 2:3381098‑M1/1‑78 (MQ=255) cATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg < 2:11388681‑M1/134‑58 (MQ=255) aTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaacccca > 2:632437‑M1/1‑76 (MQ=255) gCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccac > 1:4755388‑M1/1‑72 (MQ=255) gAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccagggg < 2:7787143‑M1/140‑72 (MQ=255) ttAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccaggggtaattc < 1:5725553‑M1/140‑78 (MQ=255) tAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccaggggtaattca < 1:8155882‑M1/140‑79 (MQ=255) tGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccaggggtaattcaaatt > 2:11431224‑M1/1‑58 (MQ=255) tGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttt > 1:203488‑M1/1‑58 (MQ=255) tGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccaggggttattgatatt > 2:110109‑M1/1‑58 (MQ=255) gATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccc > 1:2819324‑M1/1‑54 (MQ=255) aGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggaaatccaatttagtggccagcaacct > 2:7377449‑M1/1‑42 (MQ=255) ggACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacgg < 2:4126270‑M1/58‑24 (MQ=255) gatagtgATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcgggg < 2:5324688‑M1/137‑114 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcat > 1:9658957‑M1/1‑19 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccc > 2:10539889‑M1/1‑19 (MQ=255) tggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg < 2:9392361‑M1/76‑58 (MQ=255) ggtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcata < 2:8340791‑M1/140‑123 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatat > 2:5465883‑M1/1‑17 (MQ=255) gtggtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgc > 2:1724739‑M1/1‑17 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaa > 1:8860762‑M1/1‑14 (MQ=255) gtggGGGAAGGATTcgaaccatcgaagtcgatgacggcacatgtacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctatttactggcctgctccctactcgggaagcggggcgcatcctgtctc > 2:3064477‑M1/1‑14 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatg > 1:6120102‑M1/1‑11 (MQ=255) ggggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatg > 2:6852624‑M1/1‑11 (MQ=255) ggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgac > 1:4495218‑M1/1‑9 (MQ=255) ggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgac > 2:6474365‑M1/1‑9 (MQ=255) ggAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccg < 2:8174328‑M1/60‑52 (MQ=255) gAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacg < 1:9426833‑M1/140‑133 (MQ=255) gAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacg < 1:1400412‑M1/140‑133 (MQ=255) gAAGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacg < 2:296836‑M1/140‑133 (MQ=255) aaGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcggg > 2:6021979‑M1/1‑7 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 1:1290338‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 2:9704102‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 1:5565103‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 2:7562836‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg < 1:7962438‑M1/140‑135 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctccctgagcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcg > 2:8771168‑M1/1‑6 (MQ=255) aGGATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaac < 2:5622292‑M1/66‑61 (MQ=255) ggATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgc < 1:1040149‑M1/140‑136 (MQ=255) gATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgcc < 2:10234581‑M1/140‑137 (MQ=255) gATTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgcc < 1:1085481‑M1/140‑137 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccg > 1:8247813‑M1/1‑3 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccg < 1:8661615‑M1/140‑138 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgcag < 2:573002‑M1/140‑138 (MQ=255) aTTcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggta > 1:8084706‑M1/1‑3 (MQ=255) tcgaaccttcgaagtcgatgacggcagatttacagtctgctccctttggccgctcgggaaccccaccacggggtaatgctttttactggcctgctcccttatcgggaagcggggcgcatcatatcaaatgacgcgccgct > 2:2244961‑M1/1‑1 (MQ=255) tACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCGCGCTGACGCTCGAGACGAACCTTAGTCGAAGGTTCTCAACCTTCCCCGCTGGTGGAGGATATTAGATTGCGGGTGCGCTGGAGAGt > 1:985487/1‑140 (MQ=11) | CGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGT > NZ_CP025268/1292963‑1293240 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |