| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | 1292725 = | 628 (0.930) | 214 (0.370) | 71/232 | 2.5 | 41.2% | intergenic (+182/+2) | narI/CXP41_RS06830 | respiratory nitrate reductase subunit gamma/RtT sRNA |
| ? | NZ_CP025268 | = 1293258 | 79 (0.140) | intergenic (‑44/+3) | CXP41_RS06840/CXP41_RS06845 | RtT sRNA/tRNA‑Tyr | |||||
Only 100 of 405 total aligned reads displayed.
CGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTGGGGGAAGGA > NZ_CP025268/1293120‑1293396 | cGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTg > 1:8718364‑M2/1‑139 (MQ=255) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTga > 2:10844970‑M2/1‑138 (MQ=255) cccTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgat > 2:554239‑M2/1‑137 (MQ=255) cccTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGACGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgat > 1:3034270‑M2/1‑137 (MQ=255) ccTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatg > 1:5225917‑M2/1‑136 (MQ=255) gtcGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGTGCAGAATAATTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggt > 2:6883656‑M2/2‑134 (MQ=255) tCGTGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATTTTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtg > 1:4708309‑M2/1‑133 (MQ=255) tCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtg > 2:1922521‑M2/1‑133 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggt > 2:2585954‑M2/1‑131 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggt > 2:5590828‑M2/1‑131 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggt > 1:6589824‑M2/1‑131 (MQ=255) gggTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggt > 2:781221‑M2/1‑131 (MQ=255) tCGTTGCCTGCGGCAACGCTCCCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggg > 1:6725706‑M2/1‑128 (MQ=255) cGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGAAGCACGAGCCCAACCTTAGTCGAAGCTTCTAATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGGTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggggggg < 2:1259642‑M2/140‑14 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGCCGAAACGTAGTCGAATCTTCTCATCCTTCCCCGCAGGGGCCGAATATTTTATTTAGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg < 1:3970398‑M2/140‑15 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGTGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:11561876‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:3658390‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:10550998‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 1:11205933‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:11538577‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:11213783‑M2/1‑126 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGACGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtggggg > 2:4110540‑M2/1‑126 (MQ=255) gCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATNTGATTGCGGAGTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaag > 1:6308604‑M2/1‑123 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCTAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 1:2611339‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCTAGCCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 1:8087413‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGCCGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 1:5869862‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 1:4870929‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCGTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 2:502280‑M2/1‑121 (MQ=255) cTGCGGCAACGCTCTCGCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATATGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaagga > 2:9535232‑M2/1‑121 (MQ=255) ctctcGCTGGCGCTCAAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGATTTCAGGGCCTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctg > 1:4527241‑M2/1‑108 (MQ=255) ctctcGCTGACGCTCCAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTATGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctg > 1:5665077‑M2/1‑108 (MQ=255) ctctcGCTGACGCCCCAGCCGAACCTGCGTCGAAGCTTCTCAGCCTTCCCCGCATGGGCAGACTACTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctg > 1:6950997‑M2/1‑108 (MQ=255) cGCTGACGCACGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCCGGGACTTTTGAAAGAgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcg > 1:1915168‑M2/1‑104 (MQ=255) tGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgctt > 1:6140419‑M2/1‑101 (MQ=255) gacgctcGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttc < 1:3295583‑M2/138‑41 (MQ=255) acgctCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcg > 1:1681758‑M2/2‑99 (MQ=255) cgcTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgc > 1:1451751‑M2/1‑98 (MQ=255) tCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCTGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaacgattacacagctctgagagattcgccct < 2:6334559‑M2/140‑46 (MQ=255) gcgATCCGAAACTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAGTCTTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgccct > 2:3137960‑M2/2‑95 (MQ=255) gAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttc > 1:9168403‑M2/1‑93 (MQ=255) aGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagagcttcgcgcatcgcccaacg < 1:296836‑M2/140‑49 (MQ=255) aaCCTTTGTCGTAGCTTCTCATCCTGCCCCGCTTGGGCAGATTATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGTACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcg > 1:5532660‑M2/1‑87 (MQ=255) tggtcgaAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCAGGGTCTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcc < 2:10488550‑M2/137‑59 (MQ=255) tAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcc < 2:5725151‑M2/140‑59 (MQ=255) agtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGTATACGCTTGAGAGTTCAGGCACTTTAGAAATTgaaggtggtgggggaaggagaactcatcgaggcgcgcttcgcccgtcgggtcgttgcct < 2:8412261‑M2/138‑60 (MQ=255) agtcgAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgtggccg < 1:2142720‑M2/138‑60 (MQ=255) gAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgcggcgcgcttcgcccttcgggtcgttgccggccg < 1:5325707‑M2/140‑64 (MQ=255) atcgtctcatccTTCCCCGCATGGGCAGATTATTTGATTGGGTATTCGCATGAGAGTTCAGGGACTTAAGTAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggca > 1:5729398‑M2/5‑75 (MQ=255) aGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggca < 1:8460099‑M2/140‑66 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGTGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggacggattactcagcgcttagagcttagcccttcgggtcgttgcctgcggcta < 2:2993121‑M2/140‑67 (MQ=255) gCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTGTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaa < 1:8189657‑M2/140‑67 (MQ=255) tctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgc < 1:7787144‑M2/140‑70 (MQ=255) tctcATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcctcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgc > 2:53851‑M2/1‑71 (MQ=255) ctcATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaaagct < 1:8242761‑M2/140‑71 (MQ=255) tcATCCTTCCCCGCATGGGCAGACTATTTAATTGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAGGGACTTGTGTCAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCGTCGAAGTCGATGACGGCAGAGTTACTGTCTGCTCCCTTTGGcg > 1:9019264/1‑139 (MQ=17) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTGGCTGGAGAGTTCAGGGTCTTTTGTAAGTgatggtggtgggggacggattacgcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcgtgcggcatcgctctctcgc < 2:3719665‑M2/140‑78 (MQ=255) ttCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgccggcggcaacgctctctcgc < 1:8555763‑M2/140‑78 (MQ=255) tCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGTGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgtggccggcggcaacgcgcgctcgct < 1:1093868‑M2/140‑79 (MQ=255) gCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgtttcaggcggcaacgcgctctagcgggccc < 1:64809‑M2/140‑84 (MQ=255) cATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgct > 2:1681040‑M2/1‑56 (MQ=255) ttgGGCAGAATTTTTGATTGCGGAGTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctc > 2:9002800‑M2/2‑55 (MQ=255) aTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctc < 2:7610383‑M2/140‑86 (MQ=255) ggCAGTATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGCGTTCGGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattcctaagcgctgcgcgcttcgccgttcgggtcggtgcctgcggcaacggtctctcgcgggcgctcgat < 2:4537389‑M2/140‑89 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgag < 1:4094096‑M2/140‑89 (MQ=255) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagt < 2:1482356‑M2/140‑90 (MQ=255) gCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagt < 1:7974362‑M2/140‑90 (MQ=255) gCAGAATAGTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACGTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactccgcgcgtcgcgcatcgcccgtcgggtcgatgccggcggcaacgcactctcggtggcgctcgcgg < 2:8275351‑M2/140‑90 (MQ=255) ttGATTGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgtttcctgcggcaacgctctcacgctggcgctcgagtcgaaacatg < 1:577221‑M2/140‑99 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGATTTCAGGGTCTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcga > 2:10791858‑M2/1‑37 (MQ=255) tGCGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGTACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactaagagctgcgcgcttcgccctacgggtcgttgcctgcggcaaagctctctcgcttgcgcacgactcgaaccttggtcgt < 2:6202179‑M2/140‑104 (MQ=255) 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1:10429913‑M2/140‑105 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccgtggtcgaag < 2:8782388‑M2/140‑106 (MQ=255) cGGATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatg < 2:5483597‑M2/39‑5 (MQ=255) gATTCGCTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagctctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctccagtcgcaacttggtagaagct < 2:2202309‑M2/140‑108 (MQ=255) cTTGAGAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcat < 2:3402977‑M2/140‑114 (MQ=255) gagTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttc > 2:7897918‑M2/1‑22 (MQ=255) gagTTCAGGGACTTTTGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgcacgagtcgaaccttggtcgaatcttcacatcctta < 1:7217856‑M2/140‑119 (MQ=255) 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1:11493701/140‑1 (MQ=255) aCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGAtggtggt < 2:9058904/140‑1 (MQ=255) ttttGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcatccttccccgcatgggca > 1:990557‑M2/1‑10 (MQ=255) tttGAAAGTgatggtggtgggggaaggattactcagcgctgcgcgcttcgcccttcgggtcgttgcctgcggcaacgctctctcgctggcgctcgagtcgaaccttggtcgaagcttctcaaccatccccgcatgggcag < 1:9730101‑M2/140‑132 (MQ=255) tGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggggg < 2:9421294/140‑1 (MQ=255) tGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCGAACCTTCGAAGTCGATGACGGCAGATTTACAGTCTGCTCCCTTTGGCCGCTCGGGAACCCCACCAGGGGTAATTCAAATTTTGAGGTAATGCTTGAGATGGTGGTggggg < 1:10119612/140‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |