| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NZ_CP025268 | = 3743324 | 0 (0.000) | 320 (0.480) | 94/272 | 1.9 | 100% | intergenic (‑100/‑82) | yiaJ/galK | IclR family transcriptional regulator YiaJ/galactokinase |
| ? | NZ_CP025268 | 3744556 = | 0 (0.000) | intergenic (+2/‑99) | galK/yiaK | galactokinase/3‑dehydro‑L‑gulonate 2‑dehydrogenase | |||||
Only 100 of 326 total aligned reads displayed.
GCTGTATCGTCGCGCTGATCCCGGAAGAGCTGGTGCCTGCCGTACAGCAAGCTGTCGCTGAACAATATGAAGCAAAAACAGGTATTAAAGAGACTTTTTACGTTTGTAAACCATCACAAGGAGCAGGACAGTGCTGACAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAATCG > NZ_CP025268/3744418‑3744695 | tctcgttctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAg > 1:9044742‑M2/139‑140 (MQ=255) tctctttttttcccctcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatgtctaaccaattgatttttaggtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 1:1540556‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 2:1603155‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 1:9535655‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 1:8425682‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 1:5235542‑M2/8‑1 (MQ=255) tctctttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGcc < 1:3123155‑M2/8‑1 (MQ=255) tttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGt > 1:11157730‑M2/129‑140 (MQ=255) tttttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGt > 1:11239608‑M2/129‑140 (MQ=255) ttttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcactatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTaa < 2:3672500‑M2/15‑1 (MQ=255) tttcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTaaa > 2:10548173‑M2/125‑140 (MQ=255) tcccatcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTaaaaa < 2:4165542‑M2/18‑1 (MQ=255) tcccatcacttctttccccaatttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccacttgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTaaaaa < 2:8762981‑M2/18‑1 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 1:10379340‑M2/23‑1 (MQ=255) tcacttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt < 1:932227‑M2/23‑1 (MQ=255) ttctttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGat < 1:4424360‑M2/27‑1 (MQ=255) ttccccattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGatatat > 1:5342030‑M2/110‑140 (MQ=255) tccccattttgtcgcgtcctgatggtagctcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaatttcataaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGTTAGATATAtt > 2:8610234‑M2/109‑140 (MQ=255) tccccatattgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATAtt < 2:10690701‑M2/32‑1 (MQ=255) cattttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGaa > 2:5883609‑M2/105‑140 (MQ=255) attttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGaaa > 1:631377‑M2/104‑140 (MQ=255) tttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATc < 1:2783118‑M2/39‑1 (MQ=255) tttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATc > 2:887883‑M2/102‑140 (MQ=255) tttgtcgcgtcctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATc < 1:11061457‑M2/39‑1 (MQ=255) tcctgatggtagctcaaagtctgccggagttcacgatctcgacagataatttataaaccattgatttttatgtcttttgaaattaatcaatcAGATTGCCTAGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTttcta > 1:10792496‑M2/93‑138 (MQ=255) cctgatggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCa < 2:5812262‑M2/49‑1 (MQ=255) atggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATAtt > 1:6523068‑M2/88‑140 (MQ=255) tggtagcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTg < 1:4669872‑M2/54‑1 (MQ=255) gcgcaaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAAtt > 1:1343184‑M2/82‑140 (MQ=255) caaagtgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcgatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTa < 2:3981796‑M2/62‑1 (MQ=255) tgtgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCa > 1:7298407‑M2/74‑140 (MQ=255) tgccgtagttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATCTATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCaaa > 2:3552239‑M2/72‑140 (MQ=255) agttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcATATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCg < 1:874461‑M2/75‑1 (MQ=255) agttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCg > 2:10977795‑M2/66‑140 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCgag > 1:7592071‑M2/64‑139 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAt > 2:2835835‑M2/64‑140 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAt > 2:7427905‑M2/64‑140 (MQ=255) ttcacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAt > 1:7436790‑M2/64‑140 (MQ=255) cacgatctcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGAt > 1:4523795‑M2/62‑84 (MQ=255) tcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGGAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAAc > 1:8360784‑M2/55‑140 (MQ=255) tcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAAc > 1:6944059‑M2/55‑140 (MQ=255) tcgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAAc > 2:9174559‑M2/55‑140 (MQ=255) cgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACa > 2:7917411‑M2/54‑140 (MQ=255) cgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACa > 2:10182441‑M2/54‑140 (MQ=255) cgacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACa > 2:1947250‑M2/54‑140 (MQ=255) gacagataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACaa > 2:10083556‑M2/53‑140 (MQ=255) gataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGaa > 1:9329804‑M2/49‑140 (MQ=255) ataatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCTCATATTGAAATTTTAAGACAAAATTGAGATCTAAAATACAATGAAg > 2:9435090‑M2/48‑140 (MQ=255) actttataaccaattgatttttaggtcgtttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGcc < 1:3757455‑M2/95‑1 (MQ=255) aatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACACGGACGcc > 2:10882267‑M2/46‑140 (MQ=255) aatttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGcc > 2:8131069‑M2/46‑140 (MQ=255) atttataaccaattgatttttatgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCt < 2:2635026‑M2/96‑1 (MQ=255) tatacccaattgatttttatgtcttttgaaattcaacaatcATATTGCCTTGTTAAAAAGTTATCGCAATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGAACAAAAAAACAAGGAAGCCTggg < 2:4317435‑M2/99‑1 (MQ=255) aaccccttgaattttctgtcttttgaaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGGGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATg < 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> 1:2589206‑M2/18‑140 (MQ=255) aaattcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAag < 1:3509065‑M2/127‑1 (MQ=255) aaatgcctccatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAAACAAGTTACGCATATTGAAAATTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGttaaacg < 2:549619‑M2/127‑3 (MQ=255) ttcatcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAagcag > 1:7951525‑M2/11‑140 (MQ=255) catcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGcc > 1:6010149‑M2/9‑140 (MQ=255) catcaatcAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGcc > 1:3254196‑M2/9‑140 (MQ=255) 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1:9703750/1‑140 (MQ=255) aGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAATCg < 1:9864315/140‑1 (MQ=255) aGATTGCATTGTTAAATATTGATCGATATATTTGAAATAAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGACTGGGATGAAAGTGACATTTGAGGAGTTAAATGCAGCCTTTAATCg < 2:11626131/140‑1 (MQ=255) | GCTGTATCGTCGCGCTGATCCCGGAAGAGCTGGTGCCTGCCGTACAGCAAGCTGTCGCTGAACAATATGAAGCAAAAACAGGTATTAAAGAGACTTTTTACGTTTGTAAACCATCACAAGGAGCAGGACAGTGCTGACAGATTGCCTTGTTAAAAAGTGATCGATATATTTGAAATCAAGTTTCGCATATTGAAATTTTAAGCCAAAAAAGCGATCAAAAAAACAAGGAAGCCTGGGATGAAAGTGACATTTGAGCAGTTAAAAGCAGCCTTTAATCG > NZ_CP025268/3744418‑3744695 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |