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                                               tgtAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAAt      >  2:3527610/1‑140 (MQ=255)
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                                               tgtAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAAt      >  1:10683230/1‑140 (MQ=255)
                                                gtAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTATAACCATGACATCTACACGCTATCAAAAAATCAATg     <  2:5005686/140‑1 (MQ=255)
                                                gtAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATg     <  1:9195430/140‑1 (MQ=255)
                                                  aataaCAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATGcc   >  2:7045439/1‑140 (MQ=255)
                                                   ataaCAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATGccc  >  1:6770022/1‑140 (MQ=255)
                                                   ataaCAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCAGTATAATAGGAAAGATTATTTTACAGGGTAAAACGCTGCCATCTACACGCTATAACAAAATCAATGacc  >  2:7215262/1‑140 (MQ=255)
                                                   |                                                                                                                                           
GCAAGCTCGTCAGGCGCTGGAGTGGATTTATCGCTTGAAGAGCCTGGTGTAATAACAATTCCCGATAGTCTTTTGCTATCGGGAATATTAACGACAACTGACGAATAAAATAAAAACACCCTGTATAATAGGAAAGCTTATTTTACAGGGTAAAACCATGCCATCTACACGCTATCAAAAAATCAATGCCC  >  NZ_CP025268/2861912‑2862102

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: