Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,292,982 | 0 | A | G | 49.1% | 34.4 / inf | 309 | noncoding (55/132 nt) | CXP41_RS06835 | RtT sRNA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/111); new base G (77/66); total (120/189) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.86e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.28e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
CCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTG > NZ_CP025268/1292843‑1293112 | cccGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGa < 1:4249953/140‑1 (MQ=255) cttGGGCATAATATTTTATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCTGTGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCt < 1:7436565/138‑1 (MQ=14) cttGGGCAGAATATTTGATTTCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCt < 2:6055125/138‑1 (MQ=255) cttGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCTCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGGGGCATAGCGCTCTCGCTCAcccg > 1:2369167/3‑137 (MQ=14) cttGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTAGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGAGGCAAAGCTCTCTCTCTGACGca > 1:9863778/3‑139 (MQ=14) ttGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATACCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGTGGAAGGATTACACAGCGCTGCGCGCTACGCCCTTCGGGTCGTTTCCAGCGGCAACGCACACTCGCAGaagaac > 2:591215/2‑135 (MQ=14) tGGGCTGAATTTTTGATTGGGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGATTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCg < 2:885547/140‑1 (MQ=14) gggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCAGAGCTGCGCCCTTCGCCCATCTGTTCGTTGCATGAGGCAACGCTCTCTCTCTCACGCTAGa > 2:10401694/1‑140 (MQ=14) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAg > 2:1740229/1‑140 (MQ=255) ggCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCGGACGCGCGAg > 1:3569168/1‑140 (MQ=255) tatTTGATTTCGGATTCGTTTGAGTATTCCGGGTCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAAcc < 2:4268858/140‑1 (MQ=255) tatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGTATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAAcc < 1:8222133/140‑1 (MQ=255) tatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAAcc < 2:1869753/140‑1 (MQ=255) tatTTGATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAAcc < 1:4110700/140‑1 (MQ=255) ttGATTGCGGAGTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTa < 1:8703600/140‑1 (MQ=255) gATTGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCATCGGGGCGTTTCCTGTGGCAACGTGCTCTCGCTTACGCACGAAACGAACCGTagt > 1:11211983/1‑138 (MQ=14) tGCGGATTCGTTTGAGAATTNCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCCGCAAAGNACGCTCGNGCACCCACCAGCCGAACCATATTCGa > 1:6240208/1‑140 (MQ=14) tGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTTCCTGCGGCAACGCGCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCATagtaga > 1:10791859/1‑135 (MQ=14) tGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGGCGAACCTTAGTCGa > 2:5714579/1‑140 (MQ=255) tGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGa < 1:3883575/140‑1 (MQ=255) tGCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTGATGCAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGa < 2:9649587/140‑1 (MQ=14) gctgATTCGTTTGAGAATTCGGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGaa < 1:10093434/137‑1 (MQ=255) gCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGaa < 2:3716774/140‑1 (MQ=255) gCGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGCCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGaa < 1:5714580/140‑1 (MQ=11) cGGATTCGTTTGAGAATTCCTGGGCTTTTGCAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGAGTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAg < 2:123339/140‑1 (MQ=14) cGGATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCAATCGGGTCGTAGACTGACGCAACCCACTATCCCTGAAGAGAGAGCCGATCATTAGTCGAAg > 2:8167726/1‑140 (MQ=9) gATTCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCt < 1:1914813/140‑1 (MQ=255) ttCGTTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTtc < 2:5762932/140‑1 (MQ=255) tCGTTTGAGAAGTCCGGGGCTTTTGCAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTCCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTtct < 2:9838509/140‑1 (MQ=14) gtttGAGAATTCCTGTTATTTTGTAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCa < 1:4968771/138‑1 (MQ=11) gtttGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCa < 2:3379992/138‑1 (MQ=255) gtttGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCa < 1:7389839/138‑1 (MQ=255) tttGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGTATTAAACAGCGCTGCGACGATCCCCCATCTTGTCGTTGCCGGCGGCACCGCGCTCTCGCGAACGCACGAGGCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAt > 2:5042228/2‑140 (MQ=9) gtggagaAGTCCGGGGCTTTTGCAAGGGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCAt < 2:8065855/137‑1 (MQ=14) attGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCAt < 1:5240942/139‑1 (MQ=255) ttGAGTATTCCGGTGCGTTTGCTAGTGATGGTGGTGGGGGACGGATTACTCAGCGCTTCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCTACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATc < 1:784553/140‑1 (MQ=14) tGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATcc < 2:7826290/140‑1 (MQ=255) gagaATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCCTGCCGAAACTAATTAGAAGCTTCGCAAcca > 1:6077145/1‑139 (MQ=14) gaATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTCGTCGAAGCTTCTCATCCTTc < 1:3276786/140‑1 (MQ=255) gaATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTc < 2:1393328/140‑1 (MQ=255) ggggttcTTTTGGAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc < 1:11140936/134‑1 (MQ=255) cggggttttttGTAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc < 2:11052857/133‑1 (MQ=255) ccGGGGCTTTTGAACGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGc < 2:537416/140‑1 (MQ=255) cGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCa < 2:9230741/140‑1 (MQ=25) tgtcattttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCAt < 1:8516270/135‑1 (MQ=12) gCTTTTGTCAGTGATGGTGGTGGGCGAAGTTTTTCATATGGCAGAGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg < 1:1123323/140‑1 (MQ=11) gCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg < 1:8364096/140‑1 (MQ=18) gCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg < 2:4571897/140‑1 (MQ=18) gCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg < 1:7580209/140‑1 (MQ=18) gCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg < 1:5981266/140‑1 (MQ=18) gCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg < 1:9524249/140‑1 (MQ=18) gCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATggg < 1:89727/140‑1 (MQ=18) ttttGTAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGATCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCa < 1:7649871/140‑1 (MQ=12) ttttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCa < 1:8742470/140‑1 (MQ=17) ttttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCa < 2:3469679/140‑1 (MQ=17) ttGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGa < 1:310717/140‑1 (MQ=17) tGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGACGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCACGCATGGGCATAAGAttgg > 2:8644386/1‑138 (MQ=11) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATAtttga > 2:2372907/1‑138 (MQ=11) gATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCAGCGGCAACGCGCTCTCGCTGACGCACGAGCCGTACCTTATTAGAATCGTCTAATCCCTCCCCGCCGTGGCCGAataaatta > 1:1031447/1‑135 (MQ=11) aaGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCACGCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCATATCAAACAACCCCGCAAGGGCAGGAAATTTTGTTGCGGATTCgctt > 1:4458953/1‑137 (MQ=1) aGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAAACCCCACTCGCGGGCGCACGAGTCGCACCGTGGTCGAAGCTTCTAAAACATACCCGCCAGGGCAGAATATGTAAATGGGGAttggttgg > 1:2495744/1‑140 (MQ=2) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCTAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGa < 2:8787669/140‑1 (MQ=11) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGa > 2:7986690/1‑140 (MQ=255) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCACGAGTCGAAACTTGCTCTAACCAACTCAAACATCCACGAATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTAGTTGGGa > 2:7538307/1‑140 (MQ=11) gATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCAGCGGCAACGCTCACTAGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCAACCTTACCCCCAAGGGCAGAATATTTAATATCGGATTCGTTGGGa > 1:9294981/1‑140 (MQ=11) gATGACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGa < 1:6349540/140‑1 (MQ=11) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCATCGCTCTCTCTCTGGCGCTCTAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTATCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGaa < 1:9814870/140‑1 (MQ=11) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGGTTCTCATCCTTCCCCGCCGTGGCAGAATATTGAATTTCGGATTGGTTGGGac > 1:10458486/1‑139 (MQ=11) aTTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATCTTTCATTGCGGATTCgattgtga > 2:6712358/1‑133 (MQ=11) aCTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGtt > 2:1305281/1‑140 (MQ=11) cgcTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAAACCACTCACGCTGGCGCGCGAGTAGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATACTTACCCCCAAGGGCAGAAATTTTAATTGCGGATTGGTTGGGTAGTTCAGGGa > 1:9657401/1‑140 (MQ=2) cTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCAGAATATTTAATTGCGGATGCGTTGGGAAGTTAAGGGACt > 2:10159052/1‑140 (MQ=14) tGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATAGTTTATTGCGGATTCGGTGGGGAGTTCAGGGACtt > 2:4729373/1‑140 (MQ=11) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTGTCTCGCTGGCGCTCGAGTGGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATACTTACCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGAGTCGTTGGGAAGGTGAGGGACtttt > 1:10741617/1‑140 (MQ=14) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGGGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTACTTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACtttt < 1:9132821/140‑1 (MQ=14) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTggg > 1:7959556/1‑124 (MQ=255) cgcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCACTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCATCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAAAATTTAAATGCGGATTCGGTGGGAAGTTCAAGGAAtttg > 2:745630/1‑139 (MQ=11) cgcgcTTAGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTGACATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTGGGACGTTCAGGGCCtttt > 2:5011369/1‑140 (MQ=11) cgcgcTGCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGCGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCATACCCGCAGGGGCAGAATTTTTATTTGCGGATGCGGTGGGAAGTTCCGGGACattt > 2:9344774/1‑140 (MQ=11) gcgcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCGTCTCAAACTTCCCCGCAAGGGCAGAAAATTTAATTGCGGATTCGTTGGGCAGTTAAGGGACTTTTg > 1:9421295/1‑140 (MQ=11) gcTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGaa < 1:5020857/140‑1 (MQ=255) ttCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCCAGTCGCACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCCGTCTAGTTTATTGCGGATTCGTTGGGGAGTTCAGGGTCTTGTGAAAg > 2:6438203/1‑140 (MQ=11) cGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTAGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGTAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTg < 1:6966424/140‑1 (MQ=11) gCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGA < 2:3792508‑M1/140‑1 (MQ=255) gCCCTTCGGGTAGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGA < 1:1617562‑M1/140‑1 (MQ=255) cccTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTGGAGTCTATCCTTTGTCGAAGCTTATCATCCTTACCCGCTTGGGCAGATTTTTTAATTGCGTATTAGTTGGGTTGTTGTGGTACTTTTGAAAGTGAt < 2:2106116/140‑1 (MQ=2) ccTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCAAGTCGACCCTTGGTGGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTTATTGCGGATTCGTTGGGGAGTTCCGGGGCGTTTGAAAGTGATG > 2:11511974‑M1/1‑140 (MQ=255) cTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGTAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGG < 1:11487752‑M1/140‑1 (MQ=255) ttCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCTAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCTTGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGT < 1:1143431‑M1/140‑1 (MQ=255) cGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGG < 2:6807585‑M1/140‑1 (MQ=255) gTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAAATTCGGAATCGGTGTGAAGTTCAGGGAATTTTGAAAGTGATGGAGGTGG > 2:10552495‑M1/1‑140 (MQ=255) gTTGCCTGCGGCAACGCTCTCACGCTGGCGCTCGAGTCGAACCGTGGTCGAAGCTTCTCATCCATCCCCGCATGGGCAGAATTTTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGGGGGGG > 1:8653038‑M1/1‑140 (MQ=255) ttGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGA < 1:7222467‑M1/140‑1 (MQ=255) gtGCCTGCGGCATCGCTCTCGCGCTGCCGCTCCAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTAGAAGCCTGCCCCGCATGGGCAGATCATTGAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCTGGGACTTTTGAACGTGAAGGTGGTGGGGGa < 2:7018354/139‑1 (MQ=255) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGTCGCTCGAGTCGAACCTTTGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAA < 1:4639910‑M1/140‑1 (MQ=255) tGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAA < 1:1059381‑M1/140‑1 (MQ=255) ggcGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCCTGGGCAGCAGATTTGATTGCGGATTCGGTGGTGAGTTCAGGGACTTGTGAAAGTGAGGGGGGGGGGGGAAGGAT > 2:7268354‑M1/2‑140 (MQ=255) cAACGCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaa > 1:1251415‑M1/1‑136 (MQ=255) gCTCTCTCGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaacctt < 1:5419030‑M1/140‑9 (MQ=255) ctctcGCTGGCGCTCGAGTCGAACCTTGGTCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTcgaaccttcga > 1:288166‑M1/1‑129 (MQ=255) | CCCGCATGGGCAGAATATTTGATTGCGGATTCGCTTGAGAATTCCGGGGCTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTGCGCGCTTCGCCCTTCGGGTCGTTGCCTGCGGCAACGCTCTCTCGCTGACGCTCGAGCCGAACCTTAATCGAAGCTTCTCATCCTTCCCCGCATGGGCAGAATATTTAATTGCGGATTCGTTGGGAAGTTCAGGGACTTTTGAAAGTGATGGTGGTGGGGGAAGGATTACTCAGCGCTG > NZ_CP025268/1292843‑1293112 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |