Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 49,911 | T→C | W30R (TGG→CGG) | folA → | type 3 dihydrofolate reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 49,911 | 0 | T | C | 99.8% | 2006.9 / ‑5.3 | 579 | W30R (TGG→CGG) | folA | type 3 dihydrofolate reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (272/305); total (273/306) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
Only 100 of 579 total aligned reads displayed.
TTTACGCTTTACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGCCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACGATCGCGTAACGTGGGT > NZ_CP025268/49775‑50047 | tttACGCTTTACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGACATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGt > 1:8943930/1‑140 (MQ=255) tttACGCTTTACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGt > 2:1415193/1‑140 (MQ=255) tttACGCTATACGTAGAGAGGCGACAAATTTAATTCTCGGGAAATCTCAATGATCACTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCCTTATCGGCATGGAAAAAGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCgga < 2:3502858/140‑2 (MQ=255) aCGCATTACGTCTAGGTGCCACAATTTTATTTAGCGGGACATCTCAAGGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTa < 2:11328414/140‑1 (MQ=255) cGCTTTACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCCATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTaa < 1:10531756/140‑1 (MQ=255) ttACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGc > 2:221200/1‑140 (MQ=255) tACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCa > 1:3014358/1‑140 (MQ=255) tACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCa < 2:8043231/140‑1 (MQ=255) tACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCa < 1:11230185/140‑1 (MQ=255) tACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCa < 2:5368159/140‑1 (MQ=255) acttataGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCaa < 2:9923409/137‑1 (MQ=255) gTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTta > 1:8317273/1‑140 (MQ=255) gTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTta > 1:5433970/1‑140 (MQ=255) gTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTta > 1:4094148/1‑140 (MQ=255) gCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTCGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGACCCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTtaaat > 2:5097452/1‑140 (MQ=255) gCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCACGCCCGGTTTAAACGCAACACCTtaaaa > 1:6886854/1‑139 (MQ=255) cGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGTTTGCGGCGGTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGTAAAACGACATGCCGTGGAACCTGCATGCCGATCTCGCCCGGTTTAATCGCAACACCTtaaaga > 2:7566507/1‑138 (MQ=255) cGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTtaaata > 2:5866574/1‑140 (MQ=255) cGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTtaaata > 1:6350627/1‑140 (MQ=255) cGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTtaaata > 1:460022/1‑140 (MQ=255) aCAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTtaaataaa > 1:8019054/1‑140 (MQ=255) aCAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTtaaataaa > 1:7145318/1‑140 (MQ=255) ttATCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTa < 1:10427177/140‑1 (MQ=255) aTCGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATg < 2:10994856/140‑1 (MQ=255) cGGGAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATggg < 1:7052391/140‑1 (MQ=255) gggAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGgc < 1:10727417/140‑1 (MQ=255) gAAATCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGgccg < 1:1639604/140‑1 (MQ=255) aaaTCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGgccgc < 1:9576405/140‑1 (MQ=255) aaTCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGgccgcc < 2:4088470/140‑1 (MQ=255) aaTCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGgccgcc < 1:3077274/140‑1 (MQ=255) aTCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCa < 1:3916990/140‑1 (MQ=255) aTCTCAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCa < 1:1841047/140‑1 (MQ=255) cAATGATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATAcc < 1:9734507/140‑1 (MQ=255) gATCAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTggg < 1:10898525/140‑1 (MQ=255) cAGTCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaat > 1:2811593/1‑140 (MQ=255) agtcTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaatc > 1:5142475/4‑140 (MQ=255) agtcTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaatc > 2:9570094/4‑140 (MQ=255) gtcTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaatca > 1:5544116/3‑140 (MQ=255) gtcTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCAGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaatca < 2:10379092/138‑1 (MQ=255) cTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaatcaat < 2:4272080/140‑1 (MQ=255) gATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCg > 2:5440808/1‑140 (MQ=255) gATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCg > 2:603103/1‑140 (MQ=255) aTTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCgg < 1:24114/140‑1 (MQ=255) ttGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGTCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGgt > 2:7773591/1‑140 (MQ=255) ttGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGgt < 2:1973285/140‑1 (MQ=255) gcttcgTTAGCGTGAGATCTCGTTATCGGCATTGAAAACGCCTTGCCGTGGAACCTTCCTGCCTATCTCGCCCGGTTTATACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATTGGCCTCCATACCTGGGAATCAATCGgtcg < 2:931738/136‑1 (MQ=255) cggcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGgtcgt < 2:1338831/140‑1 (MQ=255) gcggtagcggtaGATCGCGTTATCGGCTTGGAAATCGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCTATCGGTCGTcc > 2:4760546/1‑140 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAATCGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTcc > 2:7038403/1‑140 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGaatcaat < 1:5761542/131‑1 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTcc > 1:7920440/1‑140 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTcc > 2:8587868/1‑140 (MQ=255) gcgTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCATGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACAACTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGACTCAATCGGTCGTcc > 2:7162516/1‑140 (MQ=255) tAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTg > 2:7281043/1‑140 (MQ=255) ggTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAg < 1:7425905/140‑1 (MQ=255) tAGATCGCGTTCTCGGCATGGAAAACGCCATGCCGGGGACCCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTAAAATAAACCCGGGTTTATGGGCCGCCCTAGCTGGGCCTCACTCGGTCGTCCGTTGCCAggg > 2:5664684/1‑139 (MQ=255) aGATCGCGTGATCGGCATGGCAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGAc > 2:3275028/1‑140 (MQ=255) gATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACg < 1:862502/140‑1 (MQ=255) aTCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGc > 1:5913574/1‑140 (MQ=255) cgcgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaa > 2:6809400/1‑140 (MQ=255) cgcgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaa < 1:9265326/140‑1 (MQ=255) cgcgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaa < 1:3464370/140‑1 (MQ=255) cgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCACCACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaaaa > 2:8863996/1‑140 (MQ=255) cgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaaaa > 1:620744/1‑140 (MQ=255) cgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaaaa > 2:2704247/1‑140 (MQ=255) cgTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCaaaa > 1:3236542/1‑140 (MQ=255) tATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAata < 2:10486082/140‑1 (MQ=255) tATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAata > 1:5374300/1‑140 (MQ=255) cGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAAtatta < 1:3813086/140‑1 (MQ=255) tGGAACACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGACTCAATCGGGCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTc > 2:903788/1‑140 (MQ=255) tGGAAAACGCCATGACGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTc > 2:4509596/1‑140 (MQ=255) aaaCGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTcagca > 2:871349/1‑140 (MQ=255) aaaCGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTcagca < 1:8470071/140‑1 (MQ=255) aaCGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTcagcag < 1:1386798/140‑1 (MQ=255) aCGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGt < 1:603103/140‑1 (MQ=255) aCGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGt < 2:10128312/140‑1 (MQ=255) gCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCa < 2:10670159/140‑1 (MQ=255) ccATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCaa < 2:8379451/140‑1 (MQ=255) ccATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCaa < 1:11102571/140‑1 (MQ=255) ccATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCaa < 2:6350626/140‑1 (MQ=255) cATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAAc < 2:3716546/140‑1 (MQ=255) aTGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAAcc < 2:2445992/140‑1 (MQ=255) gCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCgg < 1:2148646/140‑1 (MQ=255) gCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCgg < 1:8787974/140‑1 (MQ=255) gCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCgg < 1:8203182/140‑1 (MQ=255) aaCCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCCGTNAACCGGGTACGGa < 1:10004283/140‑1 (MQ=255) aaCCTGCCTGCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGa < 1:121797/140‑1 (MQ=255) cctgcctgCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACg < 1:4934212/140‑1 (MQ=255) cctgcctgCCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACg < 1:6661618/140‑1 (MQ=255) ctgcctgcCGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACGa < 1:4755169/140‑1 (MQ=255) tgcctgccGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACGAt > 2:6673200/1‑140 (MQ=255) tgcctgccGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACGAt < 1:6459778/140‑1 (MQ=255) gcctgccGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACGATc > 1:9409231/1‑140 (MQ=255) gcctgccGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACGATc > 1:4410396/1‑140 (MQ=255) gccagacGATCTCGCCCGGTATAAACGCAACACAATAAATAAACCAGTGAATATTGGCCGCCATACCTGGTAAACAATAGGACGTCCTTTACCACGACGCAAAAATATTAACCTCAGCATTCAACCGGGTACGGACGATc > 2:1661536/7‑140 (MQ=255) cctgccGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACGATcg < 2:11548240/140‑1 (MQ=255) cGATCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACGATCGCGTaa < 1:368642/140‑1 (MQ=255) ctctcGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACGATCGCGTAACg < 2:4874648/139‑1 (MQ=255) aTCTCGCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACGATCGCGTAACg < 1:7730310/140‑1 (MQ=255) gCCCGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACGATCGCGTAACGTGGGt < 1:9855585/140‑1 (MQ=255) | TTTACGCTTTACGTATAGTGGCGACAATTTTTTTTATCGGGAAATCTCAATGATCAGCCTGATTGCGGCGTTAGCGGTAGATCGCGTTATCGGCATGGAAAACGCCATGCCGTGGAACCTGCCTGCCGATCTCGCCTGGTTTAAACGCAACACCTTAAATAAACCCGTGATTATGGGCCGCCATACCTGGGAATCAATCGGTCGTCCGTTGCCAGGACGCAAAAATATTATCCTCAGCAGTCAACCGGGTACGGACGATCGCGTAACGTGGGT > NZ_CP025268/49775‑50047 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |