| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 570,494 | A→G | *184* (TAA→TAG) | ybcL → | Raf kinase inhibitor‑like protein YbcL |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 570,494 | 0 | A | G | 99.6% | 3356.0 / NA | 960 | *184* (TAA→TAG) | ybcL | Raf kinase inhibitor‑like protein YbcL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (326/629); minor base T (1/3); total (327/633) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 1010 total aligned reads displayed.
TACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCCGTCAGGGAAAGAAAGTTATCA > NZ_CP025268/570357‑570630 | tACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACCCCAGTTTATGAGATAAAGTAggg < 2:7777741/140‑1 (MQ=255)tACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAggg < 1:9324144/140‑1 (MQ=255)tACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTACAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAggg < 2:8916042/140‑1 (MQ=255)tACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGACTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAggg < 1:5304895/140‑1 (MQ=255) aCCAGATTAAAGTATGCGCTCTAAAAACTGAAAATATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGt < 2:9742332/140‑1 (MQ=255) aGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGACAAAGTAGGGTgag < 1:9997358/140‑1 (MQ=255) gTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTgaga > 2:10319730/1‑140 (MQ=255) gTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGAGTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTgaga > 1:7928216/1‑140 (MQ=255) ttAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGt > 2:2217614/1‑140 (MQ=255) ttAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGt > 2:11563210/1‑140 (MQ=255) ttAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGAGTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGt < 1:7483557/140‑1 (MQ=255) tAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTa > 1:4007620/1‑140 (MQ=255) aaGTCTGCGCTCTCAAAACAGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACACCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCCGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATg < 2:6276069/140‑1 (MQ=255) aTGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTgg > 1:3847641/1‑140 (MQ=255) tGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGc > 1:2922036/1‑140 (MQ=255) gttctctAAAAACTTAAAATATTGATGTAGATTCTAACTCCAGCGTAGCGTTAGTTGGTTATATTCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCTCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGTTGTGAGTATGCTGGCa < 2:9546785/137‑1 (MQ=255) gggCTCTAAACACTGAAAAGATTCCTGTATATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACAATTTTATGAGATAAATTAGGGTGAGAGTATGCTGTCa < 2:1854885/140‑1 (MQ=255) gggCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGt < 2:3622933/125‑1 (MQ=255) gggCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCa > 2:8666072/1‑140 (MQ=255) gggCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCa > 1:9705719/1‑140 (MQ=255) gggCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCa > 1:2124377/1‑140 (MQ=255) gggCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCa > 1:4685814/1‑140 (MQ=255) gggCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCa > 2:6889611/1‑140 (MQ=255) gggCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCa > 1:2585781/1‑140 (MQ=255) gggCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCa < 1:10874194/140‑1 (MQ=255) gggCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCa < 1:6783092/140‑1 (MQ=255) tctAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAagag > 1:10518420/1‑140 (MQ=255) tAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGt > 1:8842827/1‑140 (MQ=255) cTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATACAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACt < 1:8964187/140‑1 (MQ=255) cTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGNAAGAGGTAAGACt < 1:10004820/140‑1 (MQ=255) cTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACt < 1:8505251/140‑1 (MQ=255) ttCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAg < 2:475863/140‑1 (MQ=255) tGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCg > 2:3821851/1‑140 (MQ=255) gTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTNATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCga < 1:6313165/140‑1 (MQ=255) aGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCgaag > 2:562300/1‑140 (MQ=255) aGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCgaag < 1:6179081/140‑1 (MQ=255) aGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCgaag < 1:9192427/140‑1 (MQ=255) tCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCa < 2:11039288/108‑1 (MQ=255) tAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACGCCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATAc > 1:8726154/1‑140 (MQ=255) tAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATAc > 1:11396880/1‑140 (MQ=255) atcTCCATCTGATCGTTAGTTGTTTATATGCTTTATTCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGTTATAGTATGGTGAGAGTATGCTGTCAAGAGGTATGACTATCTTAAATATCGAAGAAATACg < 2:1052104/138‑1 (MQ=255) aaCTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACg < 1:6558790/140‑1 (MQ=255) cTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGa < 2:10953225/140‑1 (MQ=255) cTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGa < 1:5684648/140‑1 (MQ=255) cTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGa < 2:11272497/140‑1 (MQ=255) ccAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATg > 1:1799655/1‑140 (MQ=255) cGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATa < 2:9374249/140‑1 (MQ=255) ggAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATaa < 2:4358472/140‑1 (MQ=255) aGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAAc > 2:10238156/1‑140 (MQ=255) gCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAAca < 1:1565669/140‑1 (MQ=255) cGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAAcat > 1:10385999/1‑140 (MQ=255) gTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAAcatc < 1:1973046/140‑1 (MQ=255) tAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAAcatcat < 2:7612378/140‑1 (MQ=255) gTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATga < 2:6137197/140‑1 (MQ=255) gTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATga < 2:2854441/140‑1 (MQ=255) gTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATga < 1:3109832/140‑1 (MQ=255) ttGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATgag < 1:7017065/140‑1 (MQ=255) ttGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATgag < 2:7345322/140‑1 (MQ=255) ttGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATgag < 2:3507547/140‑1 (MQ=255) ttATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAggg < 1:451879/66‑1 (MQ=255) ttATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGa > 2:1637969/1‑119 (MQ=255) ttATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAAcatcat < 2:10710856/133‑1 (MQ=255) ttATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTc > 2:3999258/1‑140 (MQ=255) ttATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTc > 2:4579969/1‑140 (MQ=255) atatGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCAt < 1:1113785/140‑1 (MQ=255) atatGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCAt < 1:11569671/140‑1 (MQ=255) atatGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCAt < 1:5502824/140‑1 (MQ=255) tatGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCAt > 2:142284/1‑139 (MQ=255) tatGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCAt < 1:49057/139‑1 (MQ=255) tatGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATa > 2:11445242/1‑140 (MQ=255) tGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCa < 2:2983477/136‑1 (MQ=255) gCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCa > 2:2691104/1‑117 (MQ=255) cTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGt < 1:9461853/140‑1 (MQ=255) aaTGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAggg > 1:3611543/1‑56 (MQ=255) aaTGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTaa < 1:2397700/140‑1 (MQ=255) aTGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAg < 1:5985053/140‑1 (MQ=255) aTGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAg < 1:3450619/140‑1 (MQ=255) aTGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAg < 1:5148356/140‑1 (MQ=255) aTGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAg < 2:5981204/140‑1 (MQ=255) aataaAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCctct < 1:11010542/140‑1 (MQ=255) aataaAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCctct < 1:10685232/140‑1 (MQ=255) aataaAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCctct < 2:4208075/140‑1 (MQ=255) ataaAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCtt > 2:7956965/1‑140 (MQ=255) ataaAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCtt > 2:3319905/1‑140 (MQ=255) taaAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATa < 1:432262/107‑1 (MQ=255) aaTCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGc < 1:10240371/140‑1 (MQ=255) tCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCa < 2:8496284/140‑1 (MQ=255) aaCCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCtt < 2:5133434/140‑1 (MQ=255) ccGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATCAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTtg < 1:7146184/140‑1 (MQ=255) ccGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTtg < 2:2451087/140‑1 (MQ=255) ccGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTtg < 2:1535938/140‑1 (MQ=255) gCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTtgtg < 2:3155124/140‑1 (MQ=255) cacCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCCGt < 2:545835/140‑1 (MQ=255) cacCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCCGt < 2:9122583/140‑1 (MQ=255) cacCAGTTTAAGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCCGt < 2:6601823/140‑1 (MQ=255) acCAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCCGTc > 1:7702253/1‑140 (MQ=255) ccAGTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCCGTCa < 1:1274304/140‑1 (MQ=255) gTTTATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCCGTCAggg < 2:8296400/140‑1 (MQ=255) tttATGAGATAAAGTAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGa < 2:4934678/45‑1 (MQ=255) agaTAAAGGAGGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCCGTCAGGgaaagaaa < 1:8260030/140‑1 (MQ=255) | TACCAGTTTAAAGTATGGGCTCTAAAAACTGAAAAGATTCCTGTAGATTCTAACTCCAGCGGAGCGTTAGTTGGTTATATGCTTAATGCTAATAAAATCGCAACCGCTGAGATAACACCAGTTTATGAGATAAAGTAAGGTGAGAGTATGCTGGCAAGAGGTAAGACTAACTTAAAGATCGAAGAAATACGGATGCATAAACATCATGAGATTCATAGGGTTAAGCCTCTTATGCCAGCTTTGTGTCGTATCCGTCAGGGAAAGAAAGTTATCA > NZ_CP025268/570357‑570630 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |