Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 1,846,713 | A→G | *136* (TAA→TAG) I80T (ATT→ACT) |
nudG → ynjH ← |
CTP pyrophosphohydrolase YnjH family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 1,846,713 | 0 | A | G | 99.3% | 1910.4 / NA | 565 | *136* (TAA→TAG) I80T (ATT→ACT) | nudG ynjH | CTP pyrophosphohydrolase YnjH family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (238/321); minor base T (2/2); total (242/323) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 565 total aligned reads displayed.
GGACGTTACAGGCACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAA > NZ_CP025268/1846577‑1846849 | ggACGTTACAGGCACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTGTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGc > 1:4427072/1‑140 (MQ=255) aCGTTACAGGCACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTa < 2:10029320/140‑1 (MQ=255) gCACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTg > 1:3249836/1‑140 (MQ=255) gCACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCAGTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTg > 1:9060488/1‑140 (MQ=255) cacaTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGt < 1:10824494/140‑1 (MQ=255) caTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCCGCGGATTAGTGCTAAGGGGTTTGtca > 1:4470153/1‑140 (MQ=255) caTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGtca > 1:2001841/1‑140 (MQ=255) aTGAACCTCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCGGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGtcat < 2:11135021/140‑1 (MQ=255) aTGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGtcat > 1:7647531/1‑140 (MQ=255) tGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTGTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGtcatc > 1:5490761/1‑140 (MQ=255) aaCATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCAc > 2:11535910/1‑140 (MQ=255) cAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg < 1:3566811/140‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGGTCAGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATAAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTgg > 2:8677263/1‑140 (MQ=255) ggCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCa > 1:8709567/1‑140 (MQ=255) ggCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCa > 2:1951005/1‑140 (MQ=255) ggCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGATGGCCCCTGCTGACCTTCCATTATATGAGGCGTTTATGGGTTTACTCGCCGCCCGACCAGCGGAATAGTGCTAAGGGTTTGGTCCTCACGCTGGct > 2:6688537/1‑139 (MQ=255) gcgcTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCAt < 2:849943/140‑1 (MQ=255) gcTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTg < 2:5982395/140‑1 (MQ=255) ctggtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgc > 1:5963695/1‑140 (MQ=255) tggtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgca > 1:2978427/1‑140 (MQ=255) ggtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcag < 1:5372231/140‑1 (MQ=255) ggtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcag < 1:11396388/140‑1 (MQ=255) ggtctggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcag < 1:6636305/140‑1 (MQ=255) ggtGCTCACCTGGAGTGGGGCTGCTATATCCGCTGGCCCCTGCTGACTTGCCCTGAGTCGAGGCGGTTATGGCGGGCCGCGGCGCCTGACCAGCGGCGTAGGGCTCAGGGGGTGGTCAGGACGCTGGGAGTGGAGCAGtg > 2:5171002/1‑139 (MQ=255) ggtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTgcag < 1:1852129/135‑1 (MQ=255) gtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGCTTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTAt > 2:7679278/1‑140 (MQ=255) gtGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTGTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTAt > 1:5704994/1‑140 (MQ=255) cTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTcc < 1:2167617/140‑1 (MQ=255) cTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTcc > 1:11585600/1‑140 (MQ=255) cTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTcc > 2:7801867/1‑140 (MQ=255) aCCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTc > 1:1125422/1‑140 (MQ=255) ccggAAGAGGCGCTGCAATATCGGCTGGCCCCAGCTGACATGCCATGAGTCGAGGCGTGTCTGGCGTTTCGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCGACGGGTTGTGTCAGCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCg < 2:6367651/137‑1 (MQ=255) ccTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCg < 1:1669748/140‑1 (MQ=255) cTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCgg > 1:9537426/1‑140 (MQ=255) aaGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCtt > 1:6470230/1‑140 (MQ=255) aaGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCAGTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGGTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCtt > 1:682651/1‑140 (MQ=255) agagGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCttt < 1:4674582/140‑1 (MQ=255) gagGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTa > 2:6189230/1‑140 (MQ=255) gcgcTGCACTATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAAtt < 1:7261288/140‑1 (MQ=255) gcgcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAAtt > 2:2822575/1‑140 (MQ=255) gcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAAtt > 2:8324287/1‑138 (MQ=255) gcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTAc > 2:1422789/1‑140 (MQ=255) gcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTAc > 2:2168951/1‑140 (MQ=255) gcTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTAAGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTAc > 1:37769/1‑140 (MQ=255) gCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGc > 2:5616167/1‑140 (MQ=255) gCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGc < 2:7926286/140‑1 (MQ=255) atatCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGcccc > 1:6920283/1‑140 (MQ=255) atCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCtt < 2:9793780/140‑1 (MQ=255) cTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaa < 2:2978426/140‑1 (MQ=255) tGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaat < 2:8138905/140‑1 (MQ=255) tGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaat < 2:2371229/140‑1 (MQ=255) tGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaat > 1:3160212/1‑140 (MQ=255) tGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGaat > 2:8902007/1‑140 (MQ=255) tGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTAACGCCCCTTCAGtat > 1:2430432/1‑140 (MQ=255) gctgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGa < 2:1846094/140‑1 (MQ=255) tgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTATCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATc < 1:9324615/140‑1 (MQ=255) tgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATc < 2:344993/140‑1 (MQ=255) tgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATc < 1:5119258/140‑1 (MQ=255) tgACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATc < 1:10625668/140‑1 (MQ=255) tgACATTCCATTAGTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGACGCCAGACCAGCGGATTAGTGATAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCTGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTTATc < 2:7234173/140‑1 (MQ=255) aTTCCATTATTAGAGGCGTTTAAGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTTCAGCAGTATTCCTTCGGCTGTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGa > 1:259368/1‑140 (MQ=255) ttCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGAt < 1:9862698/140‑1 (MQ=255) ttCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGAt < 2:1663830/140‑1 (MQ=255) ttCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGAt < 1:7843484/140‑1 (MQ=255) ttCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGAt < 2:4844333/140‑1 (MQ=255) ttCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTGTGGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCATCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGAt < 2:420833/140‑1 (MQ=255) tCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATa > 1:1773982/1‑140 (MQ=255) ccATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACAGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATaa > 2:6524798/1‑140 (MQ=255) ttattaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACg < 2:4375208/140‑1 (MQ=255) attaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCTCCGCCATAACAGCGGATTAGTGCTAAGTGTTTTGTCATAACGATGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACAGCCCCTTCAGAATAATTTTTATCCTGATAAAAgca > 2:6934520/1‑140 (MQ=255) attaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgca < 1:8307316/140‑1 (MQ=255) attaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgca < 1:742084/140‑1 (MQ=255) attaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgca > 2:3777913/1‑140 (MQ=255) attaGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTGTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgca < 2:10819628/140‑1 (MQ=255) agagTCGTTTATGTCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGAGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcagca < 2:5785605/140‑1 (MQ=255) agagGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcagca < 2:7442928/140‑1 (MQ=255) agagGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcagca < 1:7903537/140‑1 (MQ=255) agagGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACgcagca < 1:8218161/140‑1 (MQ=255) cggCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATGAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCCTTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATACACGCAGCACt < 2:1135963/139‑1 (MQ=255) ccgagTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGAAGAGTGCAAAGGGTTAAGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGAATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt < 2:9221140/136‑1 (MQ=255) agtcGTGTATGGCTTGACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTACGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt < 2:10223809/137‑1 (MQ=255) agGCGTTTATGGCTTTACTCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGATTTGTCATCACGCTGGCAGTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATACTTTTGAGCCTGATAAACGCAGCACt < 2:9403692/140‑1 (MQ=255) agGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt < 1:10457674/140‑1 (MQ=255) agGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt < 1:4162894/140‑1 (MQ=255) agGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt < 2:5304294/140‑1 (MQ=255) agGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt < 1:4864630/140‑1 (MQ=255) agGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt < 2:2055033/140‑1 (MQ=255) agGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACt < 1:8402013/140‑1 (MQ=255) ggCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTg > 2:10534815/1‑140 (MQ=255) ggCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTg > 1:1481836/1‑140 (MQ=255) ggCGTTTATGGCTNTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTTATACTGTTAAACGCAGCACTg > 1:10011147/1‑140 (MQ=255) cGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAg > 2:2685630/1‑140 (MQ=255) tttATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTa < 1:2700209/140‑1 (MQ=255) tttATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTa < 2:1043450/140‑1 (MQ=255) ttATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAAAAATTTTGATCCAGATAAACGCAGCAAAGAGTAc > 2:3268290/1‑140 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTgcg > 1:8013207/1‑140 (MQ=255) tACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAACTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTgcg > 1:4036492/1‑140 (MQ=255) cgccAGACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTg < 1:10165380/140‑1 (MQ=255) gACCAGCGGATTAGTGCTAAGGGTTTNGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGNGCTGACTGCCCGc < 1:6256009/140‑1 (MQ=255) ttAGTGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCctgaactgaa < 1:1381663/140‑1 (MQ=255) | GGACGTTACAGGCACATGAACATCAGGCGCTGGTCTGGTGCTCACCTGAAGAGGCGCTGCAATATCCGCTGGCCCCTGCTGACATTCCATTATTAGAGGCGTTTATGGCTTTACGCGCCGCCAGACCAGCGGATTAATGCTAAGGGTTTTGTCATCACGCTGGCATTGCAGCAGTATTCCTTCGGCTTTAATTACCGCCCCTTCAGAATAATTTTGATCCTGATAAACGCAGCACTGAGTACAGGGCTGCGCTGACTGCCCGCCTGAACTGAA > NZ_CP025268/1846577‑1846849 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |