Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NZ_CP025268 | 2,472,140 | C→T | A84A (GCC→GCT) | yfdG → | bactoprenol glucosyl transferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 2,472,140 | 0 | C | T | 99.7% | 2775.6 / NA | 729 | A84A (GCC→GCT) | yfdG | bactoprenol glucosyl transferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (364/361); minor base A (0/2); total (365/364) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.49e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 743 total aligned reads displayed.
TTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCCGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTCTT > NZ_CP025268/2472003‑2472276 | cGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGctgctg > 2:3195851/1‑140 (MQ=255) cGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGctgctg > 1:257782/1‑140 (MQ=255) cGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGctgctg > 1:2022743/1‑140 (MQ=255) gCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGa < 1:920727/140‑1 (MQ=255) gCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGa < 2:9673349/140‑1 (MQ=255) cAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGAt < 1:1742177/140‑1 (MQ=255) ttCGTTGTGGCTGTGAGCTTGAGCTTCATCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACGACAACGATGCGCTACATGCTATAGGTTGGTTTCATGGGGACACTGAGTGCGACTGTTGGTTGGGCTGCTGATAGCTg < 2:10586139/140‑1 (MQ=255) cGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATgcg < 2:6840092/140‑1 (MQ=255) tgtgGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCAc < 2:7380723/140‑1 (MQ=255) gtgGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACt < 2:6967658/140‑1 (MQ=255) ggCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTc > 1:304301/1‑140 (MQ=255) tgtgAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTcccc < 2:5601917/140‑1 (MQ=255) cgcattAGCCACTTCCCGATAGCAAAATACACATTCACGGCATCGACTACAACGCAGCGCTACCTGCTTTATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGATACTTTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTACACCCgat < 2:10244434/136‑1 (MQ=255) cTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCgatga > 1:11436632/1‑140 (MQ=255) cTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCgatga < 2:7927483/140‑1 (MQ=255) ttAGCTTCGACGCGACTGCAAAATTCACCGTGATGGCAGAGTCTACATCGATGCGCGACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCGACTGTTGGATGGTCTGCAGTTAGATGCGCACTTCCCCCGCTGATa < 2:8438245/140‑1 (MQ=255) tAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATaa < 2:10102986/140‑1 (MQ=255) aGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAAc > 1:4056611/1‑140 (MQ=255) aGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAAc < 2:11028262/140‑1 (MQ=255) gCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAAct > 1:11021998/1‑140 (MQ=255) cttcttCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTGCAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAActc < 2:122927/140‑1 (MQ=255) attcttcTCGAATGCAATTTTCACTTTCACGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTTTAAGATGAGTTCATTGGGAAACTGAGATCTAAAGTTTGTTGGGCTTCATTTAGATGCGCACGTCCCCCGATGATAActc < 2:4449258/139‑1 (MQ=255) tcttcGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCtt > 2:2527910/1‑140 (MQ=255) tcGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTc < 2:11331395/140‑1 (MQ=255) tcGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTc < 1:9527507/140‑1 (MQ=255) cgAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCAcc < 1:10573219/140‑1 (MQ=255) gAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCt < 1:8104473/140‑1 (MQ=255) gAATGCAAAAGTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTCTATGTTGGGTTCCTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGAGGGGCTGCTGATAGAGGCGCACTTCCCCCGCGGATAACTCTTGTCAccg < 2:533781/140‑2 (MQ=255) aaTGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCtt > 1:8998579/1‑140 (MQ=255) aaTGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCtt > 1:10340727/1‑140 (MQ=255) cAAAATTCACATACAAGGCATCGACAACAACCATGCGCTACATTCTATATGTTGTGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTcc < 2:10806574/140‑1 (MQ=255) aaaTGCACATTCAAGGCATCGACTACACCGATGCGCGACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGAGGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGc < 2:8625056/140‑1 (MQ=255) aTTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCa < 1:8451194/140‑1 (MQ=255) tCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATc < 2:1914380/140‑1 (MQ=255) caTTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGc < 1:10811454/140‑1 (MQ=255) aTTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGcc < 1:8870097/140‑1 (MQ=255) gCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGtgtg < 2:8260440/140‑1 (MQ=255) tCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCgg > 1:7463519/1‑140 (MQ=255) cGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGt < 1:10026043/140‑1 (MQ=255) cGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGt > 1:7067294/1‑140 (MQ=255) aCAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGt < 2:9923467/140‑1 (MQ=255) cAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTc > 1:616814/1‑140 (MQ=255) cGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTAt > 1:2696930/1‑140 (MQ=255) aTGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTc > 2:11495935/1‑140 (MQ=255) aTGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTc > 1:1195689/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATg < 1:2342044/70‑1 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTct > 2:9355008/1‑139 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 2:5980402/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 2:1389289/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 2:4196507/1‑140 (MQ=255) tGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCa > 2:8871935/1‑140 (MQ=255) gcgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCaa > 1:7637920/1‑140 (MQ=255) cgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCaaa < 1:6344008/140‑1 (MQ=255) cgcTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCaaa > 2:5824523/1‑140 (MQ=255) cTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGt > 1:11253191/1‑140 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 1:9328276/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 2:771767/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 1:5890761/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 2:4007035/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 2:2793965/140‑1 (MQ=255) cATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTCTTGGAAGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCa < 1:8261358/140‑1 (MQ=255) tGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAtt < 1:462643/140‑1 (MQ=255) tGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCAtt < 1:3617569/140‑1 (MQ=255) tataTGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTc > 1:9771694/1‑140 (MQ=255) atGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCttt > 1:2857312/1‑140 (MQ=255) atGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCttt > 1:5352992/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAggg > 1:6976146/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAggg > 2:6386432/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTGTAggg > 2:8035419/1‑140 (MQ=255) tGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATGCATAGTTCATTGTCTTTAggg > 1:7231745/1‑140 (MQ=255) tGGGTACATGGGGACACTGAGTTCTAATGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTAACCTTCTCCGCCATCATCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTAATCAAAGTTCATTGTcaatagtg > 2:9458377/1‑133 (MQ=255) gggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTGTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGa > 2:2601376/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 1:4430378/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt < 2:1668895/140‑1 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 1:6483375/1‑140 (MQ=255) ggTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGAt > 1:1621713/1‑140 (MQ=255) gTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATg > 1:5734101/1‑140 (MQ=255) gTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATg > 1:3386826/1‑140 (MQ=255) gTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATg < 2:2259176/140‑1 (MQ=255) tCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTAGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCg > 1:3739857/1‑140 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 1:3887356/1‑140 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 1:1371471/1‑140 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 1:9633231/1‑140 (MQ=255) aTGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGaa > 1:2084221/1‑140 (MQ=255) acacTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAg < 2:3372733/140‑1 (MQ=255) acTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGat < 1:11567468/140‑1 (MQ=255) gAGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATAGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtc > 1:7433381/1‑140 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCCTCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCACAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAACTGAAGATAtct > 2:7114981/1‑140 (MQ=255) aGTGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtct < 2:6512362/140‑1 (MQ=255) tGCTCCTGTTGGAGGGGCTGCTGATACATGCGCACTTCCCCCGCTGATAACTCTTGTCACCTGCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATAtctcg < 2:516970/140‑2 (MQ=255) tGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATctct > 1:8705863/1‑140 (MQ=255) tGCTACTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATctct > 1:3213399/1‑140 (MQ=255) aCTGTTGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTa > 1:6700291/1‑140 (MQ=255) ttGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTc > 2:3636908/1‑140 (MQ=255) ttGGATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTc > 2:4096222/1‑140 (MQ=255) aaggATGGGCTGCTGATCGAAGCGCACTACCCCCGATGATAACTCTTGACACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGATTCGTCTATTCAAAGATCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCATGTACTTc < 2:4983436/138‑1 (MQ=255) ggATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCt > 2:2085225/1‑140 (MQ=255) ggATGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCGGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCt > 1:4952224/1‑140 (MQ=255) tGGGCTGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTc > 2:9200919/1‑140 (MQ=255) ggCTGCTTATAGATGCTCACTTCCAACGATTATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTAGTCTATTAAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGTAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTCtt < 2:4837840/140‑1 (MQ=255) | TTCGCAGGTTTCGTTGTGGCTGTGAGCTTTAGCTTCTTCGCGAATGCAAAATTCACATTCAAGGCATCGACTACAACGATGCGCTACATGCTATATGTTGGGTTCATGGGGACACTGAGTGCTACTGTTGGATGGGCCGCTGATAGATGCGCACTTCCCCCGATGATAACTCTTGTCACCTTCTCCGCCATCAGCCTGGTGTGCGGTTTCGTCTATTCAAAGTTCATTGTCTTTAGGGATGCGAAATGAAGATATCTCTTGTAGTTCCTGTCTT > NZ_CP025268/2472003‑2472276 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |