| Predicted mutation | ||||||
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| RA | NZ_CP025268 | 2,998,678 | T→C | *410* (TAA→TAG) | CXP41_RS15650 ← | IS3‑like element IS2 family transposase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NZ_CP025268 | 2,998,678 | 0 | T | C | 99.7% | 4011.6 / NA | 1165 | *410* (TAA→TAG) | CXP41_RS15650 | IS3‑like element IS2 family transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (420/740); minor base A (4/0); total (425/740) | |||||||||||
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Only 100 of 1166 total aligned reads displayed.
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gAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTtat > 1:7918381/1‑140 (MQ=255) aGTAAAGTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATaa < 2:7449440/140‑1 (MQ=255) gTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCATATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGAGGATGCCATTCGTTAGAAt < 2:5868436/140‑1 (MQ=255) gTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCCGATATTGACAGACATCTGTTATCACTTAACCAATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGGGGCGAGAGATAACCCTGCGCACTATGCGGATGACCGTCGTtatact > 2:10910025/1‑138 (MQ=14) ccAATTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGaa < 2:8396550/140‑1 (MQ=38) cAATTGTTAATTGGATTTGCCCCTATATTTCCACACATCTGTAATCACTTAACCCATTCCAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGAGGCGAGCGATCACCCAGCGCACTAGGCGGATGCCAATCGATATAATGCTCGagc > 2:8597643/1‑138 (MQ=11) aTTGTTTATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGc < 2:8165432/140‑1 (MQ=25) tATTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGc < 1:10057780/140‑1 (MQ=11) | AGCTGATAAATAATCCCTTAGTACATCAGGAACCTTATAAAAAAACCCGCGTTCTGCAAACCTTTCTCGATAAAAGTGACAACCACTGAGTAAACAGATCAATGGAAGTAAATTCCAATTGTTTATTGGATTTGCCCTTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGC > NZ_CP025268/2998541‑2998803 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |