| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 3,309,691 | A→G | intergenic (‑82/+26) | nlpI ← / ← pnp | lipoprotein NlpI/polyribonucleotide nucleotidyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 3,309,691 | 0 | A | G | 99.7% | 2282.7 / NA | 656 | intergenic (‑82/+26) | nlpI/pnp | lipoprotein NlpI/polyribonucleotide nucleotidyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (297/356); minor base T (0/2); total (298/358) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 656 total aligned reads displayed.
GCAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑G‑CCCCCACCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAAC > NZ_CP025268/3309560‑3309827 | cAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCg > 2:376371/1‑140 (MQ=255) cAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCg > 1:4683898/1‑140 (MQ=255) cAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCg < 1:11285140/140‑1 (MQ=255) cAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCg > 1:9633249/1‑140 (MQ=255) tAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGc > 2:4899607/1‑140 (MQ=255) tAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGc < 1:5790897/140‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGc < 2:9760158/139‑1 (MQ=255) aaGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCa < 1:11226309/140‑1 (MQ=255) aaGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCa < 1:3531169/140‑1 (MQ=255) aGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCaa > 1:11489589/1‑140 (MQ=255) gCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATg < 1:10025235/140‑1 (MQ=255) cTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATgg < 1:2227310/140‑1 (MQ=255) tGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGc > 1:8640837/1‑140 (MQ=255) gTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCa > 2:2403540/1‑140 (MQ=255) gTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCa > 2:9062651/1‑140 (MQ=255) gTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCa > 2:7349758/1‑140 (MQ=255) gTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCa > 1:4110047/1‑140 (MQ=255) gTCGCAACGAAACAACAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCa > 2:6042812/1‑140 (MQ=255) tCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCaa > 1:8880009/1‑140 (MQ=255) cGCAACGAAACACCAGCGCAAAACAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGGTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAAc < 2:7051008/140‑1 (MQ=255) cGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAAc < 2:8808580/140‑1 (MQ=255) cGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAAc < 1:10861161/140‑1 (MQ=255) cGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTAc < 1:5252795/140‑1 (MQ=255) cGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTAc < 1:6859770/140‑1 (MQ=255) acacCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGc > 1:5202145/1‑140 (MQ=255) cacCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGcc < 2:3269579/140‑1 (MQ=255) cacCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGcc < 1:7349759/140‑1 (MQ=255) cacCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGcc < 1:2126876/140‑1 (MQ=255) cacCAGCGCAAAAAAGGCTTCATGTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGcc < 2:10446860/140‑1 (MQ=255) acCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGccc > 1:7809207/1‑140 (MQ=255) cAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTg > 2:2480619/1‑140 (MQ=255) aaGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGcc < 1:8265921/140‑1 (MQ=255) aaGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGcc < 1:3829163/140‑1 (MQ=255) gCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGa < 1:10227318/140‑1 (MQ=255) aTTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTc < 2:11621299/140‑1 (MQ=255) tCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTAACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGtgctgc > 2:9392549/1‑140 (MQ=255) cccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgca > 2:4459598/1‑140 (MQ=255) cccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgca < 2:3516579/140‑1 (MQ=255) ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 2:3826807/140‑1 (MQ=255) ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 1:9937849/140‑1 (MQ=255) ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 1:10717219/140‑1 (MQ=255) ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 1:5345634/140‑1 (MQ=255) ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 2:2632277/140‑1 (MQ=255) ccGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGGTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTgcag < 2:535171/140‑1 (MQ=255) gACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAATA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGt < 1:4741574/140‑1 (MQ=255) cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACGAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCGCCCTGACTCGCCCGGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTga > 1:1757089/1‑140 (MQ=255) cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTga > 1:4543500/1‑140 (MQ=255) cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTga > 1:6618636/1‑140 (MQ=255) cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTga > 2:4589292/1‑140 (MQ=255) cACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTga > 2:6255233/1‑140 (MQ=255) cGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTgaga > 1:5037690/1‑140 (MQ=255) cGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTgaga > 2:128670/1‑140 (MQ=255) cGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCAGGTTAAAA‑GCCCCCCGACGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTgaga > 2:2161035/1‑140 (MQ=255) gaatgaaCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCt < 1:7935791/140‑1 (MQ=255) gaaCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGt < 1:10087259/140‑1 (MQ=255) gaaCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGt < 2:4020293/140‑1 (MQ=255) gaaCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGt < 2:10107719/140‑1 (MQ=255) gaaCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCGTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGt < 2:7270231/140‑1 (MQ=255) aCGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCg > 1:6057102/1‑140 (MQ=255) cGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGc < 1:2463201/140‑1 (MQ=255) cGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGc < 1:3083561/140‑1 (MQ=255) gTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGct > 1:1201565/1‑140 (MQ=255) gTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGct > 1:9736669/1‑140 (MQ=255) tCCTGGTCCCGGTTGCTAACAAGGCGGCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCCGCGGAGGGCAAATGGCACCCGGCCTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGctt < 2:231000/140‑1 (MQ=255) tGTTCCCTGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGATTGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGTAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGcttctt < 1:2685889/140‑1 (MQ=255) gTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCttt < 2:8028730/140‑1 (MQ=255) ttCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTa < 1:3974195/140‑1 (MQ=255) tCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAATC‑CCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTaa < 1:2035077/140‑1 (MQ=255) cGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGc > 1:3438167/1‑140 (MQ=255) cGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGc > 2:1529620/1‑140 (MQ=255) ggTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCt > 2:11010943/1‑140 (MQ=255) ggTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCt > 2:1059089/1‑140 (MQ=255) ggTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAAGGGCAACCTTACTCGCCCTGGTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCt < 2:5731164/140‑1 (MQ=255) gTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGTTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTc > 2:7508771/1‑140 (MQ=255) ttGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCa > 1:2990144/1‑140 (MQ=255) gCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGa < 2:11338372/140‑1 (MQ=255) gCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGa < 1:4329292/140‑1 (MQ=255) gCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGa < 1:947322/140‑1 (MQ=255) cTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGAc > 2:9617811/1‑140 (MQ=255) cTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGAc > 1:8518276/1‑140 (MQ=255) aaCAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACgg > 2:4287467/1‑140 (MQ=255) aaCAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACgg > 1:8968290/1‑140 (MQ=255) aaCAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACgg > 2:7858312/1‑140 (MQ=255) acggCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATa < 2:10709814/138‑1 (MQ=255) aaGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATa < 2:2928906/140‑1 (MQ=255) aaGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATa < 1:9289163/140‑1 (MQ=255) ggCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACg > 2:1999497/1‑140 (MQ=255) gTCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGcc > 2:6721575/1‑140 (MQ=255) tCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGccc < 2:1790439/140‑1 (MQ=255) tCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTCGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGccc > 2:5530483/1‑140 (MQ=255) tCCTGCCCGGTTAAAA‑GCCCCCCGCAGAAGCGGAGGGCAAATGGAAACCTTACTCGCCCTGTTAAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCTCTTATTTAATGCTCAGACGGATACGGccc > 2:5079049/1‑140 (MQ=255) ccGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGa < 1:5474607/140‑1 (MQ=255) cGGTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGAt > 2:6553429/1‑140 (MQ=255) gTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCa < 2:8291035/140‑1 (MQ=255) gTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCa < 2:8574385/140‑1 (MQ=255) gTTAAAA‑GCCCCCCGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCa < 1:7274710/140‑1 (MQ=255) agccccccGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGCTACGGCCCTGGCGATCAACTTcc > 2:7704019/4‑140 (MQ=255) cccGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATa < 1:702041/114‑1 (MQ=255) cccGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACg > 1:6258093/1‑116 (MQ=255) cccGCCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAAc > 1:1042621/1‑140 (MQ=255) | GCAAGCGTAAGTGCTGTCGCAACGAAACACCAGCGCAAAAAAGGCTTCATTTCCCACTCCCGAAGACCACGGTTGAATGAACGTCCTGTTCCCGGTTGCTAACAAGGCGTCCTGCCCGGTTAAAA‑G‑CCCCCACCGCAGCGGAGGGCAAATGGCAACCTTACTCGCCCTGTTCAGCAGCCGGAGCTTCCGGTGCTGCAGCAGGTTGAGACTGCTCAGTCGCTTCTTTAATGCTCAGACGGATACGGCCCTGGCGATCAACTTCCAGAAC > NZ_CP025268/3309560‑3309827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |