Predicted mutation | ||||||
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RA | NZ_CP025268 | 3,857,882 | T→C | N4S (AAC→AGC) *116* (TAA→TAG) |
yidG ← yidH ← |
DUF202 domain‑containing protein YidH family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NZ_CP025268 | 3,857,882 | 0 | T | C | 99.9% | 2643.3 / NA | 758 | N4S (AAC→AGC) *116* (TAA→TAG) | yidG yidH | DUF202 domain‑containing protein YidH family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (274/483); minor base A (0/1); total (274/484) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 758 total aligned reads displayed.
AACATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGTTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCATTGCGTAACCAGCGCAAGT > NZ_CP025268/3857747‑3858018 | aaCATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATc < 1:10194367/140‑1 (MQ=255) aaCATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATc > 2:263759/1‑140 (MQ=255) aaCATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATc > 2:2430021/1‑140 (MQ=255) aaCATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATc < 2:10493603/140‑1 (MQ=255) aaCATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATc < 1:7304202/140‑1 (MQ=255) cATGCCCGCCTTGTTCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCAGTAGCCCAGCATGGTACGAACCCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGGCCTGGGTCGGCAATGCGTCGGGCTTTGCGGCTATCCg > 2:796485/1‑140 (MQ=255) cATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCg > 1:11391745/1‑140 (MQ=255) cATGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCg > 1:2641388/1‑140 (MQ=255) aTGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCgg < 2:8722325/140‑1 (MQ=255) aTGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCgg < 2:2088231/140‑1 (MQ=255) tGCCCGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGc > 2:763815/1‑140 (MQ=255) ccGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATc < 1:9755294/133‑1 (MQ=255) ccGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATc > 2:9755354/1‑133 (MQ=255) ccGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATc < 1:8624764/133‑1 (MQ=255) ccGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATa > 2:11165710/1‑140 (MQ=255) ccGCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATa < 2:9202926/140‑1 (MQ=255) gCCTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATaca < 1:7874992/140‑1 (MQ=255) cccTGCTCCCAGTAGTGTCTGAAACCCAACCCCACCCACCCGCCCTAGCCCAGCATGCAACCACACCACCCCACTGATGTCCCCACCGCCCGCAGTCCAGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTATGCCGCTATCCGGCATaca < 2:1864655/139‑1 (MQ=255) cTGGTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATacaac > 1:4988879/1‑140 (MQ=255) ggTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAacac > 2:3114025/1‑140 (MQ=255) ggTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAacac < 1:841849/140‑1 (MQ=255) ggTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAacac < 1:8053238/140‑1 (MQ=255) ggTGCCAGTAGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAacac < 1:5296885/140‑1 (MQ=255) gTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACAcc < 2:2887390/140‑1 (MQ=255) gTGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACAcc < 2:6263741/140‑1 (MQ=255) tGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCa > 2:3358150/1‑140 (MQ=255) tGCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCa < 2:46088/140‑1 (MQ=255) gCCAGTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAg < 1:2369205/140‑1 (MQ=255) gTTGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTccc > 2:10078959/1‑140 (MQ=255) ttGTGTTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCa < 2:8152945/140‑1 (MQ=255) tgtTTGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATaa < 1:1761633/140‑1 (MQ=255) tGATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGAt > 2:517883/1‑140 (MQ=255) gATAGCCAACGCCATCAACGCGCCGGAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATc < 2:8483264/140‑1 (MQ=255) aTAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCa > 2:10619655/1‑140 (MQ=255) tAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAacac > 2:11431390/1‑122 (MQ=255) tAGCCAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCAc > 1:3152328/1‑140 (MQ=255) ccAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGc > 1:4794471/1‑140 (MQ=255) ccAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGc > 1:3549969/1‑140 (MQ=255) ccAACGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGc > 1:817639/1‑140 (MQ=255) aaCGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCa > 1:9569831/1‑140 (MQ=255) aaCGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGAAGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACCACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCa > 2:7030234/1‑140 (MQ=255) cGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACg < 1:7585579/140‑1 (MQ=255) cGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACg < 1:3772515/140‑1 (MQ=255) cGCCATCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACg < 1:6346060/140‑1 (MQ=255) tCAACGCGCCGTAGCCCAGCATGGTACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCaa < 2:965354/140‑2 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tACGAAACCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATtaataa > 1:4040074/1‑140 (MQ=255) caCCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGt < 2:3583233/139‑1 (MQ=255) aaCCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGt > 1:11228140/1‑140 (MQ=255) aaCCACGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCAGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGt < 1:1940159/140‑1 (MQ=255) cGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATAGAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGgtg > 1:10950776/1‑140 (MQ=255) cGCCAGTGATGTGCGCTCCGGCTGCAGTCCTGGGTCGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGgtg > 2:1667758/1‑140 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(MQ=255) cGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTc < 2:4706/140‑1 (MQ=255) cGGCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTc < 2:7751738/140‑1 (MQ=255) gccctGCGTCTGGCTTTGCGGCTAGCCGGCATACATGACCTGTCCCTTAAGGATCACCGCCACGACCATCAATAGTCAGCTCAGGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTGTCAGACGCATCGCTTTGTCag > 2:1325243/5‑139 (MQ=255) gCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCAt > 2:9874028/1‑140 (MQ=255) gCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCAt > 1:5607321/1‑140 (MQ=255) gCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCAt > 1:5825954/1‑140 (MQ=255) gCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCAt > 1:11137450/1‑140 (MQ=255) gCAATGCGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCAt > 2:10280116/1‑140 (MQ=255) aaTGCGTCTGGCTTTTCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCATTATTAAGCTAATGATTATTAAGCTGTTGGTGTATGTCAGGTACTCTTTCTGACGCATCGCTTTTTctatg > 2:6892066/1‑136 (MQ=255) cGTCTGGCTTTGCGGCTATCCGGCATACAACACCAGTCCCATAACGATCACCGCCACGACCATCAATATTAAGCTAATGATTAATAAGCTGTTGGTGTAGGGCAGGTCCTCTTTCAGACGCATCGCTTTTTCATTGCGTa < 1:2860339/140‑1 (MQ=255) ttGCGGCTATACGGCATACAACAACAGTCCCATAACGATCACCGCCAAGACCATCTATTTTAAGCTAAGTATTAATAAGCTGTTGTTGTAGGGAAGGTCCTATTTCATACGCATCGCTTTTTCATTGCGTATCCAGCGCa < 2:564171/140‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |