| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,009,615 | A→G | *610* (TAA→TAG) | recQ → | ATP‑dependent DNA helicase RecQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,009,615 | 0 | A | G | 99.7% | 2030.1 / NA | 586 | *610* (TAA→TAG) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase RecQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (199/385); minor base T (1/1); total (200/386) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 589 total aligned reads displayed.
GAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAATCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTCCCGATTTCTTTT > NZ_CP025268/4009478‑4009751 | gagggCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGCAATGCTCAGCGTTACCGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag < 2:1676374/137‑1 (MQ=255) gaTGGCTGTACAGATGCCGTTCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGGTATCGGCGTTGGGGTGCGCTAGCTGGAACGCGGTGGGTTACCGTGTATGGCGCTGGTTCGTGGGCCTGTTGATGGGGATGACGTGGGGTAGTcag > 2:6034879/1‑140 (MQ=255) gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag < 2:417228/140‑1 (MQ=255) gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag < 1:8107516/140‑1 (MQ=255) gaTGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAAGGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcag < 2:6171101/140‑1 (MQ=255) aTGGCTGAACAGATGCCGATCAACGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTGTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcagc > 2:1007419/1‑140 (MQ=255) tGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcagca > 1:7160371/1‑140 (MQ=255) tGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTcagca < 2:5905542/140‑1 (MQ=255) aTGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAg > 1:843784/1‑140 (MQ=255) gCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTg > 1:9109705/1‑140 (MQ=255) gCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTg < 1:11208071/140‑1 (MQ=255) gCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTg > 1:5982975/1‑140 (MQ=255) ccGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGc < 2:807050/140‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAACTGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACAGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGcc < 2:2518750/140‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATTCTCATCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGATTTGGCATACCGTTTATGGAGCTGATTCGTTCGCATGTTGATGTCGATGACGAAGATTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGcc < 2:7838311/140‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGcc < 1:1178284/140‑1 (MQ=255) cGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGcc < 2:9036596/140‑1 (MQ=255) gATCAGCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTATCGGAGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGATTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCAAGTTGATGTAGATGACGATGAGAAGTCAGCAGCTTAAATAAGTGCCa > 2:10218760/1‑140 (MQ=255) gATCACAGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGTCGTTGGGATTCGAAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCTCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAATAAAGTGCCa > 2:7635337/1‑140 (MQ=255) aCCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTAt < 1:3215834/140‑1 (MQ=255) cGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGa > 1:1537527/1‑140 (MQ=255) gCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGaa < 1:4789110/140‑1 (MQ=255) cAGCGACACGCACAGCGTGCACGGCCCTGGGAAGCGCAAGCTGGAACGCTATGGCACACCGTATATGGCGCTGATTCGTGCGCAAGTTGAGGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGa < 2:6728587/140‑1 (MQ=255) cAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGa < 1:7229301/140‑1 (MQ=255) cAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTGGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGa < 2:530687/140‑1 (MQ=255) aGCGTATTGCTCAGCGTTTACGGTGTTGGGATGCGCTTGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGGTATGATTCGTGCGCATGTTGATGGCTATGACGTTGAGTAGTAAGCAGCATAAAAAATTGCCTGTTTgttgta < 2:714637/140‑6 (MQ=255) aTGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTa > 2:5744382/1‑140 (MQ=255) aTGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTa < 2:7412715/140‑1 (MQ=255) cTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAAc > 2:1347605/1‑140 (MQ=255) aCGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCcg < 1:9759498/140‑1 (MQ=255) aCGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCcg < 1:8001828/140‑1 (MQ=255) aCGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCcg < 2:3836557/140‑1 (MQ=255) aCGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCcg < 1:4051983/140‑1 (MQ=255) aCGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCcg < 1:4941348/140‑1 (MQ=255) cGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCATACCGTTTCTCGCGCTGAGTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGCAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAACACTCCGTAAACGTTTCCCCagc < 2:425177/140‑1 (MQ=255) cGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCcgc < 1:5357770/140‑1 (MQ=255) cGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAATCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAg < 1:9340453/140‑1 (MQ=255) tttGGGATGCGCAAGCTGGATCGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGt < 2:8781711/139‑1 (MQ=255) gTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGt < 1:9567325/140‑1 (MQ=255) gTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGt < 1:9017905/140‑1 (MQ=255) gTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGt > 2:11112861/1‑140 (MQ=255) gTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGt > 2:9903845/1‑140 (MQ=255) gTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGt > 1:2123559/1‑140 (MQ=255) gATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAat < 1:5061684/140‑1 (MQ=255) cgcAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAatgtat > 1:4248980/1‑140 (MQ=255) ggAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGt < 2:4510825/140‑1 (MQ=255) tttGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTtct < 2:5108229/140‑1 (MQ=255) gtGGCAACCCGTTTCTGGCGCTGATGCGTGCGCAGTGTGATGGCGATGACGCAGAGTAGTCAGCAGCATACAAAACGGCCAGTAGGAAGACACCGTAAACGGTTCCCCCGCGAGTCAAATGTAGGATGATCTTATTtctc < 2:2350154/139‑1 (MQ=255) ggCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCTTGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATACAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCAc < 1:4609116/140‑1 (MQ=255) ggCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCAc < 2:916488/140‑1 (MQ=255) ggCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCAc < 2:3101569/140‑1 (MQ=255) gCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATg > 1:2471848/1‑128 (MQ=255) gccGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCg < 1:1970240/139‑1 (MQ=255) cccGTTTAGGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCCCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCg < 2:10333428/139‑1 (MQ=255) cccGTGTCTGGCGCTGATTCGTGCGCAGCTTGATGGCGATGACGAAGCGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTAGGAAGACGCCGTAACCGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATGTCTCCCCGTCg < 2:10851625/139‑1 (MQ=255) aCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACTTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCg > 2:1207697/1‑140 (MQ=255) aCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCg < 1:1758456/140‑1 (MQ=255) aCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCg < 1:7808481/140‑1 (MQ=255) aCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCg < 1:7515792/140‑1 (MQ=255) aCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCg < 1:6104857/140‑1 (MQ=255) aCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCg < 2:10985301/140‑1 (MQ=255) aCCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCAAAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCg < 1:8650594/140‑1 (MQ=255) aCCGATTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTAGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCg < 2:1127737/140‑1 (MQ=255) cGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGcc < 2:3571022/140‑1 (MQ=255) gTTTATGGCTCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGACGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCACCGCGAGTCAAATGTATGGTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCa < 2:3457064/140‑1 (MQ=255) gTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCa < 1:6205340/140‑1 (MQ=255) tttATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCAt < 1:4844478/140‑1 (MQ=255) tttATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCAt < 1:3423929/140‑1 (MQ=255) tttATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCAt < 2:8183495/140‑1 (MQ=255) ttATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCCGTATGAAGACTCCGTAACCGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATGTCTCACCGTCGCCATg < 2:11508417/140‑1 (MQ=255) ttATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATg < 1:4472471/140‑1 (MQ=255) tATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATgg > 2:4968181/1‑140 (MQ=255) aTGGCTCTGATTATTGATCATGTTTATTGCGATGAAGAAGAGTAGTCAGCTGATTAATATAGTGCCTGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTACCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGt < 2:796413/140‑1 (MQ=255) aTGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGt < 2:1892352/140‑1 (MQ=255) tGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTg < 2:3296101/140‑1 (MQ=255) gggCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCAGAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAAGGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTg < 2:5531600/139‑1 (MQ=255) ggCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGc < 1:2567426/140‑1 (MQ=255) gcgcTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGTTGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGTAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGca < 2:272522/140‑1 (MQ=255) gcgcTGATTCGTGCGCATGTGGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGCAGACTCCGTAACCGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGca < 1:677134/140‑1 (MQ=255) gcTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGt < 1:10932912/135‑1 (MQ=255) tGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACAtt > 1:10652153/1‑140 (MQ=255) gATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATtg < 2:4721565/140‑1 (MQ=255) ttCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATtgtg < 2:567510/140‑1 (MQ=255) cGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCGAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTACCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCAATGGTGCACATTGTGgc < 2:10618390/140‑1 (MQ=255) gTGCGCATGTTGATGGCGAAGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGGAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGgca < 2:6336316/140‑2 (MQ=255) tGCGCATGTTGATGGCGATGACGAATAGAAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAATTGTATGTGGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGgcgc > 2:2118293/1‑140 (MQ=255) tGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGgcgc > 2:2020505/1‑140 (MQ=255) tGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGgcgc > 1:6884256/1‑140 (MQ=255) cATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTAt < 1:2923288/140‑1 (MQ=255) aTGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATg < 2:3983905/140‑1 (MQ=255) aTGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATg < 1:5636151/140‑1 (MQ=255) aTGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATg > 2:8481466/1‑140 (MQ=255) gTTGATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAg > 1:8758467/1‑140 (MQ=255) gATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGccc > 1:2176358/1‑140 (MQ=255) gATGGCGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGccc > 2:968261/1‑140 (MQ=255) cGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTc > 2:2881917/1‑140 (MQ=255) cGATGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTc < 1:10073454/140‑1 (MQ=255) aTGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTccc > 1:3835271/1‑140 (MQ=255) aTGACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTccc > 1:10489328/1‑140 (MQ=255) gACGAAGAGTAGTCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTCCCGa < 1:6492439/140‑1 (MQ=255) | GAGATGGCTGAACAGATGCCGATCACCGCCAGCGAAATGCTCAGCGTTAACGGCGTTGGGATGCGCAAGCTGGAACGCTTTGGCAAACCGTTTATGGCGCTGATTCGTGCGCATGTTGATGGCGATGACGAAGAGTAATCAGCAGCATAAAAAAGTGCCAGTATGAAGACTCCGTAAACGTTTCCCCCGCGAGTCAAATGTATGTTGATGTTATTTCTCACCGTCGCCATGGTGCACATTGTGGCGCTTATGAGCCCCGGTCCCGATTTCTTTT > NZ_CP025268/4009478‑4009751 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |