| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 4,505,921 | A→G | intergenic (‑557/‑52) | insG ← / → nanX | IS4‑like element IS4 family transposase/MFS transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 4,505,921 | 0 | A | G | 99.8% | 1419.1 / ‑5.1 | 408 | intergenic (‑557/‑52) | insG/nanX | IS4‑like element IS4 family transposase/MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (186/220); total (186/222) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 | |||||||||||
Only 100 of 411 total aligned reads displayed.
GGTATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGACTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGTATTTGATGGCT > NZ_CP025268/4505784‑4506057 | ggTATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCt < 2:6706270/140‑1 (MQ=255) gTATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAATACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTc > 2:1134210/1‑140 (MQ=255) tATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTcc < 2:316164/140‑1 (MQ=255) tATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTcc > 1:9139786/1‑140 (MQ=255) tATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTcc > 1:7413809/1‑140 (MQ=255) tATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTcc < 2:7076942/140‑1 (MQ=255) ttATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGTAAAAGATTGTACTGATTAGGTTTTGATAAAAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAAGATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATAtt < 2:8001985/140‑1 (MQ=255) aTCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGGAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTa > 1:10265383/1‑140 (MQ=255) aTCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTa > 1:10898433/1‑140 (MQ=255) ttCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACttt < 1:5581821/140‑1 (MQ=255) ttCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGACGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACttt < 2:1082046/140‑1 (MQ=255) ttCATAGAGTGAAATATGTGAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACttt < 1:8165307/140‑1 (MQ=255) aTAGCGTGAAATATGTGAAGACGAAATGGACGAAAAGATTGGACTGAATAGGGATGGATACCAATCACTAGTACTGGCGTATTTGAAGACACTATAAATATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTATAAg < 2:5288733/140‑1 (MQ=255) aTAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAg < 1:11133378/140‑1 (MQ=255) aTAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAg < 1:1789154/140‑1 (MQ=255) cgagTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAggg < 1:3817163/139‑1 (MQ=255) agagTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAggg < 2:775552/140‑1 (MQ=255) agagTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAggg < 2:4706122/140‑1 (MQ=255) gagTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGc < 1:3996841/140‑1 (MQ=255) aaaTATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTatat > 2:10639583/1‑140 (MQ=255) aaTATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTAGAATACAATATAATTATTTATTGATATTGTTGAGGCACCCTAATATTTAATTTAAGGGCTATAtt > 1:8342679/1‑140 (MQ=255) tatGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAg < 2:11151107/140‑1 (MQ=255) tAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATATGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATaa > 2:4863528/1‑140 (MQ=255) agaagaAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAaca > 1:10992947/1‑140 (MQ=255) agaaATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAg > 2:2390992/1‑140 (MQ=255) aaaGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATg > 2:1643458/1‑140 (MQ=255) aGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGc < 2:2675145/140‑1 (MQ=255) aTTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCaa < 2:6917764/140‑1 (MQ=255) tACTGATTAGTTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGc < 2:10226550/140‑1 (MQ=255) tACTGATTAGGTATTTATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTTGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGc < 2:4072417/140‑1 (MQ=255) tACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGc > 1:2450159/1‑140 (MQ=255) tACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGc < 2:9666658/140‑1 (MQ=255) aCTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCa < 1:2241695/140‑1 (MQ=255) aCTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCa < 1:8774716/140‑1 (MQ=255) aCTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCa < 1:2711934/140‑1 (MQ=255) cTGATTAGTTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCAt < 2:8737221/140‑1 (MQ=255) aTTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGt < 1:5040383/140‑1 (MQ=255) aTTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGt > 1:8529339/1‑140 (MQ=255) aTTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGt > 1:7084345/1‑140 (MQ=255) aTTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGt > 1:6801440/1‑140 (MQ=255) aTTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGt > 1:9170484/1‑140 (MQ=255) aTTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGt > 1:9974080/1‑140 (MQ=255) tAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAggg < 1:4123151/94‑1 (MQ=255) gTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGc > 2:6264294/1‑130 (MQ=255) ttGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACaa > 1:9514828/1‑140 (MQ=255) gATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGt < 1:1678191/140‑1 (MQ=255) gATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGt > 2:6507859/1‑140 (MQ=255) aatcaatAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATcc > 2:2072235/1‑140 (MQ=255) tcaatAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAg < 2:10702740/97‑1 (MQ=255) tcaatAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATg < 1:4443422/120‑1 (MQ=255) tcaatAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATccac > 2:11476172/1‑140 (MQ=255) tcaatAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATccac > 1:2074757/1‑140 (MQ=255) aatAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATAttt < 1:3503091/66‑1 (MQ=255) tACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCa < 1:5751162/111‑1 (MQ=255) tACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACg > 1:10780790/1‑140 (MQ=255) aCTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACgg > 2:8224932/1‑140 (MQ=255) aCTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACgg > 1:11539697/1‑140 (MQ=255) cTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTa < 2:288297/65‑1 (MQ=255) tGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGaa > 1:10636405/1‑140 (MQ=255) ggCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGaaa < 1:6585918/140‑1 (MQ=255) ggCGTATTTGAAGACAATATAATTATGTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAACATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAAGAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCNACCACAACGGaaa < 1:10012034/140‑1 (MQ=255) gCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTcc < 2:7467184/47‑1 (MQ=255) gTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCGCAACGGAAAGct < 1:9916685/140‑1 (MQ=255) gTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGct > 1:9752532/1‑140 (MQ=255) tttGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCa > 2:2579941/1‑101 (MQ=255) tttGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCa < 1:2611470/101‑1 (MQ=255) tttGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCtt > 1:5278349/1‑140 (MQ=255) aGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTc > 2:9314436/1‑140 (MQ=255) gACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAacac > 2:8977761/1‑72 (MQ=255) gACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTcc > 1:2830303/1‑140 (MQ=255) aCAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCg < 2:4300134/140‑1 (MQ=255) aaTATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCa > 1:9039038/1‑140 (MQ=255) aaTATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCACTAATATTTACTTTAAGGGATATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAAAGGAAAGCTCTTTTTTCCGCa < 2:7602299/140‑1 (MQ=255) tataATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATg < 2:1189500/140‑1 (MQ=255) tataATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATg > 2:10417935/1‑140 (MQ=255) tataATTATTTCTGGATACTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATg > 1:7740987/1‑140 (MQ=255) taATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGc < 1:1929479/140‑1 (MQ=255) taATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGc < 1:127217/140‑1 (MQ=255) taATTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGc < 2:9752531/140‑1 (MQ=255) aaTTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCt < 1:3204437/140‑1 (MQ=255) aaTTATTTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCt < 1:3377707/140‑1 (MQ=255) attattTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCtt < 1:7821791/140‑1 (MQ=255) ttattTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACgg > 2:6448297/1‑115 (MQ=255) ttattTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACgg < 1:6448298/115‑1 (MQ=255) tattTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTgg < 2:4553692/140‑1 (MQ=255) attTCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGa < 2:9139785/140‑1 (MQ=255) tttCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGt > 2:6087813/1‑96 (MQ=255) tttCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGt < 1:6087814/96‑1 (MQ=255) tttCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGat < 2:5736710/140‑1 (MQ=255) tttCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGat < 1:11381235/140‑1 (MQ=255) tttCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGat < 2:3354883/140‑1 (MQ=255) tttCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGat < 2:3456942/140‑1 (MQ=255) tgtCTGGATTTTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTTGAATTACACAGGATACTAATATGTCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGat < 1:4799935/138‑1 (MQ=255) tgtCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGat < 1:4670785/138‑1 (MQ=255) tCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGatat > 2:863582/1‑140 (MQ=255) tCTGGATATTGTTGAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGatat > 2:5615043/1‑140 (MQ=255) ttgttgAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCt > 1:3714823/1‑125 (MQ=255) ttgttgAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCt < 2:3714822/125‑1 (MQ=255) gttgAGGCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGt > 1:6276626/1‑84 (MQ=255) gaggCTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGTATTTGATGGCt < 1:7567604/140‑1 (MQ=255) | GGTATCAGTTTTATCTTTCATAGAGTGAAATATGTTAAGAAGAAATGGAGGAAAAGATTGTACTGATTAGGTATTGATAACAATCAATAGTACTGGCGTATTTGAAGACAATATAATTATTTCTGGATATTGTTGAGACTCCCTAATATTTACTTTAAGGGCTATATTAGAATAACACAGGAAACAAATATGGCAACAGCATGGTATAAACAAGTTAATCCACCACAACGGAAAGCTCTTTTTTCCGCATGGCTTGGATATGTATTTGATGGCT > NZ_CP025268/4505784‑4506057 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |